MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_017278	AGC	2	6	641662	641667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439056
15502	NC_017278	TCC	2	6	641668	641673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439056
15503	NC_017278	GAAG	2	8	641698	641705	50 %	0 %	50 %	0 %	384439056
15504	NC_017278	GTG	2	6	641706	641711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439056
15505	NC_017278	G	6	6	641771	641776	0 %	0 %	100 %	0 %	384439056
15506	NC_017278	CGG	2	6	641802	641807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439056
15507	NC_017278	CCT	2	6	641827	641832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439056
15508	NC_017278	CGC	2	6	641852	641857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439056
15509	NC_017278	GCGG	2	8	641876	641883	0 %	0 %	75 %	25 %	384439056
15510	NC_017278	GTG	2	6	641895	641900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439056
15511	NC_017278	G	6	6	641926	641931	0 %	0 %	100 %	0 %	384439056
15512	NC_017278	GGT	2	6	641936	641941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439056
15513	NC_017278	GGTG	2	8	641992	641999	0 %	25 %	75 %	0 %	384439056
15514	NC_017278	GAG	2	6	642009	642014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439056
15515	NC_017278	CACCTG	2	12	642072	642083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439056
15516	NC_017278	GGA	2	6	642152	642157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15517	NC_017278	GA	3	6	642160	642165	50 %	0 %	50 %	0 %	384439057
15518	NC_017278	GTG	2	6	642174	642179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439057
15519	NC_017278	GAA	2	6	642189	642194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439057
15520	NC_017278	GGGC	2	8	642202	642209	0 %	0 %	75 %	25 %	384439057
15521	NC_017278	CCCGC	2	10	642225	642234	0 %	0 %	20 %	80 %	384439057
15522	NC_017278	CCT	2	6	642290	642295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15523	NC_017278	GGGC	2	8	642298	642305	0 %	0 %	75 %	25 %	384439057
15524	NC_017278	AGG	2	6	642310	642315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15525	NC_017278	GGGT	2	8	642348	642355	0 %	25 %	75 %	0 %	384439057
15526	NC_017278	ACC	2	6	642361	642366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439057
15527	NC_017278	GCCGC	2	10	642383	642392	0 %	0 %	40 %	60 %	384439057
15528	NC_017278	C	6	6	642404	642409	0 %	0 %	0 %	100 %	384439057
15529	NC_017278	TCC	3	9	642448	642456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15530	NC_017278	C	6	6	642455	642460	0 %	0 %	0 %	100 %	384439057
15531	NC_017278	CCT	2	6	642470	642475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15532	NC_017278	CCA	2	6	642491	642496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439057
15533	NC_017278	G	6	6	642509	642514	0 %	0 %	100 %	0 %	384439057
15534	NC_017278	GAG	3	9	642516	642524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15535	NC_017278	GAG	2	6	642528	642533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15536	NC_017278	C	7	7	642567	642573	0 %	0 %	0 %	100 %	384439057
15537	NC_017278	CCT	2	6	642590	642595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15538	NC_017278	AGG	2	6	642679	642684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15539	NC_017278	TC	3	6	642687	642692	0 %	50 %	0 %	50 %	384439057
15540	NC_017278	TCC	2	6	642710	642715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15541	NC_017278	ACC	2	6	642751	642756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439057
15542	NC_017278	CCTT	2	8	642766	642773	0 %	50 %	0 %	50 %	384439057
15543	NC_017278	GAG	2	6	642828	642833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15544	NC_017278	CCT	2	6	642869	642874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15545	NC_017278	GGA	2	6	642896	642901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15546	NC_017278	CCAGG	2	10	642912	642921	20 %	0 %	40 %	40 %	384439057
15547	NC_017278	AGG	2	6	642931	642936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15548	NC_017278	TCC	2	6	642943	642948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15549	NC_017278	GGA	2	6	642953	642958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439057
15550	NC_017278	C	6	6	642990	642995	0 %	0 %	0 %	100 %	384439057
15551	NC_017278	GGCG	2	8	643004	643011	0 %	0 %	75 %	25 %	384439057
15552	NC_017278	GCG	2	6	643018	643023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439057
15553	NC_017278	CCTT	2	8	643114	643121	0 %	50 %	0 %	50 %	384439057
15554	NC_017278	CGG	2	6	643157	643162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439057
15555	NC_017278	G	6	6	643164	643169	0 %	0 %	100 %	0 %	384439057
15556	NC_017278	GGGGGT	2	12	643172	643183	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384439057
15557	NC_017278	GCC	2	6	643193	643198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439057
15558	NC_017278	CACCTC	2	12	643206	643217	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384439057
15559	NC_017278	GCG	2	6	643239	643244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439057
15560	NC_017278	CAC	2	6	643260	643265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439057
15561	NC_017278	TCC	2	6	643303	643308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439057
15562	NC_017278	GAC	2	6	643428	643433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439058
15563	NC_017278	GTG	2	6	643491	643496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439058
15564	NC_017278	TCA	2	6	643639	643644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384439058
