MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_017278	GCC	2	6	2041444	2041449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51002	NC_017278	CGG	2	6	2041474	2041479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440431
51003	NC_017278	CTA	2	6	2041500	2041505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440431
51004	NC_017278	CCTGGC	2	12	2041518	2041529	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384440431
51005	NC_017278	C	7	7	2041539	2041545	0 %	0 %	0 %	100 %	384440431
51006	NC_017278	CAA	2	6	2041587	2041592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440431
51007	NC_017278	GCC	2	6	2041595	2041600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51008	NC_017278	ACT	2	6	2041634	2041639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440431
51009	NC_017278	C	6	6	2041671	2041676	0 %	0 %	0 %	100 %	384440431
51010	NC_017278	GCC	2	6	2041678	2041683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51011	NC_017278	GCC	2	6	2041687	2041692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51012	NC_017278	CCA	2	6	2041751	2041756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440431
51013	NC_017278	CGC	2	6	2041788	2041793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51014	NC_017278	AAC	2	6	2041828	2041833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440431
51015	NC_017278	CCA	2	6	2041860	2041865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440431
51016	NC_017278	TGG	2	6	2041922	2041927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440431
51017	NC_017278	GCC	2	6	2041945	2041950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440431
51018	NC_017278	TAC	2	6	2041951	2041956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440431
51019	NC_017278	GTG	2	6	2041957	2041962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440431
51020	NC_017278	AGG	2	6	2041964	2041969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51021	NC_017278	G	6	6	2041993	2041998	0 %	0 %	100 %	0 %	384440431
51022	NC_017278	TGG	2	6	2042006	2042011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440431
51023	NC_017278	CTC	2	6	2042040	2042045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440431
51024	NC_017278	CGA	3	9	2042049	2042057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440431
51025	NC_017278	GAG	2	6	2042077	2042082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51026	NC_017278	GAG	2	6	2042164	2042169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51027	NC_017278	AGG	2	6	2042177	2042182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51028	NC_017278	AGG	2	6	2042213	2042218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51029	NC_017278	GAG	2	6	2042221	2042226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51030	NC_017278	GGA	2	6	2042256	2042261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51031	NC_017278	CTC	2	6	2042305	2042310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440431
51032	NC_017278	GGA	2	6	2042313	2042318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51033	NC_017278	AGG	2	6	2042324	2042329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440431
51034	NC_017278	GAG	2	6	2042380	2042385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440432
51035	NC_017278	GTG	2	6	2042404	2042409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440432
51036	NC_017278	GGA	2	6	2042418	2042423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440432
51037	NC_017278	GGGGT	2	10	2042435	2042444	0 %	20 %	80 %	0 %	384440432
51038	NC_017278	C	6	6	2042501	2042506	0 %	0 %	0 %	100 %	384440432
51039	NC_017278	GGC	2	6	2042514	2042519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440432
51040	NC_017278	GGC	2	6	2042529	2042534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440432
51041	NC_017278	GCC	2	6	2042545	2042550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440432
51042	NC_017278	GGC	2	6	2042625	2042630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440432
51043	NC_017278	TGG	2	6	2042672	2042677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440432
51044	NC_017278	GGGGT	2	10	2042693	2042702	0 %	20 %	80 %	0 %	384440432
51045	NC_017278	CAC	3	9	2042713	2042721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440432
51046	NC_017278	CCG	2	6	2042753	2042758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440432
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51048	NC_017278	ACG	2	6	2042789	2042794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440432
51049	NC_017278	GCC	2	6	2042812	2042817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440432
51050	NC_017278	CGT	2	6	2042835	2042840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440432
51051	NC_017278	CGCT	2	8	2042866	2042873	0 %	25 %	25 %	50 %	384440432
51052	NC_017278	AGG	3	9	2042876	2042884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440432
51053	NC_017278	GAG	2	6	2042890	2042895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440432
51054	NC_017278	GGC	2	6	2042919	2042924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440432
51055	NC_017278	GGC	2	6	2042991	2042996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440432
51056	NC_017278	GGA	2	6	2042997	2043002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440432
51057	NC_017278	CCG	2	6	2043023	2043028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440432
51058	NC_017278	GGT	2	6	2043102	2043107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440432
51059	NC_017278	C	6	6	2043122	2043127	0 %	0 %	0 %	100 %	384440432
51060	NC_017278	TCA	2	6	2043140	2043145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440432
51061	NC_017278	GCC	2	6	2043154	2043159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440432
51062	NC_017278	CCT	3	9	2043183	2043191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440432
51063	NC_017278	C	8	8	2043194	2043201	0 %	0 %	0 %	100 %	384440432
51064	NC_017278	CCCCTA	2	12	2043225	2043236	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384440432
51065	NC_017278	ACT	2	6	2043302	2043307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440432
51066	NC_017278	GTG	2	6	2043367	2043372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440433
51067	NC_017278	TGG	2	6	2043395	2043400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440433
51068	NC_017278	AAG	2	6	2043418	2043423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440433
51069	NC_017278	TGA	2	6	2043443	2043448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440433
51070	NC_017278	CTCCC	2	10	2043469	2043478	0 %	20 %	0 %	80 %	384440433
51071	NC_017278	GAGG	2	8	2043510	2043517	25 %	0 %	75 %	0 %	384440433
51072	NC_017278	GGT	2	6	2043522	2043527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440433
51073	NC_017278	CTC	2	6	2043550	2043555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440433
51074	NC_017278	GAG	2	6	2043598	2043603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440433
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51077	NC_017278	CCCA	2	8	2043673	2043680	25 %	0 %	0 %	75 %	384440433
51078	NC_017278	C	7	7	2043710	2043716	0 %	0 %	0 %	100 %	384440433
51079	NC_017278	G	6	6	2043742	2043747	0 %	0 %	100 %	0 %	384440433
51080	NC_017278	CGC	2	6	2043765	2043770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440433
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51082	NC_017278	CGC	2	6	2043864	2043869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440433
51083	NC_017278	C	7	7	2043898	2043904	0 %	0 %	0 %	100 %	384440433
51084	NC_017278	AGG	2	6	2043917	2043922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440433
51085	NC_017278	CCTC	2	8	2043930	2043937	0 %	25 %	0 %	75 %	384440433
51086	NC_017278	TCCC	2	8	2043944	2043951	0 %	25 %	0 %	75 %	384440433
51087	NC_017278	C	8	8	2043965	2043972	0 %	0 %	0 %	100 %	384440433
51088	NC_017278	GGA	2	6	2043990	2043995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440433
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51091	NC_017278	ACCT	2	8	2044159	2044166	25 %	25 %	0 %	50 %	384440433
51092	NC_017278	GGT	2	6	2044185	2044190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440433
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51100	NC_017278	TCCA	2	8	2044552	2044559	25 %	25 %	0 %	50 %	384440433
51101	NC_017278	CAT	2	6	2044569	2044574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440433
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51109	NC_017278	G	6	6	2044760	2044765	0 %	0 %	100 %	0 %	384440434
51110	NC_017278	GCC	2	6	2044798	2044803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384440434
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51112	NC_017278	CCT	2	6	2044851	2044856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440434
51113	NC_017278	GCG	2	6	2044861	2044866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440434
51114	NC_017278	CAC	2	6	2044876	2044881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440434
51115	NC_017278	GGC	2	6	2044942	2044947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440434
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51117	NC_017278	G	7	7	2044978	2044984	0 %	0 %	100 %	0 %	384440434
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