MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_017278	GCGGA	2	10	1649647	1649656	20 %	0 %	60 %	20 %	384440041
41502	NC_017278	CGCC	2	8	1649658	1649665	0 %	0 %	25 %	75 %	384440041
41503	NC_017278	GAGC	2	8	1649676	1649683	25 %	0 %	50 %	25 %	384440041
41504	NC_017278	GCG	2	6	1649697	1649702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440041
41505	NC_017278	G	6	6	1649702	1649707	0 %	0 %	100 %	0 %	384440041
41506	NC_017278	ACC	2	6	1649708	1649713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440041
41507	NC_017278	TCT	2	6	1649810	1649815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440041
41508	NC_017278	GAGG	3	12	1649830	1649841	25 %	0 %	75 %	0 %	384440041
41509	NC_017278	CCG	2	6	1649859	1649864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440041
41510	NC_017278	GGGC	2	8	1649876	1649883	0 %	0 %	75 %	25 %	384440041
41511	NC_017278	ACG	2	6	1649885	1649890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440041
41512	NC_017278	GGA	2	6	1649904	1649909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440041
41513	NC_017278	CCG	2	6	1649919	1649924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440041
41514	NC_017278	CCT	3	9	1649961	1649969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440041
41515	NC_017278	GCGG	2	8	1650018	1650025	0 %	0 %	75 %	25 %	384440041
41516	NC_017278	TGG	2	6	1650041	1650046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440041
41517	NC_017278	GAG	2	6	1650061	1650066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440041
41518	NC_017278	TCA	2	6	1650071	1650076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440041
41519	NC_017278	CACC	2	8	1650108	1650115	25 %	0 %	0 %	75 %	384440041
41520	NC_017278	CTC	2	6	1650127	1650132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440041
41521	NC_017278	CCA	2	6	1650153	1650158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440041
41522	NC_017278	CGG	3	9	1650241	1650249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440041
41523	NC_017278	G	6	6	1650268	1650273	0 %	0 %	100 %	0 %	384440041
41524	NC_017278	C	6	6	1650293	1650298	0 %	0 %	0 %	100 %	384440041
41525	NC_017278	GGA	2	6	1650300	1650305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440041
41526	NC_017278	GGC	2	6	1650336	1650341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440041
41527	NC_017278	GGC	2	6	1650354	1650359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440041
41528	NC_017278	GCGCC	2	10	1650480	1650489	0 %	0 %	40 %	60 %	384440042
41529	NC_017278	CCA	2	6	1650504	1650509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440042
41530	NC_017278	C	8	8	1650621	1650628	0 %	0 %	0 %	100 %	384440042
41531	NC_017278	GGCCCT	2	12	1650630	1650641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384440042
41532	NC_017278	C	6	6	1650667	1650672	0 %	0 %	0 %	100 %	384440042
41533	NC_017278	GGA	2	6	1650678	1650683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41534	NC_017278	G	7	7	1650696	1650702	0 %	0 %	100 %	0 %	384440042
41535	NC_017278	GGA	2	6	1650726	1650731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41536	NC_017278	C	6	6	1650761	1650766	0 %	0 %	0 %	100 %	384440042
41537	NC_017278	CAA	2	6	1650816	1650821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440042
41538	NC_017278	CGGG	2	8	1650891	1650898	0 %	0 %	75 %	25 %	384440042
41539	NC_017278	GGTCCT	2	12	1650900	1650911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440042
41540	NC_017278	GCC	2	6	1650932	1650937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440042
41541	NC_017278	GGC	2	6	1650939	1650944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440042
41542	NC_017278	GCCTG	2	10	1650974	1650983	0 %	20 %	40 %	40 %	384440042
41543	NC_017278	CGGGC	2	10	1651013	1651022	0 %	0 %	60 %	40 %	384440042
41544	NC_017278	TCC	2	6	1651082	1651087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440042
41545	NC_017278	G	6	6	1651100	1651105	0 %	0 %	100 %	0 %	384440042
41546	NC_017278	GAG	2	6	1651114	1651119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41547	NC_017278	TCC	2	6	1651130	1651135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440042
41548	NC_017278	CCT	2	6	1651179	1651184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440042
41549	NC_017278	CTA	2	6	1651374	1651379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440042
41550	NC_017278	GGA	2	6	1651701	1651706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41551	NC_017278	AGG	3	9	1651763	1651771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41552	NC_017278	TGG	2	6	1651781	1651786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440042
41553	NC_017278	CCTTT	2	10	1651860	1651869	0 %	60 %	0 %	40 %	384440042
41554	NC_017278	ACGCCC	2	12	1651898	1651909	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440042
41555	NC_017278	GCCCTC	2	12	1651999	1652010	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384440042
41556	NC_017278	GCC	2	6	1652038	1652043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440042
41557	NC_017278	GAG	2	6	1652044	1652049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440042
41558	NC_017278	GCC	3	9	1652089	1652097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440042
41559	NC_017278	CTA	2	6	1652106	1652111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440042
41560	NC_017278	AAGG	2	8	1652119	1652126	50 %	0 %	50 %	0 %	384440042
41561	NC_017278	G	6	6	1652125	1652130	0 %	0 %	100 %	0 %	384440042
41562	NC_017278	GCC	2	6	1652134	1652139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440042
41563	NC_017278	GCCTGG	2	12	1652180	1652191	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384440042
41564	NC_017278	CCT	2	6	1652229	1652234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440042
41565	NC_017278	CCT	2	6	1652272	1652277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440043
41566	NC_017278	TCC	2	6	1652292	1652297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440043
41567	NC_017278	GAG	2	6	1652330	1652335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440043
41568	NC_017278	GGT	2	6	1652374	1652379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
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41570	NC_017278	G	8	8	1652407	1652414	0 %	0 %	100 %	0 %	384440043
41571	NC_017278	GGT	2	6	1652419	1652424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
41572	NC_017278	GTG	2	6	1652456	1652461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
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41578	NC_017278	TGG	2	6	1652661	1652666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
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41582	NC_017278	GTG	2	6	1652852	1652857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
41583	NC_017278	GTG	2	6	1652864	1652869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
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41585	NC_017278	G	7	7	1652887	1652893	0 %	0 %	100 %	0 %	384440043
41586	NC_017278	TGG	2	6	1652919	1652924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440043
41587	NC_017278	C	6	6	1653007	1653012	0 %	0 %	0 %	100 %	384440043
41588	NC_017278	TCC	2	6	1653015	1653020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440043
41589	NC_017278	GCGG	2	8	1653022	1653029	0 %	0 %	75 %	25 %	384440043
41590	NC_017278	CAC	3	9	1653037	1653045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440043
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41593	NC_017278	CGG	2	6	1653084	1653089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440043
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41595	NC_017278	G	6	6	1653105	1653110	0 %	0 %	100 %	0 %	384440043
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41599	NC_017278	ACCCTG	2	12	1653278	1653289	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384440043
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41601	NC_017278	ACC	2	6	1653397	1653402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440044
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41608	NC_017278	G	7	7	1653580	1653586	0 %	0 %	100 %	0 %	384440044
41609	NC_017278	TGG	2	6	1653587	1653592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440044
41610	NC_017278	C	6	6	1653696	1653701	0 %	0 %	0 %	100 %	384440044
41611	NC_017278	GGC	2	6	1653767	1653772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440044
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41614	NC_017278	TCC	2	6	1653863	1653868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440044
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