MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017278	TGC	2	6	171802	171807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438557
4002	NC_017278	CTG	2	6	171816	171821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438557
4003	NC_017278	CCCA	2	8	171864	171871	25 %	0 %	0 %	75 %	384438557
4004	NC_017278	CTG	2	6	171885	171890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438557
4005	NC_017278	CACGG	2	10	171914	171923	20 %	0 %	40 %	40 %	384438557
4006	NC_017278	GAGC	2	8	171947	171954	25 %	0 %	50 %	25 %	384438557
4007	NC_017278	GGC	2	6	172041	172046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438557
4008	NC_017278	CTG	2	6	172146	172151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438557
4009	NC_017278	CGG	2	6	172203	172208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438557
4010	NC_017278	GCC	2	6	172266	172271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438557
4011	NC_017278	G	6	6	172282	172287	0 %	0 %	100 %	0 %	384438557
4012	NC_017278	CCT	2	6	172307	172312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438557
4013	NC_017278	GGA	2	6	172316	172321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438557
4014	NC_017278	CCA	2	6	172337	172342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438557
4015	NC_017278	GGC	2	6	172385	172390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438557
4016	NC_017278	CTC	2	6	172419	172424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438557
4017	NC_017278	AGG	2	6	172483	172488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438557
4018	NC_017278	C	6	6	172511	172516	0 %	0 %	0 %	100 %	384438557
4019	NC_017278	AGC	2	6	172589	172594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438557
4020	NC_017278	G	6	6	172672	172677	0 %	0 %	100 %	0 %	384438558
4021	NC_017278	GAG	2	6	172691	172696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438558
4022	NC_017278	CTT	2	6	172799	172804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438558
4023	NC_017278	CTA	2	6	172832	172837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438558
4024	NC_017278	ACC	2	6	172854	172859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438558
4025	NC_017278	CCG	2	6	172934	172939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438558
4026	NC_017278	TGG	2	6	172942	172947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438558
4027	NC_017278	CGC	2	6	172976	172981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438558
4028	NC_017278	GTCA	2	8	172986	172993	25 %	25 %	25 %	25 %	384438558
4029	NC_017278	GGC	2	6	173000	173005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438558
4030	NC_017278	GACG	2	8	173063	173070	25 %	0 %	50 %	25 %	384438558
4031	NC_017278	GGC	2	6	173081	173086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438558
4032	NC_017278	GAG	2	6	173115	173120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438558
4033	NC_017278	TGGGA	2	10	173272	173281	20 %	20 %	60 %	0 %	384438558
4034	NC_017278	GCG	2	6	173315	173320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438558
4035	NC_017278	TCA	2	6	173332	173337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438558
4036	NC_017278	GTG	2	6	173406	173411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438558
4037	NC_017278	CTG	2	6	173460	173465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438558
4038	NC_017278	GGA	2	6	173468	173473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438558
4039	NC_017278	GAA	2	6	173505	173510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438558
4040	NC_017278	GGA	2	6	173525	173530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438558
4041	NC_017278	GCC	2	6	173538	173543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438558
4042	NC_017278	GTG	2	6	173565	173570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438558
4043	NC_017278	GCG	2	6	173681	173686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438558
4044	NC_017278	CTT	2	6	173739	173744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438558
4045	NC_017278	AGG	2	6	173812	173817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438558
4046	NC_017278	C	6	6	173848	173853	0 %	0 %	0 %	100 %	384438558
4047	NC_017278	GCGG	2	8	173963	173970	0 %	0 %	75 %	25 %	384438559
4048	NC_017278	AGG	2	6	174066	174071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
4049	NC_017278	CCTG	2	8	174086	174093	0 %	25 %	25 %	50 %	384438559
4050	NC_017278	GAG	2	6	174197	174202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
4051	NC_017278	GTG	2	6	174204	174209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438559
4052	NC_017278	GAT	2	6	174213	174218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438559
4053	NC_017278	GGC	2	6	174251	174256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4054	NC_017278	TGG	2	6	174304	174309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438559
4055	NC_017278	GGA	2	6	174320	174325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
4056	NC_017278	AGG	2	6	174368	174373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
4057	NC_017278	GACC	2	8	174410	174417	25 %	0 %	25 %	50 %	384438559
4058	NC_017278	CTC	2	6	174446	174451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438559
4059	NC_017278	TTGT	2	8	174504	174511	0 %	75 %	25 %	0 %	384438559
