MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017278	TCT	2	6	109407	109412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438496
2502	NC_017278	CCG	2	6	109438	109443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438496
2503	NC_017278	GGA	2	6	109474	109479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438496
2504	NC_017278	CCT	2	6	109555	109560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438496
2505	NC_017278	CCT	2	6	109567	109572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438496
2506	NC_017278	GGA	2	6	109609	109614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438496
2507	NC_017278	TCC	2	6	109695	109700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438496
2508	NC_017278	GCC	2	6	109746	109751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438496
2509	NC_017278	GGGGCG	2	12	109772	109783	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384438496
2510	NC_017278	ACT	2	6	109800	109805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438496
2511	NC_017278	TCC	2	6	109812	109817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438496
2512	NC_017278	CTG	2	6	109823	109828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438496
2513	NC_017278	G	7	7	109832	109838	0 %	0 %	100 %	0 %	384438496
2514	NC_017278	GGC	2	6	109844	109849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438496
2515	NC_017278	ACC	2	6	109893	109898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438496
2516	NC_017278	CCTCC	2	10	109912	109921	0 %	20 %	0 %	80 %	384438496
2517	NC_017278	CCGGGG	2	12	109946	109957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438496
2518	NC_017278	CCT	2	6	110055	110060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438496
2519	NC_017278	GAT	2	6	110098	110103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438496
2520	NC_017278	G	6	6	110114	110119	0 %	0 %	100 %	0 %	384438496
2521	NC_017278	CTA	2	6	110125	110130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438496
2522	NC_017278	GGCCG	2	10	110227	110236	0 %	0 %	60 %	40 %	384438497
2523	NC_017278	GCG	2	6	110251	110256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438497
2524	NC_017278	TGG	2	6	110270	110275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438497
2525	NC_017278	GAG	3	9	110287	110295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438497
2526	NC_017278	CGAGGC	2	12	110322	110333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438497
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2529	NC_017278	CGC	2	6	110448	110453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438497
2530	NC_017278	TGG	2	6	110522	110527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438497
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2532	NC_017278	GCC	2	6	110584	110589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438497
2533	NC_017278	CGC	2	6	110616	110621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438497
2534	NC_017278	GCC	2	6	110629	110634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438497
2535	NC_017278	CCCTGG	2	12	110654	110665	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438497
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2539	NC_017278	GGC	2	6	110792	110797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438497
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2543	NC_017278	GGA	2	6	110835	110840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438497
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2545	NC_017278	G	6	6	110878	110883	0 %	0 %	100 %	0 %	384438497
2546	NC_017278	CGGT	2	8	110884	110891	0 %	25 %	50 %	25 %	384438497
2547	NC_017278	C	7	7	110898	110904	0 %	0 %	0 %	100 %	384438497
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2551	NC_017278	CCTGGC	2	12	111119	111130	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438498
2552	NC_017278	ACGG	2	8	111165	111172	25 %	0 %	50 %	25 %	384438498
2553	NC_017278	CTGG	2	8	111185	111192	0 %	25 %	50 %	25 %	384438498
2554	NC_017278	GCGGGT	2	12	111308	111319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438498
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2556	NC_017278	AGGA	2	8	111346	111353	50 %	0 %	50 %	0 %	384438498
2557	NC_017278	GGC	2	6	111376	111381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438498
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2559	NC_017278	G	7	7	111431	111437	0 %	0 %	100 %	0 %	384438499
2560	NC_017278	CTC	2	6	111446	111451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438499
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2570	NC_017278	GAG	2	6	111790	111795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438500
2571	NC_017278	GCGG	2	8	111819	111826	0 %	0 %	75 %	25 %	384438500
2572	NC_017278	AGGA	2	8	111841	111848	50 %	0 %	50 %	0 %	384438500
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2592	NC_017278	CTGG	2	8	112575	112582	0 %	25 %	50 %	25 %	384438500
2593	NC_017278	ACC	2	6	112592	112597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438500
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2603	NC_017278	GAG	2	6	113014	113019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438500
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2605	NC_017278	AGG	2	6	113126	113131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438500
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2608	NC_017278	CCCCA	2	10	113149	113158	20 %	0 %	0 %	80 %	384438500
2609	NC_017278	GGT	3	9	113181	113189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438500
2610	NC_017278	G	6	6	113195	113200	0 %	0 %	100 %	0 %	384438500
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2993	NC_017278	GGA	2	6	127729	127734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438516
2994	NC_017278	TGG	2	6	127746	127751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438516
2995	NC_017278	CCT	2	6	127753	127758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438516
2996	NC_017278	GAG	2	6	127769	127774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438516
2997	NC_017278	CG	3	6	127825	127830	0 %	0 %	50 %	50 %	384438516
2998	NC_017278	AGG	2	6	127839	127844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438516
2999	NC_017278	GCCCTG	2	12	127871	127882	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438516
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