MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017278	CCT	2	6	546123	546128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438946
13002	NC_017278	GTA	2	6	546202	546207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438946
13003	NC_017278	GCC	2	6	546233	546238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438946
13004	NC_017278	GAA	2	6	546262	546267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438946
13005	NC_017278	CAT	2	6	546294	546299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438947
13006	NC_017278	CCT	2	6	546358	546363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438947
13007	NC_017278	GCC	2	6	546434	546439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438947
13008	NC_017278	AGG	2	6	546468	546473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438947
13009	NC_017278	AGG	3	9	546528	546536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438947
13010	NC_017278	CTC	2	6	546560	546565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438947
13011	NC_017278	GAA	2	6	546605	546610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438947
13012	NC_017278	CCT	2	6	546676	546681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438947
13013	NC_017278	CCT	2	6	546697	546702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438947
13014	NC_017278	CAC	2	6	546734	546739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438947
13015	NC_017278	GGC	2	6	546770	546775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438947
13016	NC_017278	CAG	2	6	546848	546853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438947
13017	NC_017278	CAC	2	6	546893	546898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438947
13018	NC_017278	CTC	2	6	546969	546974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13019	NC_017278	C	8	8	547033	547040	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13020	NC_017278	GCC	2	6	547160	547165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438948
13021	NC_017278	C	6	6	547185	547190	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13022	NC_017278	ACC	2	6	547255	547260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438948
13023	NC_017278	GAG	2	6	547389	547394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13024	NC_017278	CCT	2	6	547520	547525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13025	NC_017278	G	6	6	547538	547543	0 %	0 %	100 %	0 %	384438948
13026	NC_017278	TCC	2	6	547546	547551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13027	NC_017278	CCT	3	9	547565	547573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13028	NC_017278	GCC	2	6	547660	547665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438948
13029	NC_017278	GAAGG	2	10	547836	547845	40 %	0 %	60 %	0 %	384438948
13030	NC_017278	GTCC	2	8	547862	547869	0 %	25 %	25 %	50 %	384438948
13031	NC_017278	TCC	2	6	547879	547884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13032	NC_017278	ACC	2	6	547885	547890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438948
13033	NC_017278	GTCCCA	2	12	547893	547904	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438948
13034	NC_017278	GGA	2	6	547970	547975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13035	NC_017278	TCC	2	6	547997	548002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13036	NC_017278	TGG	2	6	548060	548065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438948
13037	NC_017278	CTC	2	6	548181	548186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13038	NC_017278	CCT	2	6	548201	548206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13039	NC_017278	GAT	2	6	548220	548225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438948
13040	NC_017278	TGA	2	6	548276	548281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438948
13041	NC_017278	GGC	2	6	548315	548320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438948
13042	NC_017278	CCG	2	6	548396	548401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438948
13043	NC_017278	TCC	2	6	548443	548448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13044	NC_017278	CGC	2	6	548510	548515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438948
13045	NC_017278	TGG	2	6	548522	548527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438948
13046	NC_017278	CCGC	2	8	548696	548703	0 %	0 %	25 %	75 %	384438948
13047	NC_017278	GGGGGT	2	12	548744	548755	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384438948
13048	NC_017278	AGG	2	6	548911	548916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13049	NC_017278	GGT	2	6	548921	548926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438948
13050	NC_017278	C	6	6	548951	548956	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13051	NC_017278	C	6	6	548965	548970	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13052	NC_017278	CAC	2	6	548976	548981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438948
13053	NC_017278	GGA	2	6	548984	548989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13054	NC_017278	GGC	2	6	549045	549050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438948
