MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_017278	AGGCCA	2	12	2059887	2059898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440451
51502	NC_017278	CGC	3	9	2059915	2059923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440451
51503	NC_017278	ACC	3	9	2059929	2059937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440451
51504	NC_017278	TCC	2	6	2059938	2059943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51505	NC_017278	TGG	2	6	2059944	2059949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440451
51506	NC_017278	CGG	2	6	2059982	2059987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440451
51507	NC_017278	AGG	2	6	2060016	2060021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440451
51508	NC_017278	CGGG	2	8	2060056	2060063	0 %	0 %	75 %	25 %	384440451
51509	NC_017278	C	6	6	2060100	2060105	0 %	0 %	0 %	100 %	384440451
51510	NC_017278	G	6	6	2060181	2060186	0 %	0 %	100 %	0 %	384440451
51511	NC_017278	GGA	2	6	2060251	2060256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440451
51512	NC_017278	GGT	2	6	2060260	2060265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440451
51513	NC_017278	GGCCCG	2	12	2060272	2060283	0 %	0 %	50 %	50 %	384440451
51514	NC_017278	TCC	2	6	2060310	2060315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51515	NC_017278	GGC	3	9	2060317	2060325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440451
51516	NC_017278	CCCCTG	2	12	2060332	2060343	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384440451
51517	NC_017278	CCCTT	2	10	2060383	2060392	0 %	40 %	0 %	60 %	384440451
51518	NC_017278	CCT	2	6	2060425	2060430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51519	NC_017278	TGG	3	9	2060445	2060453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440451
51520	NC_017278	GAA	2	6	2060474	2060479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440451
51521	NC_017278	CTC	2	6	2060636	2060641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51522	NC_017278	CCG	2	6	2060646	2060651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440451
51523	NC_017278	CTC	3	9	2060660	2060668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51524	NC_017278	CCT	2	6	2060689	2060694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440451
51525	NC_017278	GGA	2	6	2060740	2060745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440451
51526	NC_017278	CGG	2	6	2060774	2060779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440451
51527	NC_017278	CGC	2	6	2060810	2060815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440452
51528	NC_017278	AGG	2	6	2060879	2060884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51529	NC_017278	GCC	2	6	2060913	2060918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440452
51530	NC_017278	C	6	6	2060939	2060944	0 %	0 %	0 %	100 %	384440452
51531	NC_017278	CCCCG	2	10	2060950	2060959	0 %	0 %	20 %	80 %	384440452
51532	NC_017278	CCG	2	6	2060976	2060981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440452
51533	NC_017278	CAG	2	6	2061010	2061015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440452
51534	NC_017278	GCC	2	6	2061071	2061076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440452
51535	NC_017278	AGGAAG	2	12	2061083	2061094	50 %	0 %	50 %	0 %	384440452
51536	NC_017278	GCA	2	6	2061102	2061107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440452
51537	NC_017278	GGCC	2	8	2061136	2061143	0 %	0 %	50 %	50 %	384440452
51538	NC_017278	GAG	2	6	2061148	2061153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51539	NC_017278	GGCCAG	2	12	2061154	2061165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440452
51540	NC_017278	CCCGC	2	10	2061171	2061180	0 %	0 %	20 %	80 %	384440452
51541	NC_017278	TGCC	2	8	2061249	2061256	0 %	25 %	25 %	50 %	384440452
51542	NC_017278	GGA	2	6	2061258	2061263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51543	NC_017278	AGG	2	6	2061275	2061280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51544	NC_017278	AGG	2	6	2061311	2061316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51545	NC_017278	GAG	3	9	2061319	2061327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51546	NC_017278	AGG	2	6	2061338	2061343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51547	NC_017278	AGG	3	9	2061365	2061373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51548	NC_017278	G	7	7	2061372	2061378	0 %	0 %	100 %	0 %	384440452
51549	NC_017278	GAG	2	6	2061382	2061387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51550	NC_017278	GAG	2	6	2061394	2061399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51551	NC_017278	C	7	7	2061400	2061406	0 %	0 %	0 %	100 %	384440452
