MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017278	CTT	2	6	150796	150801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438532
3502	NC_017278	CCTTGT	2	12	150844	150855	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384438532
3503	NC_017278	CTC	2	6	150876	150881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438532
3504	NC_017278	GCCTG	2	10	150892	150901	0 %	20 %	40 %	40 %	384438532
3505	NC_017278	GGGA	2	8	150911	150918	25 %	0 %	75 %	0 %	384438532
3506	NC_017278	C	6	6	150963	150968	0 %	0 %	0 %	100 %	384438532
3507	NC_017278	GAA	2	6	150989	150994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438532
3508	NC_017278	CCT	2	6	151081	151086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438532
3509	NC_017278	GCA	2	6	151102	151107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438532
3510	NC_017278	AGA	2	6	151228	151233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438533
3511	NC_017278	GCC	2	6	151300	151305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438533
3512	NC_017278	CCTCCC	2	12	151312	151323	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384438533
3513	NC_017278	CCA	2	6	151336	151341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438533
3514	NC_017278	GCT	2	6	151384	151389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438533
3515	NC_017278	GGCG	2	8	151393	151400	0 %	0 %	75 %	25 %	384438533
3516	NC_017278	TGA	2	6	151423	151428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438533
3517	NC_017278	CTG	2	6	151439	151444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438533
3518	NC_017278	AGG	2	6	151466	151471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438534
3519	NC_017278	GGA	2	6	151473	151478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438534
3520	NC_017278	AGG	2	6	151523	151528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438534
3521	NC_017278	CTT	2	6	151546	151551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438534
3522	NC_017278	GAG	2	6	151765	151770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438535
3523	NC_017278	CTC	2	6	151798	151803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438535
3524	NC_017278	GGTTT	2	10	151886	151895	0 %	60 %	40 %	0 %	384438536
3525	NC_017278	TGCT	2	8	151927	151934	0 %	50 %	25 %	25 %	384438536
3526	NC_017278	AGG	2	6	151950	151955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438536
3527	NC_017278	CTG	2	6	152149	152154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438536
3528	NC_017278	CCT	2	6	152585	152590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3529	NC_017278	CT	3	6	152611	152616	0 %	50 %	0 %	50 %	384438537
3530	NC_017278	GCC	2	6	152638	152643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438537
3531	NC_017278	CCT	2	6	152645	152650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3532	NC_017278	GGGGC	2	10	152668	152677	0 %	0 %	80 %	20 %	384438537
3533	NC_017278	CCGCAC	2	12	152691	152702	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384438537
3534	NC_017278	GGCC	2	8	152723	152730	0 %	0 %	50 %	50 %	384438537
3535	NC_017278	AGG	2	6	152743	152748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3536	NC_017278	CTT	2	6	152775	152780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438537
3537	NC_017278	CTC	2	6	152814	152819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3538	NC_017278	G	6	6	152839	152844	0 %	0 %	100 %	0 %	384438537
3539	NC_017278	GGA	2	6	152849	152854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3540	NC_017278	AGG	2	6	152899	152904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3541	NC_017278	AGG	2	6	152992	152997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3542	NC_017278	CAC	2	6	153000	153005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438537
3543	NC_017278	CTC	2	6	153006	153011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3544	NC_017278	AGG	2	6	153037	153042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3545	NC_017278	TCC	2	6	153079	153084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3546	NC_017278	TCT	2	6	153122	153127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438537
3547	NC_017278	ACC	2	6	153142	153147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438537
3548	NC_017278	GCC	2	6	153178	153183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438537
3549	NC_017278	GAT	2	6	153204	153209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438537
3550	NC_017278	AGG	2	6	153241	153246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3551	NC_017278	AGG	2	6	153293	153298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438537
3552	NC_017278	GCG	2	6	153309	153314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438537
3553	NC_017278	CCT	2	6	153377	153382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438537
3554	NC_017278	CCA	2	6	153383	153388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438537
3555	NC_017278	AGG	2	6	153453	153458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3556	NC_017278	TCC	2	6	153480	153485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438538
3557	NC_017278	CCT	2	6	153490	153495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438538
3558	NC_017278	CGG	2	6	153502	153507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438538
3559	NC_017278	CTC	2	6	153524	153529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438538
3560	NC_017278	CCT	2	6	153586	153591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438538