13055	NC_017278	C	7	7	549108	549114	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13056	NC_017278	CCT	2	6	549197	549202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13057	NC_017278	GCT	2	6	549205	549210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438948
13058	NC_017278	C	7	7	549219	549225	0 %	0 %	0 %	100 %	384438948
13059	NC_017278	GTC	2	6	549228	549233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438948
13060	NC_017278	CTC	2	6	549249	549254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13061	NC_017278	AGG	2	6	549255	549260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13062	NC_017278	CGG	2	6	549309	549314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438948
13063	NC_017278	ACC	2	6	549328	549333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438948
13064	NC_017278	TCC	2	6	549358	549363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13065	NC_017278	TGG	2	6	549380	549385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438948
13066	NC_017278	G	7	7	549384	549390	0 %	0 %	100 %	0 %	384438948
13067	NC_017278	TCC	2	6	549412	549417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438948
13068	NC_017278	TGGC	2	8	549427	549434	0 %	25 %	50 %	25 %	384438948
13069	NC_017278	ATG	2	6	549559	549564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438948
13070	NC_017278	G	7	7	549579	549585	0 %	0 %	100 %	0 %	384438948
13071	NC_017278	GAG	2	6	549615	549620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438948
13072	NC_017278	AAG	2	6	549694	549699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438948
13073	NC_017278	GC	3	6	549715	549720	0 %	0 %	50 %	50 %	384438948
13074	NC_017278	CGG	2	6	549760	549765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438948
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13077	NC_017278	TGG	2	6	549872	549877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438949
13078	NC_017278	C	6	6	549883	549888	0 %	0 %	0 %	100 %	384438949
13079	NC_017278	AC	3	6	549951	549956	50 %	0 %	0 %	50 %	384438949
13080	NC_017278	GC	3	6	549998	550003	0 %	0 %	50 %	50 %	384438950
13081	NC_017278	CTG	2	6	550053	550058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438950
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13085	NC_017278	ACC	3	9	550140	550148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438950
13086	NC_017278	CCG	2	6	550175	550180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438950
13087	NC_017278	CGG	2	6	550185	550190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438950
13088	NC_017278	GCT	2	6	550222	550227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438950
13089	NC_017278	GTG	2	6	550275	550280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438950
13090	NC_017278	CAC	2	6	550349	550354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438950
13091	NC_017278	C	8	8	550354	550361	0 %	0 %	0 %	100 %	384438950
13092	NC_017278	G	6	6	550372	550377	0 %	0 %	100 %	0 %	384438950
13093	NC_017278	CTT	2	6	550415	550420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438950
13094	NC_017278	CAT	2	6	550460	550465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438950
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13099	NC_017278	CGCC	2	8	550703	550710	0 %	0 %	25 %	75 %	384438950
13100	NC_017278	GCC	2	6	550783	550788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438950
13101	NC_017278	CTA	2	6	550802	550807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438950
13102	NC_017278	GAG	3	9	550893	550901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438950
13103	NC_017278	GGA	2	6	550925	550930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438950
13104	NC_017278	GCC	2	6	550986	550991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438950
13105	NC_017278	GCG	2	6	551024	551029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438950
13106	NC_017278	GC	3	6	551070	551075	0 %	0 %	50 %	50 %	384438950
13107	NC_017278	G	6	6	551090	551095	0 %	0 %	100 %	0 %	384438950
13108	NC_017278	TGG	2	6	551110	551115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438950
13109	NC_017278	AGG	2	6	551125	551130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438950
13110	NC_017278	ACT	2	6	551155	551160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438950
13111	NC_017278	GCCC	2	8	551184	551191	0 %	0 %	25 %	75 %	384438950
13112	NC_017278	GTG	2	6	551250	551255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438950
13113	NC_017278	GAAG	2	8	551261	551268	50 %	0 %	50 %	0 %	384438950
13114	NC_017278	TCT	2	6	551323	551328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438951
13115	NC_017278	CAT	2	6	551333	551338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438951
13116	NC_017278	G	6	6	551341	551346	0 %	0 %	100 %	0 %	384438951
13117	NC_017278	TCCC	2	8	551351	551358	0 %	25 %	0 %	75 %	384438951
13118	NC_017278	TGG	2	6	551428	551433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438951
13119	NC_017278	G	7	7	551582	551588	0 %	0 %	100 %	0 %	384438951
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13121	NC_017278	TCCACG	2	12	551599	551610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438951
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