51552	NC_017278	GGC	2	6	2061415	2061420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440452
51553	NC_017278	GCCG	2	8	2061426	2061433	0 %	0 %	50 %	50 %	384440452
51554	NC_017278	CTCC	3	12	2061448	2061459	0 %	25 %	0 %	75 %	384440452
51555	NC_017278	AGG	2	6	2061470	2061475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51556	NC_017278	CGG	2	6	2061489	2061494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440452
51557	NC_017278	CCA	2	6	2061507	2061512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440452
51558	NC_017278	AGG	2	6	2061527	2061532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51559	NC_017278	G	6	6	2061537	2061542	0 %	0 %	100 %	0 %	384440452
51560	NC_017278	GGA	2	6	2061588	2061593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51561	NC_017278	AGGGC	2	10	2061603	2061612	20 %	0 %	60 %	20 %	384440452
51562	NC_017278	GAG	3	9	2061646	2061654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440452
51563	NC_017278	GCG	2	6	2061683	2061688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440452
51564	NC_017278	CCAGGG	2	12	2061729	2061740	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440452
51565	NC_017278	AGG	2	6	2061835	2061840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51566	NC_017278	AGG	2	6	2061853	2061858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51567	NC_017278	CAGGGA	2	12	2061864	2061875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384440453
51568	NC_017278	CAGC	2	8	2061881	2061888	25 %	0 %	25 %	50 %	384440453
51569	NC_017278	C	6	6	2061888	2061893	0 %	0 %	0 %	100 %	384440453
51570	NC_017278	AGG	2	6	2061919	2061924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51571	NC_017278	C	6	6	2061942	2061947	0 %	0 %	0 %	100 %	384440453
51572	NC_017278	CGGG	2	8	2061968	2061975	0 %	0 %	75 %	25 %	384440453
51573	NC_017278	AGG	2	6	2062033	2062038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51574	NC_017278	AGC	2	6	2062040	2062045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440453
51575	NC_017278	AGG	3	9	2062051	2062059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
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51577	NC_017278	AGG	2	6	2062072	2062077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51578	NC_017278	GCC	2	6	2062078	2062083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440453
51579	NC_017278	AGG	2	6	2062087	2062092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51580	NC_017278	GAG	3	9	2062104	2062112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51581	NC_017278	TCC	2	6	2062127	2062132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440453
51582	NC_017278	GGGCCA	2	12	2062145	2062156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440453
51583	NC_017278	AGG	3	9	2062162	2062170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440453
51584	NC_017278	CCCT	2	8	2062910	2062917	0 %	25 %	0 %	75 %	384440454
51585	NC_017278	GCCC	2	8	2062934	2062941	0 %	0 %	25 %	75 %	384440454
51586	NC_017278	C	6	6	2062979	2062984	0 %	0 %	0 %	100 %	384440454
51587	NC_017278	AGG	2	6	2063061	2063066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440454
51588	NC_017278	CCA	2	6	2063068	2063073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440454
51589	NC_017278	CGG	2	6	2063080	2063085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440454
51590	NC_017278	C	6	6	2063153	2063158	0 %	0 %	0 %	100 %	384440454
51591	NC_017278	AGG	3	9	2063247	2063255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440454
51592	NC_017278	GCC	2	6	2063301	2063306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440454
51593	NC_017278	C	7	7	2063305	2063311	0 %	0 %	0 %	100 %	384440454
51594	NC_017278	AGGGCC	2	12	2063313	2063324	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440454
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51597	NC_017278	CCG	2	6	2063441	2063446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440455
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51601	NC_017278	CTG	2	6	2063592	2063597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440455
51602	NC_017278	GTG	2	6	2063668	2063673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440455
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51605	NC_017278	GGC	3	9	2063714	2063722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440455
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51612	NC_017278	AGGC	2	8	2063967	2063974	25 %	0 %	50 %	25 %	384440456
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51616	NC_017278	G	6	6	2064063	2064068	0 %	0 %	100 %	0 %	384440456
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