MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_017278	GGT	4	12	2164087	2164098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54002	NC_017278	GAG	2	6	2164112	2164117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54003	NC_017278	AGGGGA	2	12	2164159	2164170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54004	NC_017278	CCT	2	6	2164174	2164179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440565
54005	NC_017278	GCCC	2	8	2164192	2164199	0 %	0 %	25 %	75 %	384440565
54006	NC_017278	CCG	2	6	2164213	2164218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440565
54007	NC_017278	ACG	2	6	2164233	2164238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440565
54008	NC_017278	GGT	2	6	2164309	2164314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54009	NC_017278	GGC	2	6	2164349	2164354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440565
54010	NC_017278	AGC	2	6	2164386	2164391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440565
54011	NC_017278	G	6	6	2164414	2164419	0 %	0 %	100 %	0 %	384440565
54012	NC_017278	GAG	2	6	2164430	2164435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54013	NC_017278	CCG	2	6	2164509	2164514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440565
54014	NC_017278	GGT	2	6	2164524	2164529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54015	NC_017278	TACCGC	2	12	2164592	2164603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384440565
54016	NC_017278	GGT	2	6	2164609	2164614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54017	NC_017278	AGGCCA	2	12	2164686	2164697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440565
54018	NC_017278	TCA	2	6	2164719	2164724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440565
54019	NC_017278	GGA	2	6	2164756	2164761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54020	NC_017278	GCCGG	2	10	2164778	2164787	0 %	0 %	60 %	40 %	384440565
54021	NC_017278	CCA	2	6	2164803	2164808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440565
54022	NC_017278	GGC	2	6	2164828	2164833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440565
54023	NC_017278	CCT	2	6	2164840	2164845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440565
54024	NC_017278	GGC	2	6	2164888	2164893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440565
54025	NC_017278	TGG	2	6	2164932	2164937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54026	NC_017278	AGG	2	6	2164938	2164943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54027	NC_017278	TGG	2	6	2164962	2164967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54028	NC_017278	ACC	2	6	2164986	2164991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440565
54029	NC_017278	CTTCCT	2	12	2165002	2165013	0 %	50 %	0 %	50 %	384440565
54030	NC_017278	GGC	2	6	2165016	2165021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440565
54031	NC_017278	CCG	2	6	2165097	2165102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440565
54032	NC_017278	CGA	2	6	2165134	2165139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440565
54033	NC_017278	GTG	2	6	2165150	2165155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54034	NC_017278	A	6	6	2165184	2165189	100 %	0 %	0 %	0 %	384440565
54035	NC_017278	AGG	2	6	2165205	2165210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440565
54036	NC_017278	CTC	2	6	2165312	2165317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440565
54037	NC_017278	GTG	2	6	2165333	2165338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440565
54038	NC_017278	GCC	2	6	2165366	2165371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440565
54039	NC_017278	CCA	2	6	2165458	2165463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440566
54040	NC_017278	CCT	3	9	2165512	2165520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440566
54041	NC_017278	GA	3	6	2165548	2165553	50 %	0 %	50 %	0 %	384440566
54042	NC_017278	CGT	2	6	2165560	2165565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440566
54043	NC_017278	CCA	2	6	2165572	2165577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440566
54044	NC_017278	ATG	2	6	2165654	2165659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440566
54045	NC_017278	CAC	2	6	2165741	2165746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440566
54046	NC_017278	CGG	2	6	2165755	2165760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440566
54047	NC_017278	TCG	2	6	2165790	2165795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440566
54048	NC_017278	CCT	2	6	2166016	2166021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440566
54049	NC_017278	GCC	2	6	2166025	2166030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440566
54050	NC_017278	CCA	2	6	2166034	2166039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440566
54051	NC_017278	TCC	2	6	2166057	2166062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440566
54052	NC_017278	CCG	2	6	2166113	2166118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440566
54053	NC_017278	CCGG	2	8	2166124	2166131	0 %	0 %	50 %	50 %	384440566
54054	NC_017278	CGG	2	6	2166299	2166304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440566
54055	NC_017278	A	6	6	2166316	2166321	100 %	0 %	0 %	0 %	384440566
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54057	NC_017278	CCT	2	6	2166340	2166345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440566
54058	NC_017278	C	7	7	2166361	2166367	0 %	0 %	0 %	100 %	384440566
54059	NC_017278	GGA	2	6	2166385	2166390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440566
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54061	NC_017278	GGC	2	6	2166431	2166436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440566
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54065	NC_017278	CAC	2	6	2166521	2166526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440566
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54069	NC_017278	GA	3	6	2166681	2166686	50 %	0 %	50 %	0 %	384440566
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54072	NC_017278	CCCCGG	2	12	2166762	2166773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440566
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54100	NC_017278	CAC	2	6	2167870	2167875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440567
54101	NC_017278	C	7	7	2167893	2167899	0 %	0 %	0 %	100 %	384440567
54102	NC_017278	AGG	2	6	2167919	2167924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440567
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54117	NC_017278	CGG	2	6	2168348	2168353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440568
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54218	NC_017278	GCA	2	6	2172329	2172334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440571
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54223	NC_017278	GGGCC	2	10	2172515	2172524	0 %	0 %	60 %	40 %	384440571
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54225	NC_017278	G	6	6	2172570	2172575	0 %	0 %	100 %	0 %	384440571
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54235	NC_017278	TCCGC	2	10	2173090	2173099	0 %	20 %	20 %	60 %	384440572
54236	NC_017278	CCT	2	6	2173108	2173113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440572
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54325	NC_017278	TCC	2	6	2176693	2176698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440577
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54329	NC_017278	GGT	2	6	2176881	2176886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440577
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54335	NC_017278	CCCCA	2	10	2177118	2177127	20 %	0 %	0 %	80 %	384440577
54336	NC_017278	C	6	6	2177130	2177135	0 %	0 %	0 %	100 %	384440577
54337	NC_017278	AGAT	2	8	2177140	2177147	50 %	25 %	25 %	0 %	384440577
54338	NC_017278	GGA	2	6	2177174	2177179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440577
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54341	NC_017278	G	7	7	2177293	2177299	0 %	0 %	100 %	0 %	384440577
54342	NC_017278	CCA	2	6	2177345	2177350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440577
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54345	NC_017278	GTGGG	2	10	2177666	2177675	0 %	20 %	80 %	0 %	384440578
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54347	NC_017278	CCT	2	6	2177951	2177956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440579
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