MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017278	G	6	6	238297	238302	0 %	0 %	100 %	0 %	384438613
5502	NC_017278	GGGCC	2	10	238312	238321	0 %	0 %	60 %	40 %	384438613
5503	NC_017278	GGAGC	2	10	238326	238335	20 %	0 %	60 %	20 %	384438613
5504	NC_017278	GGT	2	6	238371	238376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438613
5505	NC_017278	CCT	2	6	238377	238382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438613
5506	NC_017278	AGG	2	6	238415	238420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438613
5507	NC_017278	CCT	2	6	238485	238490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438613
5508	NC_017278	CGC	2	6	238494	238499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438613
5509	NC_017278	CCT	2	6	238554	238559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438613
5510	NC_017278	G	6	6	238562	238567	0 %	0 %	100 %	0 %	384438613
5511	NC_017278	AGG	2	6	238568	238573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438613
5512	NC_017278	TGCCCT	2	12	238669	238680	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384438614
5513	NC_017278	GCC	2	6	238706	238711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438614
5514	NC_017278	GGA	2	6	238759	238764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438614
5515	NC_017278	GCC	2	6	238770	238775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438614
5516	NC_017278	C	6	6	238784	238789	0 %	0 %	0 %	100 %	384438614
5517	NC_017278	CTA	2	6	238912	238917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438614
5518	NC_017278	CGCC	2	8	238918	238925	0 %	0 %	25 %	75 %	384438614
5519	NC_017278	GGGCCT	2	12	238978	238989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384438614
5520	NC_017278	GCCT	2	8	239011	239018	0 %	25 %	25 %	50 %	384438614
5521	NC_017278	GAA	2	6	239082	239087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438614
5522	NC_017278	CGA	2	6	239095	239100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438614
5523	NC_017278	GCC	2	6	239130	239135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438614
5524	NC_017278	CGG	2	6	239169	239174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438614
5525	NC_017278	CTA	2	6	239182	239187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438614
5526	NC_017278	GGGC	2	8	239209	239216	0 %	0 %	75 %	25 %	384438614
5527	NC_017278	GGC	2	6	239230	239235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438614
5528	NC_017278	G	6	6	239256	239261	0 %	0 %	100 %	0 %	384438615
5529	NC_017278	TCC	2	6	239339	239344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438615
5530	NC_017278	GTG	2	6	239380	239385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438615
5531	NC_017278	CTC	2	6	239392	239397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438615
5532	NC_017278	TGG	3	9	239447	239455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438615
5533	NC_017278	CAC	3	9	239469	239477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438615
5534	NC_017278	TGG	2	6	239492	239497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438615
5535	NC_017278	CCT	2	6	239580	239585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438615
5536	NC_017278	CTACGC	2	12	239607	239618	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384438615
5537	NC_017278	AGG	2	6	239642	239647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438615
5538	NC_017278	TGG	2	6	239981	239986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438616
5539	NC_017278	TCC	2	6	240029	240034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438616
5540	NC_017278	GAAGG	2	10	240043	240052	40 %	0 %	60 %	0 %	384438616
5541	NC_017278	CCCT	2	8	240058	240065	0 %	25 %	0 %	75 %	384438616
5542	NC_017278	CCT	3	9	240063	240071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438616
5543	NC_017278	TGG	2	6	240104	240109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438616
5544	NC_017278	CCT	2	6	240111	240116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438616
5545	NC_017278	GAT	2	6	240132	240137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438616
5546	NC_017278	GGGGA	2	10	240160	240169	20 %	0 %	80 %	0 %	384438616
5547	NC_017278	CCT	2	6	240225	240230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438616
5548	NC_017278	GTG	2	6	240238	240243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438616
5549	NC_017278	CTTC	2	8	240314	240321	0 %	50 %	0 %	50 %	384438617
5550	NC_017278	G	6	6	240372	240377	0 %	0 %	100 %	0 %	384438617
5551	NC_017278	GGAA	2	8	240419	240426	50 %	0 %	50 %	0 %	384438617
5552	NC_017278	GAG	3	9	240433	240441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438617
5553	NC_017278	GCT	2	6	240443	240448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438617
5554	NC_017278	CCCCT	2	10	240492	240501	0 %	20 %	0 %	80 %	384438617
5555	NC_017278	GAG	2	6	240516	240521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438617
5556	NC_017278	GGT	2	6	240593	240598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438617