3561	NC_017278	GGA	2	6	153610	153615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3562	NC_017278	CGT	2	6	153640	153645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438538
3563	NC_017278	TGG	2	6	153649	153654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438538
3564	NC_017278	GAT	2	6	153668	153673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438538
3565	NC_017278	ACC	2	6	153744	153749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438538
3566	NC_017278	AGG	2	6	153795	153800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3567	NC_017278	GGC	2	6	153815	153820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438538
3568	NC_017278	AGG	2	6	153841	153846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3569	NC_017278	GGAG	2	8	153847	153854	25 %	0 %	75 %	0 %	384438538
3570	NC_017278	CCA	2	6	153856	153861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438538
3571	NC_017278	CGC	2	6	153882	153887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438538
3572	NC_017278	CAGGGC	2	12	153902	153913	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438538
3573	NC_017278	TCCAGC	2	12	153930	153941	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438538
3574	NC_017278	CCGG	2	8	153994	154001	0 %	0 %	50 %	50 %	384438538
3575	NC_017278	AGG	2	6	154035	154040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3576	NC_017278	TCG	2	6	154047	154052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438538
3577	NC_017278	CCAG	2	8	154075	154082	25 %	0 %	25 %	50 %	384438538
3578	NC_017278	CCA	2	6	154111	154116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438538
3579	NC_017278	GGA	2	6	154117	154122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438538
3580	NC_017278	TGCC	2	8	154177	154184	0 %	25 %	25 %	50 %	384438538
3581	NC_017278	CCA	2	6	154237	154242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438538
3582	NC_017278	AGT	2	6	154258	154263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438538
3583	NC_017278	GGC	2	6	154285	154290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438538
3584	NC_017278	CGC	2	6	154335	154340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438538
3585	NC_017278	GAT	2	6	154487	154492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438539
3586	NC_017278	CGC	2	6	154500	154505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438539
3587	NC_017278	GGT	3	9	154544	154552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438539
3588	NC_017278	ACC	2	6	154581	154586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438539
3589	NC_017278	G	6	6	154612	154617	0 %	0 %	100 %	0 %	384438539
3590	NC_017278	ACCTGG	2	12	154624	154635	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384438539
3591	NC_017278	GCC	2	6	154696	154701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438539
3592	NC_017278	TCC	2	6	154747	154752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438539
3593	NC_017278	TGG	2	6	154759	154764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438539
3594	NC_017278	GCG	2	6	154772	154777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438539
3595	NC_017278	CTCGG	2	10	154806	154815	0 %	20 %	40 %	40 %	384438539
3596	NC_017278	G	6	6	154884	154889	0 %	0 %	100 %	0 %	384438539
3597	NC_017278	AGC	2	6	154923	154928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438539
3598	NC_017278	C	6	6	154928	154933	0 %	0 %	0 %	100 %	384438539
3599	NC_017278	CA	3	6	154950	154955	50 %	0 %	0 %	50 %	384438539
3600	NC_017278	TGG	2	6	155964	155969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438540
3601	NC_017278	CTC	3	9	156000	156008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438540
3602	NC_017278	GTG	2	6	156132	156137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438540
3603	NC_017278	GGC	2	6	156191	156196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438540
3604	NC_017278	CCGGG	2	10	156200	156209	0 %	0 %	60 %	40 %	384438540
3605	NC_017278	CCG	2	6	156224	156229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438540
3606	NC_017278	GAG	2	6	156276	156281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438540
3607	NC_017278	GGA	2	6	156284	156289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438540
3608	NC_017278	GCG	2	6	156302	156307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438540
3609	NC_017278	CGG	2	6	156345	156350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438540
3610	NC_017278	GAG	2	6	156381	156386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438540
3611	NC_017278	GGGC	2	8	156387	156394	0 %	0 %	75 %	25 %	384438540
3612	NC_017278	GGCCCT	2	12	156407	156418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438540
3613	NC_017278	G	8	8	156419	156426	0 %	0 %	100 %	0 %	384438540
3614	NC_017278	CCT	2	6	156456	156461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438540
3615	NC_017278	CCT	2	6	156515	156520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438540
3616	NC_017278	CCT	2	6	156587	156592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438540
3617	NC_017278	GGC	2	6	156600	156605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438540
3618	NC_017278	AGG	2	6	156652	156657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438540
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3620	NC_017278	CTT	2	6	156722	156727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438540
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