MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017278	GGC	2	6	622011	622016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439034
15002	NC_017278	CAC	2	6	622070	622075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439034
15003	NC_017278	TGCGGG	2	12	622084	622095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384439034
15004	NC_017278	CCA	2	6	622144	622149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439034
15005	NC_017278	GGTGG	2	10	622170	622179	0 %	20 %	80 %	0 %	384439034
15006	NC_017278	GGA	2	6	622206	622211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439034
15007	NC_017278	CCA	2	6	622225	622230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439034
15008	NC_017278	CCA	2	6	622492	622497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439035
15009	NC_017278	GTG	2	6	622518	622523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439035
15010	NC_017278	C	6	6	622530	622535	0 %	0 %	0 %	100 %	384439035
15011	NC_017278	CCT	2	6	622600	622605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439035
15012	NC_017278	CAT	2	6	622625	622630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384439035
15013	NC_017278	GGC	2	6	622631	622636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439035
15014	NC_017278	TGG	2	6	622645	622650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439035
15015	NC_017278	GGT	2	6	622718	622723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439035
15016	NC_017278	GCC	2	6	622757	622762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384439035
15017	NC_017278	AGG	2	6	622800	622805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439035
15018	NC_017278	TGG	2	6	622807	622812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439035
15019	NC_017278	CAC	3	9	622814	622822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439035
15020	NC_017278	GAT	2	6	622871	622876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439035
15021	NC_017278	GGA	2	6	622951	622956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439035
15022	NC_017278	GGC	2	6	622993	622998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439035
15023	NC_017278	CCCG	2	8	623020	623027	0 %	0 %	25 %	75 %	384439035
15024	NC_017278	GAT	2	6	623129	623134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439035
15025	NC_017278	GGC	2	6	623149	623154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439035
15026	NC_017278	GGC	2	6	623167	623172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439035
15027	NC_017278	GGC	3	9	623206	623214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439035
15028	NC_017278	AAG	2	6	623235	623240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439035
15029	NC_017278	TGG	2	6	623263	623268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439035
15030	NC_017278	GAG	2	6	623292	623297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439035
15031	NC_017278	CGGCCT	2	12	623359	623370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384439035
15032	NC_017278	ACC	2	6	623424	623429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439035
15033	NC_017278	AGGACC	2	12	623570	623581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439036
15034	NC_017278	GGC	2	6	623610	623615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439036
15035	NC_017278	CCA	2	6	623655	623660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439036
15036	NC_017278	G	6	6	623716	623721	0 %	0 %	100 %	0 %	384439036
15037	NC_017278	CAG	2	6	623767	623772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384439036
15038	NC_017278	TCC	2	6	623807	623812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439036
15039	NC_017278	GGC	2	6	623839	623844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439036
15040	NC_017278	C	6	6	623863	623868	0 %	0 %	0 %	100 %	384439036
15041	NC_017278	AGG	2	6	623966	623971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439036
15042	NC_017278	GGCCC	2	10	623990	623999	0 %	0 %	40 %	60 %	384439036
15043	NC_017278	CGAGGG	2	12	624120	624131	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384439037
15044	NC_017278	GCG	2	6	624152	624157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439037
15045	NC_017278	CCT	2	6	624182	624187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439037
15046	NC_017278	TGG	2	6	624274	624279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439037
15047	NC_017278	CCT	2	6	624287	624292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439037
15048	NC_017278	CTTC	2	8	624296	624303	0 %	50 %	0 %	50 %	384439037
15049	NC_017278	CTT	2	6	624308	624313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439037
15050	NC_017278	GGCC	2	8	624337	624344	0 %	0 %	50 %	50 %	384439037
15051	NC_017278	GC	3	6	624384	624389	0 %	0 %	50 %	50 %	384439037
15052	NC_017278	TCC	2	6	624391	624396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439037
15053	NC_017278	GTG	2	6	624450	624455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439037
15054	NC_017278	GAG	2	6	624510	624515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439037
15055	NC_017278	TGG	2	6	624527	624532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439037
15056	NC_017278	GAG	2	6	624582	624587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439037
15057	NC_017278	TCA	2	6	624755	624760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384439037
15058	NC_017278	GTG	2	6	624772	624777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439037
15059	NC_017278	AGT	2	6	624812	624817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439037
