MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_017278	AGA	2	6	2240324	2240329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440644
56003	NC_017278	GGC	2	6	2240359	2240364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440644
56004	NC_017278	CTC	2	6	2240368	2240373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440644
56005	NC_017278	GCG	3	9	2240392	2240400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440644
56006	NC_017278	GCT	2	6	2240403	2240408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440644
56007	NC_017278	ACC	2	6	2240444	2240449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440644
56008	NC_017278	C	7	7	2240448	2240454	0 %	0 %	0 %	100 %	384440644
56009	NC_017278	CCCT	2	8	2240484	2240491	0 %	25 %	0 %	75 %	384440644
56010	NC_017278	CTT	2	6	2240503	2240508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440644
56011	NC_017278	CCT	2	6	2240524	2240529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440645
56012	NC_017278	GGC	2	6	2240536	2240541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440645
56013	NC_017278	ACC	2	6	2240631	2240636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440645
56014	NC_017278	CTG	2	6	2240684	2240689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440645
56015	NC_017278	TGA	2	6	2240719	2240724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440645
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56017	NC_017278	GTA	2	6	2240810	2240815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440645
56018	NC_017278	G	6	6	2240872	2240877	0 %	0 %	100 %	0 %	384440645
56019	NC_017278	AGG	2	6	2240898	2240903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440645
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56022	NC_017278	GGAGG	2	10	2240993	2241002	20 %	0 %	80 %	0 %	384440645
56023	NC_017278	GGA	2	6	2241052	2241057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440645
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56041	NC_017278	G	6	6	2241503	2241508	0 %	0 %	100 %	0 %	384440646
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56051	NC_017278	TCCAGG	2	12	2241898	2241909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384440646
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56101	NC_017278	C	7	7	2243593	2243599	0 %	0 %	0 %	100 %	384440647
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56109	NC_017278	ACC	3	9	2243762	2243770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440647

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.