MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_017278	TGG	2	6	2120168	2120173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440523
53002	NC_017278	CAG	2	6	2120185	2120190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440523
53003	NC_017278	GGCG	2	8	2120212	2120219	0 %	0 %	75 %	25 %	384440523
53004	NC_017278	CGG	2	6	2120252	2120257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440523
53005	NC_017278	CCA	2	6	2120286	2120291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440523
53006	NC_017278	GCCT	2	8	2120344	2120351	0 %	25 %	25 %	50 %	384440523
53007	NC_017278	TCA	2	6	2120375	2120380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440523
53008	NC_017278	GGA	2	6	2120442	2120447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440523
53009	NC_017278	TCCACC	2	12	2120514	2120525	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384440524
53010	NC_017278	CTC	2	6	2120705	2120710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440524
53011	NC_017278	ACT	2	6	2120724	2120729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440524
53012	NC_017278	G	7	7	2120788	2120794	0 %	0 %	100 %	0 %	384440524
53013	NC_017278	G	6	6	2120806	2120811	0 %	0 %	100 %	0 %	384440524
53014	NC_017278	GGA	3	9	2120842	2120850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53015	NC_017278	GAG	2	6	2120954	2120959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53016	NC_017278	GAG	2	6	2121026	2121031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53017	NC_017278	GCC	2	6	2121066	2121071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440524
53018	NC_017278	CCG	2	6	2121154	2121159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440524
53019	NC_017278	GCG	2	6	2121175	2121180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440524
53020	NC_017278	G	6	6	2121180	2121185	0 %	0 %	100 %	0 %	384440524
53021	NC_017278	GAG	2	6	2121215	2121220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53022	NC_017278	AGG	4	12	2121252	2121263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53023	NC_017278	C	6	6	2121295	2121300	0 %	0 %	0 %	100 %	384440524
53024	NC_017278	AGG	2	6	2121366	2121371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53025	NC_017278	GGCCCT	2	12	2121454	2121465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384440524
53026	NC_017278	C	6	6	2121477	2121482	0 %	0 %	0 %	100 %	384440524
53027	NC_017278	GGA	2	6	2121547	2121552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440524
53028	NC_017278	TGG	2	6	2121585	2121590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440524
53029	NC_017278	G	6	6	2121603	2121608	0 %	0 %	100 %	0 %	384440524
53030	NC_017278	CCT	2	6	2121634	2121639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440524
53031	NC_017278	GTG	2	6	2121698	2121703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440524
53032	NC_017278	CGA	2	6	2121706	2121711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440524
53033	NC_017278	GTG	2	6	2121728	2121733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440524
53034	NC_017278	GCC	2	6	2121746	2121751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440524
53035	NC_017278	GGC	2	6	2121760	2121765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440524
53036	NC_017278	AG	3	6	2121766	2121771	50 %	0 %	50 %	0 %	384440524
53037	NC_017278	CCT	2	6	2121805	2121810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440524
53038	NC_017278	GCG	2	6	2121823	2121828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440524
53039	NC_017278	GGCCA	2	10	2121836	2121845	20 %	0 %	40 %	40 %	384440524
53040	NC_017278	GGT	2	6	2121853	2121858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440524
53041	NC_017278	GCC	2	6	2121861	2121866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440524
53042	NC_017278	TCC	2	6	2121867	2121872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440524
53043	NC_017278	GAG	2	6	2121910	2121915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440525
53044	NC_017278	AGG	2	6	2121962	2121967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440525
53045	NC_017278	CGC	2	6	2121972	2121977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440525
53046	NC_017278	G	6	6	2122018	2122023	0 %	0 %	100 %	0 %	384440525
53047	NC_017278	TGG	2	6	2122067	2122072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440525
53048	NC_017278	CCA	2	6	2122073	2122078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440525
53049	NC_017278	CCA	2	6	2122152	2122157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440525
53050	NC_017278	CCT	2	6	2122170	2122175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53051	NC_017278	C	6	6	2122190	2122195	0 %	0 %	0 %	100 %	384440525
53052	NC_017278	TCT	2	6	2122196	2122201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440525
53053	NC_017278	GGC	2	6	2122215	2122220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440525
53054	NC_017278	GCC	2	6	2122223	2122228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440525
53055	NC_017278	GGA	2	6	2122230	2122235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440525
53056	NC_017278	CTC	2	6	2122252	2122257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53057	NC_017278	CCT	2	6	2122259	2122264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53058	NC_017278	CCT	2	6	2122296	2122301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53059	NC_017278	GA	3	6	2122307	2122312	50 %	0 %	50 %	0 %	384440525
53060	NC_017278	TGG	2	6	2122367	2122372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440525
53061	NC_017278	GTG	2	6	2122375	2122380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440525
53062	NC_017278	CTC	2	6	2122443	2122448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
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53064	NC_017278	GGCC	2	8	2122491	2122498	0 %	0 %	50 %	50 %	384440525
53065	NC_017278	GCC	2	6	2122543	2122548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440525
53066	NC_017278	CTC	2	6	2122549	2122554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53067	NC_017278	AGG	2	6	2122595	2122600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440525
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53069	NC_017278	C	6	6	2122717	2122722	0 %	0 %	0 %	100 %	384440525
53070	NC_017278	TGGGCC	2	12	2122787	2122798	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384440525
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53072	NC_017278	TCC	2	6	2122808	2122813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440525
53073	NC_017278	TGG	2	6	2122844	2122849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440525
53074	NC_017278	TGG	2	6	2122859	2122864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440525
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53077	NC_017278	GCGGAG	2	12	2123184	2123195	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384440526
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53079	NC_017278	C	6	6	2123312	2123317	0 %	0 %	0 %	100 %	384440526
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53082	NC_017278	GCC	2	6	2123358	2123363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440526
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53089	NC_017278	GCC	2	6	2127094	2127099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440527
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53104	NC_017278	CGG	3	9	2127883	2127891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440527
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53109	NC_017278	GCC	2	6	2128056	2128061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440528
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53115	NC_017278	C	7	7	2128313	2128319	0 %	0 %	0 %	100 %	384440528
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53117	NC_017278	TCC	3	9	2128366	2128374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440528
53118	NC_017278	TCC	2	6	2128390	2128395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440528
53119	NC_017278	TCC	2	6	2128408	2128413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440528
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53230	NC_017278	GCC	2	6	2132673	2132678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440536
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53232	NC_017278	C	6	6	2132697	2132702	0 %	0 %	0 %	100 %	384440536
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53457	NC_017278	TGG	2	6	2142466	2142471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440544
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53467	NC_017278	CGGG	2	8	2143331	2143338	0 %	0 %	75 %	25 %	384440545
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