MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017278	GCTTC	2	10	216794	216803	0 %	40 %	20 %	40 %	384438590
5002	NC_017278	AGGGCC	2	12	216818	216829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438590
5003	NC_017278	ACA	2	6	216905	216910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438590
5004	NC_017278	CTG	2	6	217144	217149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438591
5005	NC_017278	GCC	2	6	217237	217242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438591
5006	NC_017278	CCT	2	6	217257	217262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438591
5007	NC_017278	G	7	7	217276	217282	0 %	0 %	100 %	0 %	384438591
5008	NC_017278	C	6	6	217303	217308	0 %	0 %	0 %	100 %	384438591
5009	NC_017278	AGG	2	6	217343	217348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
5010	NC_017278	GGT	2	6	217392	217397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438591
5011	NC_017278	ACC	2	6	217411	217416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438591
5012	NC_017278	CCTGGC	2	12	217419	217430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438591
5013	NC_017278	GGC	2	6	217445	217450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438591
5014	NC_017278	TGG	2	6	217556	217561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438591
5015	NC_017278	GGA	2	6	217572	217577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
5016	NC_017278	GCGG	2	8	217593	217600	0 %	0 %	75 %	25 %	384438591
5017	NC_017278	CTT	2	6	217605	217610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438591
5018	NC_017278	ACCA	2	8	217645	217652	50 %	0 %	0 %	50 %	384438591
5019	NC_017278	GAG	2	6	217660	217665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
5020	NC_017278	GCG	2	6	217666	217671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438591
5021	NC_017278	C	6	6	217760	217765	0 %	0 %	0 %	100 %	384438591
5022	NC_017278	GGA	2	6	217797	217802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438591
5023	NC_017278	GGT	2	6	217833	217838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438591
5024	NC_017278	C	6	6	217914	217919	0 %	0 %	0 %	100 %	384438592
5025	NC_017278	GGC	2	6	217951	217956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438592
5026	NC_017278	CCT	2	6	217966	217971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438592
5027	NC_017278	CCA	2	6	218061	218066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438592
5028	NC_017278	CGGC	2	8	218080	218087	0 %	0 %	50 %	50 %	384438592
5029	NC_017278	G	6	6	218091	218096	0 %	0 %	100 %	0 %	384438592
5030	NC_017278	CCA	2	6	218142	218147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438592
5031	NC_017278	GGC	3	9	218155	218163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438592
5032	NC_017278	GGC	2	6	218170	218175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438592
5033	NC_017278	GCGG	2	8	218233	218240	0 %	0 %	75 %	25 %	384438592
5034	NC_017278	CCG	2	6	218257	218262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438592
5035	NC_017278	CTT	2	6	218264	218269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438592
5036	NC_017278	GGA	2	6	218275	218280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438592
5037	NC_017278	CGG	2	6	218304	218309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438592
5038	NC_017278	TCT	2	6	218364	218369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438592
5039	NC_017278	AGG	2	6	218448	218453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438592
5040	NC_017278	CCTG	2	8	218455	218462	0 %	25 %	25 %	50 %	384438592
5041	NC_017278	CAC	2	6	218664	218669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438593
5042	NC_017278	CTC	3	9	218683	218691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5043	NC_017278	GAG	2	6	218695	218700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438593
5044	NC_017278	GGCCGA	2	12	218712	218723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384438593
5045	NC_017278	GCCCCG	2	12	218743	218754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438593
5046	NC_017278	GAG	2	6	218764	218769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438593
5047	NC_017278	TGG	2	6	218782	218787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
5048	NC_017278	CCT	2	6	218814	218819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5049	NC_017278	CCTC	2	8	218837	218844	0 %	25 %	0 %	75 %	384438593
5050	NC_017278	ACG	2	6	218888	218893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
5051	NC_017278	GCA	2	6	218922	218927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
5052	NC_017278	ACG	2	6	218930	218935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
5053	NC_017278	CAG	2	6	219019	219024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438593
5054	NC_017278	CTC	2	6	219040	219045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5055	NC_017278	GGC	2	6	219053	219058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438593
5056	NC_017278	AGG	2	6	219143	219148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438593
5057	NC_017278	CTGG	2	8	219195	219202	0 %	25 %	50 %	25 %	384438593
5058	NC_017278	GGC	2	6	219291	219296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438593
5059	NC_017278	CGC	3	9	219354	219362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438593
5060	NC_017278	GGT	2	6	219396	219401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
5061	NC_017278	GGGCG	2	10	219408	219417	0 %	0 %	80 %	20 %	384438593
5062	NC_017278	CCA	2	6	219518	219523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438593
5063	NC_017278	CCT	2	6	219531	219536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5064	NC_017278	GGGGT	2	10	219565	219574	0 %	20 %	80 %	0 %	384438593
5065	NC_017278	CGGAGG	2	12	219590	219601	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384438593
5066	NC_017278	C	7	7	219606	219612	0 %	0 %	0 %	100 %	384438593
5067	NC_017278	TGG	2	6	219626	219631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
5068	NC_017278	TCC	2	6	219632	219637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5069	NC_017278	GGT	2	6	219690	219695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438593
5070	NC_017278	CCT	2	6	219738	219743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5071	NC_017278	CCA	2	6	219768	219773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438593
5072	NC_017278	G	7	7	219829	219835	0 %	0 %	100 %	0 %	384438593
5073	NC_017278	GGA	2	6	219854	219859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438593
5074	NC_017278	CCT	2	6	219894	219899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438593
5075	NC_017278	GGC	2	6	219948	219953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438593
5076	NC_017278	C	7	7	220023	220029	0 %	0 %	0 %	100 %	384438593
5077	NC_017278	GGGC	2	8	220128	220135	0 %	0 %	75 %	25 %	384438594
5078	NC_017278	AGG	2	6	220206	220211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438594
5079	NC_017278	AGG	2	6	220221	220226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438594
5080	NC_017278	GACC	2	8	220276	220283	25 %	0 %	25 %	50 %	384438594
5081	NC_017278	GCC	2	6	220320	220325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438594
