MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_017278	CCT	2	6	1799682	1799687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440183
45002	NC_017278	GCCACG	2	12	1799741	1799752	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384440183
45003	NC_017278	CGGCCC	2	12	1799754	1799765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440183
45004	NC_017278	C	7	7	1799796	1799802	0 %	0 %	0 %	100 %	384440183
45005	NC_017278	AGG	2	6	1799813	1799818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440183
45006	NC_017278	GGC	2	6	1799853	1799858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440183
45007	NC_017278	C	6	6	1799893	1799898	0 %	0 %	0 %	100 %	384440183
45008	NC_017278	GAG	2	6	1799920	1799925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440183
45009	NC_017278	GAG	2	6	1799944	1799949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440183
45010	NC_017278	G	6	6	1799967	1799972	0 %	0 %	100 %	0 %	384440183
45011	NC_017278	CTT	2	6	1799998	1800003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440183
45012	NC_017278	CCCG	2	8	1800080	1800087	0 %	0 %	25 %	75 %	384440183
45013	NC_017278	TCC	2	6	1800095	1800100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440183
45014	NC_017278	ATC	2	6	1800122	1800127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440183
45015	NC_017278	AGG	2	6	1800147	1800152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440183
45016	NC_017278	CCA	2	6	1800171	1800176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440183
45017	NC_017278	CGG	2	6	1800246	1800251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440183
45018	NC_017278	CCTCGG	2	12	1800252	1800263	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384440183
45019	NC_017278	GGCCAG	2	12	1800359	1800370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440184
45020	NC_017278	AGG	3	9	1800384	1800392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440184
45021	NC_017278	GGT	2	6	1800421	1800426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440184
45022	NC_017278	CCG	2	6	1800457	1800462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440184
45023	NC_017278	CAC	2	6	1800464	1800469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440184
45024	NC_017278	CCG	2	6	1800476	1800481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440184
45025	NC_017278	GAT	2	6	1800491	1800496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440184
45026	NC_017278	CCCT	2	8	1800531	1800538	0 %	25 %	0 %	75 %	384440184
45027	NC_017278	CAT	2	6	1800572	1800577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440184
45028	NC_017278	AGG	2	6	1800585	1800590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440184
45029	NC_017278	AGG	2	6	1800600	1800605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440184
45030	NC_017278	C	7	7	1800620	1800626	0 %	0 %	0 %	100 %	384440184
45031	NC_017278	AGG	2	6	1800636	1800641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440184
45032	NC_017278	CCA	2	6	1800655	1800660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440184
45033	NC_017278	ACC	2	6	1800693	1800698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440184
45034	NC_017278	AGG	2	6	1800699	1800704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440184
45035	NC_017278	TGG	2	6	1800721	1800726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440184
45036	NC_017278	GAA	2	6	1800740	1800745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440184
45037	NC_017278	AGG	2	6	1800827	1800832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45038	NC_017278	AGG	2	6	1800836	1800841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45039	NC_017278	CAC	2	6	1800925	1800930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440185
45040	NC_017278	CCA	2	6	1800978	1800983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440185
45041	NC_017278	GGCAG	2	10	1801047	1801056	20 %	0 %	60 %	20 %	384440185
45042	NC_017278	CAC	2	6	1801060	1801065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440185
45043	NC_017278	GCC	2	6	1801085	1801090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440185
45044	NC_017278	AGG	2	6	1801091	1801096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45045	NC_017278	CTC	2	6	1801156	1801161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45046	NC_017278	TCC	2	6	1801166	1801171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45047	NC_017278	AGG	2	6	1801217	1801222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45048	NC_017278	GCC	2	6	1801266	1801271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440185
45049	NC_017278	CCG	2	6	1801311	1801316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440185
45050	NC_017278	GGAG	2	8	1801347	1801354	25 %	0 %	75 %	0 %	384440185
45051	NC_017278	AGG	2	6	1801355	1801360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45052	NC_017278	TGGG	2	8	1801376	1801383	0 %	25 %	75 %	0 %	384440185
45053	NC_017278	TCC	2	6	1801388	1801393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45054	NC_017278	GAAGAC	2	12	1801417	1801428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384440185
45055	NC_017278	GGC	2	6	1801447	1801452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440185
45056	NC_017278	GGGCG	2	10	1801461	1801470	0 %	0 %	80 %	20 %	384440185
45057	NC_017278	C	6	6	1801516	1801521	0 %	0 %	0 %	100 %	384440185
45058	NC_017278	TCC	2	6	1801613	1801618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45059	NC_017278	GTT	2	6	1801636	1801641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440185
45060	NC_017278	C	6	6	1801664	1801669	0 %	0 %	0 %	100 %	384440185
45061	NC_017278	G	6	6	1801686	1801691	0 %	0 %	100 %	0 %	384440185
45062	NC_017278	GGC	2	6	1801717	1801722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440185
45063	NC_017278	G	6	6	1801768	1801773	0 %	0 %	100 %	0 %	384440185
45064	NC_017278	GGC	2	6	1801788	1801793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440185
45065	NC_017278	GGA	2	6	1801794	1801799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
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45068	NC_017278	TCC	2	6	1802117	1802122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45069	NC_017278	GGA	3	9	1802157	1802165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440185
45070	NC_017278	CCT	2	6	1802166	1802171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440185
45071	NC_017278	GTC	2	6	1802215	1802220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440185
45072	NC_017278	AGA	2	6	1802223	1802228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440185
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45077	NC_017278	AAGGG	2	10	1802516	1802525	40 %	0 %	60 %	0 %	384440185
45078	NC_017278	CGG	2	6	1802574	1802579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440185
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45082	NC_017278	CCATGG	2	12	1802667	1802678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384440185
45083	NC_017278	GGGA	2	8	1803064	1803071	25 %	0 %	75 %	0 %	384440186
45084	NC_017278	CTC	2	6	1803173	1803178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440186
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45086	NC_017278	CCA	2	6	1803226	1803231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440186
45087	NC_017278	AGCC	2	8	1803273	1803280	25 %	0 %	25 %	50 %	384440186
45088	NC_017278	CTC	2	6	1803281	1803286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440186
45089	NC_017278	GAG	2	6	1803293	1803298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440186
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45097	NC_017278	ACC	2	6	1803648	1803653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440186
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45100	NC_017278	CCGGG	2	10	1803782	1803791	0 %	0 %	60 %	40 %	384440186
45101	NC_017278	GGA	2	6	1803802	1803807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440186
45102	NC_017278	CCT	2	6	1803820	1803825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440186
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45105	NC_017278	CCT	2	6	1803928	1803933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440186
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45107	NC_017278	TGA	2	6	1803967	1803972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440186
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45113	NC_017278	CTC	2	6	1804229	1804234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440186
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45115	NC_017278	CCA	2	6	1804270	1804275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440186
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45467	NC_017278	G	6	6	1817631	1817636	0 %	0 %	100 %	0 %	384440199
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45472	NC_017278	CCT	2	6	1817803	1817808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440199
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