MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_017278	CTC	2	6	2204223	2204228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440606
55002	NC_017278	ACC	2	6	2204242	2204247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440606
55003	NC_017278	CTC	2	6	2204274	2204279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440606
55004	NC_017278	GGC	2	6	2204438	2204443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440606
55005	NC_017278	C	6	6	2204467	2204472	0 %	0 %	0 %	100 %	384440606
55006	NC_017278	AGA	2	6	2204498	2204503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440606
55007	NC_017278	TCG	2	6	2204633	2204638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440607
55008	NC_017278	CCG	2	6	2204649	2204654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440607
55009	NC_017278	GGC	2	6	2204680	2204685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440607
55010	NC_017278	GGCC	2	8	2204699	2204706	0 %	0 %	50 %	50 %	384440607
55011	NC_017278	GGC	2	6	2204746	2204751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440607
55012	NC_017278	GCC	2	6	2204765	2204770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440607
55013	NC_017278	GGCC	2	8	2204810	2204817	0 %	0 %	50 %	50 %	384440607
55014	NC_017278	GGC	2	6	2204860	2204865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440607
55015	NC_017278	GGC	2	6	2204887	2204892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440607
55016	NC_017278	C	6	6	2204905	2204910	0 %	0 %	0 %	100 %	384440607
55017	NC_017278	CGT	2	6	2204928	2204933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440607
55018	NC_017278	CCT	2	6	2204964	2204969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440607
55019	NC_017278	GGA	2	6	2204973	2204978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440607
55020	NC_017278	AGG	2	6	2204990	2204995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440607
55021	NC_017278	TCC	2	6	2205032	2205037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440607
55022	NC_017278	GAA	2	6	2205070	2205075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440607
55023	NC_017278	TGA	2	6	2205171	2205176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440607
55024	NC_017278	TGCT	2	8	2205179	2205186	0 %	50 %	25 %	25 %	384440607
55025	NC_017278	GCG	3	9	2205236	2205244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440607
55026	NC_017278	GAGCCG	2	12	2205248	2205259	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440607
55027	NC_017278	AAG	2	6	2205311	2205316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440607
55028	NC_017278	TGGC	2	8	2205374	2205381	0 %	25 %	50 %	25 %	384440607
55029	NC_017278	AGGGCC	2	12	2205389	2205400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440607
55030	NC_017278	TCC	2	6	2205419	2205424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440607
55031	NC_017278	GCCCC	2	10	2205453	2205462	0 %	0 %	20 %	80 %	384440607
55032	NC_017278	C	7	7	2205459	2205465	0 %	0 %	0 %	100 %	384440607
55033	NC_017278	CGGTC	2	10	2205540	2205549	0 %	20 %	40 %	40 %	384440607
55034	NC_017278	CCCCTG	2	12	2205555	2205566	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384440607
55035	NC_017278	CTC	2	6	2205616	2205621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440607
55036	NC_017278	CTC	2	6	2205628	2205633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440607
55037	NC_017278	ATG	2	6	2205647	2205652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440607
55038	NC_017278	CTC	2	6	2205725	2205730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440608
55039	NC_017278	TGG	2	6	2205732	2205737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440608
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55042	NC_017278	CCT	2	6	2205895	2205900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440608
55043	NC_017278	GGC	2	6	2205902	2205907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440608
55044	NC_017278	CGG	2	6	2205915	2205920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440608
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55049	NC_017278	TCC	3	9	2206062	2206070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440608
55050	NC_017278	CTGGC	2	10	2206097	2206106	0 %	20 %	40 %	40 %	384440608
55051	NC_017278	GCCCC	2	10	2206130	2206139	0 %	0 %	20 %	80 %	384440608
55052	NC_017278	GGA	2	6	2206152	2206157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440608
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55054	NC_017278	TCC	2	6	2206293	2206298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440608
55055	NC_017278	GGC	2	6	2206308	2206313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440608
55056	NC_017278	CGG	2	6	2206327	2206332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440608
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55067	NC_017278	CTC	2	6	2207001	2207006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440609
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55074	NC_017278	TCC	2	6	2207197	2207202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440609
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55083	NC_017278	GTA	2	6	2207514	2207519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440609
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55106	NC_017278	GGC	2	6	2208219	2208224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440609
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55230	NC_017278	G	6	6	2213151	2213156	0 %	0 %	100 %	0 %	384440615
55231	NC_017278	CCTCAC	2	12	2213363	2213374	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384440615
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55465	NC_017278	TCC	2	6	2222241	2222246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440626
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55467	NC_017278	GGGC	2	8	2222287	2222294	0 %	0 %	75 %	25 %	384440626
55468	NC_017278	GCA	2	6	2222328	2222333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440626
55469	NC_017278	GGA	2	6	2222356	2222361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440626
55470	NC_017278	GCC	3	9	2222385	2222393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440626
55471	NC_017278	TCC	2	6	2222448	2222453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440626
55472	NC_017278	TGG	2	6	2222490	2222495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440626
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55491	NC_017278	GGT	2	6	2223298	2223303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440626
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55494	NC_017278	CGA	2	6	2223366	2223371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440627
55495	NC_017278	GGCCT	2	10	2223376	2223385	0 %	20 %	40 %	40 %	384440627
55496	NC_017278	GGC	2	6	2223399	2223404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440627
55497	NC_017278	CCT	2	6	2223438	2223443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440627
55498	NC_017278	G	7	7	2223451	2223457	0 %	0 %	100 %	0 %	384440627
55499	NC_017278	CGG	2	6	2223545	2223550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440627
55500	NC_017278	CTGG	2	8	2223555	2223562	0 %	25 %	50 %	25 %	384440627

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