5082	NC_017278	CCT	2	6	220330	220335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438594
5083	NC_017278	CCA	2	6	220356	220361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438594
5084	NC_017278	GAG	3	9	220385	220393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438594
5085	NC_017278	TGG	2	6	220461	220466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438594
5086	NC_017278	C	6	6	220472	220477	0 %	0 %	0 %	100 %	384438594
5087	NC_017278	G	6	6	220488	220493	0 %	0 %	100 %	0 %	384438594
5088	NC_017278	TGG	2	6	220506	220511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438594
5089	NC_017278	GCC	2	6	220526	220531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438594
5090	NC_017278	ACT	2	6	220557	220562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438594
5091	NC_017278	GGA	2	6	220720	220725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438594
5092	NC_017278	GGT	2	6	220726	220731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438594
5093	NC_017278	GCC	2	6	220761	220766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438594
5094	NC_017278	GTG	2	6	220793	220798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438594
5095	NC_017278	TCA	2	6	220827	220832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438594
5096	NC_017278	CGG	2	6	220855	220860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438594
5097	NC_017278	TCT	2	6	220869	220874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438594
5098	NC_017278	CTC	2	6	220902	220907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5099	NC_017278	TCC	2	6	220927	220932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5100	NC_017278	CTC	2	6	220938	220943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5101	NC_017278	CCT	2	6	220961	220966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5102	NC_017278	GCC	2	6	220991	220996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438595
5103	NC_017278	TCC	2	6	221035	221040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5104	NC_017278	CCT	2	6	221072	221077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5105	NC_017278	TGG	3	9	221089	221097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438595
5106	NC_017278	GCG	2	6	221155	221160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438595
5107	NC_017278	C	6	6	221199	221204	0 %	0 %	0 %	100 %	384438595
5108	NC_017278	CTC	2	6	221316	221321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5109	NC_017278	GGC	2	6	221360	221365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438595
5110	NC_017278	CGC	2	6	221438	221443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438595
5111	NC_017278	TCC	2	6	221458	221463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5112	NC_017278	CTC	2	6	221493	221498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438595
5113	NC_017278	GGGA	2	8	221502	221509	25 %	0 %	75 %	0 %	384438595
5114	NC_017278	CT	3	6	221532	221537	0 %	50 %	0 %	50 %	384438595
5115	NC_017278	G	6	6	221554	221559	0 %	0 %	100 %	0 %	384438595
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5119	NC_017278	GTGAA	2	10	221667	221676	40 %	20 %	40 %	0 %	384438595
5120	NC_017278	GGC	2	6	221693	221698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438596
5121	NC_017278	GTG	2	6	221746	221751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438596
5122	NC_017278	GGA	2	6	221766	221771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438596
5123	NC_017278	ATC	2	6	221788	221793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438596
5124	NC_017278	CTC	2	6	221800	221805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438596
5125	NC_017278	TGG	2	6	221879	221884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438596
5126	NC_017278	TCC	2	6	221918	221923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438596
5127	NC_017278	CGG	3	9	221954	221962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438596
5128	NC_017278	CTA	2	6	222018	222023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438596
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5130	NC_017278	CTA	2	6	222048	222053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438596
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5134	NC_017278	G	7	7	222313	222319	0 %	0 %	100 %	0 %	384438596
5135	NC_017278	G	6	6	222333	222338	0 %	0 %	100 %	0 %	384438596
5136	NC_017278	GAC	2	6	222439	222444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438596
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5140	NC_017278	GCTGGG	2	12	222593	222604	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438596
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5143	NC_017278	TGC	2	6	222740	222745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438596
5144	NC_017278	CTA	2	6	222756	222761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438596
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5154	NC_017278	CCT	2	6	223035	223040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438597
5155	NC_017278	TCC	2	6	223076	223081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438597
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5164	NC_017278	CCCTGG	2	12	223406	223417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438597
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5227	NC_017278	GTGG	2	8	226330	226337	0 %	25 %	75 %	0 %	384438601
5228	NC_017278	GGT	2	6	226398	226403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438601
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5231	NC_017278	TCC	2	6	226555	226560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438602
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5233	NC_017278	AGG	2	6	226615	226620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438602
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5235	NC_017278	GGGC	2	8	226719	226726	0 %	0 %	75 %	25 %	384438603
5236	NC_017278	G	6	6	226776	226781	0 %	0 %	100 %	0 %	384438603
5237	NC_017278	GGC	2	6	226834	226839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438603
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5239	NC_017278	TGG	2	6	227124	227129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438603
5240	NC_017278	G	6	6	227128	227133	0 %	0 %	100 %	0 %	384438603
5241	NC_017278	GCC	2	6	227237	227242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438603
5242	NC_017278	CCT	2	6	227269	227274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438603
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5244	NC_017278	TGGGGG	2	12	227385	227396	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384438603
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5492	NC_017278	G	6	6	237950	237955	0 %	0 %	100 %	0 %	384438613
5493	NC_017278	CCT	2	6	237981	237986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438613
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5496	NC_017278	AGG	2	6	238028	238033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438613
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5499	NC_017278	G	7	7	238260	238266	0 %	0 %	100 %	0 %	384438613
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