5557	NC_017278	CGT	2	6	240618	240623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438617
5558	NC_017278	AAG	2	6	240654	240659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438617
5559	NC_017278	GGC	2	6	240662	240667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438617
5560	NC_017278	TCC	2	6	240674	240679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5561	NC_017278	CTC	3	9	240685	240693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5562	NC_017278	CCT	2	6	240699	240704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5563	NC_017278	CCT	3	9	240714	240722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5564	NC_017278	C	6	6	240736	240741	0 %	0 %	0 %	100 %	384438618
5565	NC_017278	TACACC	2	12	240763	240774	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384438618
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5567	NC_017278	GCCCAA	2	12	240831	240842	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384438618
5568	NC_017278	C	6	6	240937	240942	0 %	0 %	0 %	100 %	384438618
5569	NC_017278	TCC	2	6	240964	240969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5570	NC_017278	GAGG	2	8	241002	241009	25 %	0 %	75 %	0 %	384438618
5571	NC_017278	GGAG	2	8	241098	241105	25 %	0 %	75 %	0 %	384438618
5572	NC_017278	GAG	2	6	241113	241118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438618
5573	NC_017278	AG	3	6	241117	241122	50 %	0 %	50 %	0 %	384438618
5574	NC_017278	TCCCT	2	10	241137	241146	0 %	40 %	0 %	60 %	384438618
5575	NC_017278	AGG	2	6	241151	241156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438618
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5578	NC_017278	CAAG	2	8	241258	241265	50 %	0 %	25 %	25 %	384438618
5579	NC_017278	AGAA	2	8	241286	241293	75 %	0 %	25 %	0 %	384438618
5580	NC_017278	CTC	2	6	241326	241331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438618
5581	NC_017278	CT	3	6	241388	241393	0 %	50 %	0 %	50 %	384438618
5582	NC_017278	AAGG	2	8	241397	241404	50 %	0 %	50 %	0 %	384438618
5583	NC_017278	GGGGAA	2	12	241417	241428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438618
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5585	NC_017278	CCTC	2	8	241476	241483	0 %	25 %	0 %	75 %	384438618
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5590	NC_017278	GAG	2	6	241696	241701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438618
5591	NC_017278	CGGG	2	8	241707	241714	0 %	0 %	75 %	25 %	384438618
5592	NC_017278	TGG	4	12	241775	241786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438618
5593	NC_017278	GAG	3	9	241789	241797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438618
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5595	NC_017278	C	6	6	241819	241824	0 %	0 %	0 %	100 %	384438618
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5598	NC_017278	CCCT	2	8	241904	241911	0 %	25 %	0 %	75 %	384438619
5599	NC_017278	GAG	2	6	241937	241942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438619
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5602	NC_017278	C	7	7	242010	242016	0 %	0 %	0 %	100 %	384438619
5603	NC_017278	G	6	6	242031	242036	0 %	0 %	100 %	0 %	384438619
5604	NC_017278	CTC	2	6	242044	242049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438619
5605	NC_017278	G	6	6	242051	242056	0 %	0 %	100 %	0 %	384438619
5606	NC_017278	GCC	2	6	242058	242063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438619
5607	NC_017278	G	7	7	242080	242086	0 %	0 %	100 %	0 %	384438619
5608	NC_017278	GGT	2	6	242095	242100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438619
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5611	NC_017278	TGG	2	6	242265	242270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438619
5612	NC_017278	GAC	2	6	242309	242314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438619
5613	NC_017278	AGG	2	6	242322	242327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438619
5614	NC_017278	TCT	2	6	242352	242357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438619
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5619	NC_017278	GGT	2	6	242834	242839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438621
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5622	NC_017278	GAG	2	6	242934	242939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438621
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5993	NC_017278	GGTGAG	2	12	260373	260384	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384438637
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5995	NC_017278	C	6	6	260432	260437	0 %	0 %	0 %	100 %	384438637
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5997	NC_017278	CCG	2	6	260501	260506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438637
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5999	NC_017278	TCCCC	2	10	260525	260534	0 %	20 %	0 %	80 %	384438637
6000	NC_017278	GGCC	2	8	260549	260556	0 %	0 %	50 %	50 %	384438637

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