4060	NC_017278	ACC	2	6	174594	174599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438559
4061	NC_017278	CTGCCC	2	12	174612	174623	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384438559
4062	NC_017278	GGC	2	6	174646	174651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4063	NC_017278	CGG	2	6	174678	174683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4064	NC_017278	GGC	2	6	174692	174697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4065	NC_017278	G	6	6	174736	174741	0 %	0 %	100 %	0 %	384438559
4066	NC_017278	GCC	2	6	174792	174797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
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4068	NC_017278	GCG	2	6	174848	174853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4069	NC_017278	GCCCG	2	10	174937	174946	0 %	0 %	40 %	60 %	384438559
4070	NC_017278	AGG	2	6	174982	174987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
4071	NC_017278	GCC	2	6	175209	175214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
4072	NC_017278	GGCTG	2	10	175231	175240	0 %	20 %	60 %	20 %	384438559
4073	NC_017278	CAC	2	6	175248	175253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438559
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4076	NC_017278	GCC	2	6	175389	175394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
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4078	NC_017278	GCCG	2	8	175427	175434	0 %	0 %	50 %	50 %	384438559
4079	NC_017278	GCC	2	6	175500	175505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
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4083	NC_017278	AGG	2	6	175618	175623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438559
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4087	NC_017278	AAC	2	6	175818	175823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438559
4088	NC_017278	G	6	6	175846	175851	0 %	0 %	100 %	0 %	384438559
4089	NC_017278	GGT	2	6	175937	175942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438559
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4092	NC_017278	CCG	2	6	175975	175980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
4093	NC_017278	CGG	2	6	175986	175991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4094	NC_017278	GGC	2	6	176000	176005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4095	NC_017278	GCC	2	6	176038	176043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438559
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4097	NC_017278	CTGGC	2	10	176187	176196	0 %	20 %	40 %	40 %	384438559
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4101	NC_017278	CGG	2	6	176407	176412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438559
4102	NC_017278	AGC	2	6	176449	176454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438559
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4104	NC_017278	GAA	2	6	176699	176704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438560
4105	NC_017278	ACCC	2	8	176747	176754	25 %	0 %	0 %	75 %	384438560
4106	NC_017278	TGG	2	6	176814	176819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438560
4107	NC_017278	GCC	2	6	176831	176836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438560
4108	NC_017278	CGGT	2	8	176947	176954	0 %	25 %	50 %	25 %	384438561
4109	NC_017278	AGG	2	6	176981	176986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438561
4110	NC_017278	AGG	2	6	177164	177169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438561
4111	NC_017278	GGT	2	6	177194	177199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438561
4112	NC_017278	GGC	2	6	177212	177217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438561
4113	NC_017278	GC	3	6	177224	177229	0 %	0 %	50 %	50 %	384438561
4114	NC_017278	GGA	2	6	177254	177259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438561
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4116	NC_017278	TGGGG	2	10	177348	177357	0 %	20 %	80 %	0 %	384438561
4117	NC_017278	C	7	7	177470	177476	0 %	0 %	0 %	100 %	384438561
4118	NC_017278	CAGC	2	8	177521	177528	25 %	0 %	25 %	50 %	384438561
4119	NC_017278	GGA	2	6	177590	177595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438561
4120	NC_017278	AAT	2	6	177714	177719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384438561
4121	NC_017278	TGG	2	6	177787	177792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438561
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4123	NC_017278	AGCA	2	8	177804	177811	50 %	0 %	25 %	25 %	384438561
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4492	NC_017278	GGGC	2	8	195373	195380	0 %	0 %	75 %	25 %	384438574
4493	NC_017278	G	6	6	195444	195449	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4494	NC_017278	G	6	6	195477	195482	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4495	NC_017278	GCC	2	6	195525	195530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438574
4496	NC_017278	G	6	6	195667	195672	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4497	NC_017278	CCT	2	6	195698	195703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4498	NC_017278	CCT	2	6	195745	195750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4499	NC_017278	C	6	6	195768	195773	0 %	0 %	0 %	100 %	384438574
4500	NC_017278	ACCCTG	2	12	195789	195800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438574

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