15565	NC_017278	CCG	2	6	643751	643756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439058
15566	NC_017278	CAT	2	6	643802	643807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384439058
15567	NC_017278	AAG	2	6	643824	643829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439058
15568	NC_017278	C	6	6	643840	643845	0 %	0 %	0 %	100 %	384439058
15569	NC_017278	TGG	2	6	643888	643893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439058
15570	NC_017278	CGC	2	6	643919	643924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439058
15571	NC_017278	AAC	2	6	643992	643997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384439058
15572	NC_017278	GCC	2	6	644007	644012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439058
15573	NC_017278	AGT	2	6	644056	644061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439058
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15575	NC_017278	GAG	2	6	644105	644110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439059
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15577	NC_017278	GCC	2	6	644129	644134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439059
15578	NC_017278	CGG	2	6	644150	644155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439059
15579	NC_017278	GGGGA	2	10	644180	644189	20 %	0 %	80 %	0 %	384439059
15580	NC_017278	CTC	2	6	644195	644200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439059
15581	NC_017278	TCC	2	6	644220	644225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439059
15582	NC_017278	C	7	7	644224	644230	0 %	0 %	0 %	100 %	384439059
15583	NC_017278	C	6	6	644234	644239	0 %	0 %	0 %	100 %	384439059
15584	NC_017278	GGCG	2	8	644241	644248	0 %	0 %	75 %	25 %	384439059
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15586	NC_017278	CTC	2	6	644303	644308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439059
15587	NC_017278	GTG	2	6	644330	644335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439059
15588	NC_017278	GAG	2	6	644354	644359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439059
15589	NC_017278	TGG	2	6	644391	644396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439059
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15591	NC_017278	GGT	3	9	644413	644421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439059
15592	NC_017278	CGG	2	6	644500	644505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439059
15593	NC_017278	G	6	6	644514	644519	0 %	0 %	100 %	0 %	384439059
15594	NC_017278	GAG	2	6	644588	644593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439059
15595	NC_017278	CCT	2	6	644686	644691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439059
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15600	NC_017278	GCC	2	6	644849	644854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439059
15601	NC_017278	GCC	2	6	644900	644905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439059
15602	NC_017278	CCCTG	2	10	644920	644929	0 %	20 %	20 %	60 %	384439059
15603	NC_017278	GAG	2	6	644969	644974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439059
15604	NC_017278	GGC	2	6	645003	645008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439059
15605	NC_017278	CTTT	2	8	645078	645085	0 %	75 %	0 %	25 %	384439060
15606	NC_017278	CCG	2	6	645087	645092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439060
15607	NC_017278	GGT	2	6	645138	645143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439060
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15609	NC_017278	CTGC	2	8	645180	645187	0 %	25 %	25 %	50 %	384439060
15610	NC_017278	CCT	3	9	645243	645251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439060
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15612	NC_017278	GCGGG	2	10	645282	645291	0 %	0 %	80 %	20 %	384439060
15613	NC_017278	G	7	7	645289	645295	0 %	0 %	100 %	0 %	384439060
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15617	NC_017278	C	6	6	645351	645356	0 %	0 %	0 %	100 %	384439060
15618	NC_017278	CCG	2	6	645371	645376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439060
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15853	NC_017278	GTAGAT	2	12	654448	654459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439067
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15859	NC_017278	AGT	2	6	654639	654644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439067
15860	NC_017278	GCC	2	6	654752	654757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439067
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15983	NC_017278	GCC	2	6	659670	659675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439072
15984	NC_017278	TGA	2	6	659720	659725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439072
15985	NC_017278	C	6	6	659776	659781	0 %	0 %	0 %	100 %	384439072
15986	NC_017278	CTC	2	6	659805	659810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439072
15987	NC_017278	TTC	2	6	659857	659862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439072
15988	NC_017278	GTT	2	6	659871	659876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384439072
15989	NC_017278	CCCG	2	8	659915	659922	0 %	0 %	25 %	75 %	384439072
15990	NC_017278	GGC	2	6	659945	659950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439072
15991	NC_017278	CAC	2	6	660054	660059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439072
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15999	NC_017278	TGGCC	2	10	660278	660287	0 %	20 %	40 %	40 %	384439072
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