15060	NC_017278	GTA	2	6	624825	624830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384439037
15061	NC_017278	AGA	2	6	624845	624850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439037
15062	NC_017278	C	8	8	624861	624868	0 %	0 %	0 %	100 %	384439037
15063	NC_017278	G	6	6	624881	624886	0 %	0 %	100 %	0 %	384439037
15064	NC_017278	TAA	2	6	624903	624908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384439037
15065	NC_017278	AT	3	6	624999	625004	50 %	50 %	0 %	0 %	384439037
15066	NC_017278	TGT	2	6	625008	625013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384439037
15067	NC_017278	T	7	7	625105	625111	0 %	100 %	0 %	0 %	384439037
15068	NC_017278	GAAA	2	8	625112	625119	75 %	0 %	25 %	0 %	384439037
15069	NC_017278	AT	3	6	625187	625192	50 %	50 %	0 %	0 %	384439037
15070	NC_017278	AAAAG	2	10	625207	625216	80 %	0 %	20 %	0 %	384439037
15071	NC_017278	AGA	2	6	625328	625333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439037
15072	NC_017278	A	6	6	625346	625351	100 %	0 %	0 %	0 %	384439037
15073	NC_017278	GAA	2	6	625394	625399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384439037
15074	NC_017278	CAA	2	6	625415	625420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384439037
15075	NC_017278	A	6	6	625419	625424	100 %	0 %	0 %	0 %	384439037
15076	NC_017278	AGG	2	6	625461	625466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439037
15077	NC_017278	ACC	2	6	626464	626469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439038
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15079	NC_017278	TGG	2	6	626503	626508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439038
15080	NC_017278	G	6	6	626512	626517	0 %	0 %	100 %	0 %	384439038
15081	NC_017278	GGGGA	2	10	626568	626577	20 %	0 %	80 %	0 %	384439038
15082	NC_017278	CCA	2	6	626585	626590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439038
15083	NC_017278	G	6	6	626600	626605	0 %	0 %	100 %	0 %	384439038
15084	NC_017278	GGGAG	2	10	626632	626641	20 %	0 %	80 %	0 %	384439038
15085	NC_017278	TCT	2	6	626653	626658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384439038
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15087	NC_017278	AGG	2	6	626734	626739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439038
15088	NC_017278	CCA	2	6	626811	626816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439039
15089	NC_017278	AGG	2	6	626823	626828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439039
15090	NC_017278	TCC	2	6	626891	626896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439039
15091	NC_017278	GCG	2	6	626902	626907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439039
15092	NC_017278	CCA	2	6	626919	626924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439039
15093	NC_017278	GCG	2	6	626927	626932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439039
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15096	NC_017278	CGG	3	9	627045	627053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439039
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15100	NC_017278	CCA	2	6	627258	627263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439039
15101	NC_017278	CTTC	2	8	627297	627304	0 %	50 %	0 %	50 %	384439039
15102	NC_017278	CAC	2	6	627325	627330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439039
15103	NC_017278	GAG	2	6	627337	627342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439039
15104	NC_017278	GGC	2	6	627343	627348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384439039
15105	NC_017278	T	6	6	627383	627388	0 %	100 %	0 %	0 %	384439039
15106	NC_017278	CATCCG	2	12	627412	627423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384439039
15107	NC_017278	CCA	2	6	627447	627452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439039
15108	NC_017278	TCC	2	6	627455	627460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439039
15109	NC_017278	GAG	2	6	627508	627513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439039
15110	NC_017278	CCT	2	6	627528	627533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384439040
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15112	NC_017278	GTG	2	6	627563	627568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439040
15113	NC_017278	CCCGG	2	10	627653	627662	0 %	0 %	40 %	60 %	384439040
15114	NC_017278	GTGATG	2	12	627674	627685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384439040
15115	NC_017278	CCGC	2	8	627711	627718	0 %	0 %	25 %	75 %	384439040
15116	NC_017278	CTCCAC	2	12	627724	627735	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384439040
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15119	NC_017278	CCA	2	6	627777	627782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384439040
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15121	NC_017278	GAG	3	9	627814	627822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439040
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15484	NC_017278	GGT	2	6	641079	641084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384439055
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15487	NC_017278	TTTCC	2	10	641207	641216	0 %	60 %	0 %	40 %	384439056
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15489	NC_017278	GGA	2	6	641318	641323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384439056
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15491	NC_017278	GGGC	2	8	641362	641369	0 %	0 %	75 %	25 %	384439056
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