MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 56109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017278	CAC	2	6	195893	195898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438574
4502	NC_017278	TGG	2	6	195922	195927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438574
4503	NC_017278	C	6	6	195949	195954	0 %	0 %	0 %	100 %	384438574
4504	NC_017278	CCT	2	6	195959	195964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4505	NC_017278	GGC	2	6	195980	195985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438574
4506	NC_017278	GAGG	2	8	195990	195997	25 %	0 %	75 %	0 %	384438574
4507	NC_017278	AGG	2	6	196066	196071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438574
4508	NC_017278	GGAC	2	8	196072	196079	25 %	0 %	50 %	25 %	384438574
4509	NC_017278	GGGC	2	8	196093	196100	0 %	0 %	75 %	25 %	384438574
4510	NC_017278	GCC	2	6	196111	196116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438574
4511	NC_017278	G	6	6	196165	196170	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4512	NC_017278	GGA	2	6	196181	196186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438574
4513	NC_017278	GAG	2	6	196236	196241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438574
4514	NC_017278	ACC	2	6	196269	196274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438574
4515	NC_017278	TCC	2	6	196291	196296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4516	NC_017278	GGCC	2	8	196328	196335	0 %	0 %	50 %	50 %	384438574
4517	NC_017278	GGCCCT	2	12	196358	196369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438574
4518	NC_017278	CG	3	6	196377	196382	0 %	0 %	50 %	50 %	384438574
4519	NC_017278	GAG	2	6	196389	196394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438574
4520	NC_017278	G	6	6	196394	196399	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4521	NC_017278	GGC	2	6	196402	196407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438574
4522	NC_017278	TCC	2	6	196408	196413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4523	NC_017278	GGCCT	2	10	196503	196512	0 %	20 %	40 %	40 %	384438574
4524	NC_017278	G	6	6	196519	196524	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4525	NC_017278	AGC	2	6	196552	196557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438574
4526	NC_017278	C	6	6	196642	196647	0 %	0 %	0 %	100 %	384438574
4527	NC_017278	G	6	6	196708	196713	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4528	NC_017278	CCT	2	6	196723	196728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4529	NC_017278	GCC	2	6	196737	196742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438574
4530	NC_017278	GAG	2	6	196755	196760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438574
4531	NC_017278	GGCA	2	8	196829	196836	25 %	0 %	50 %	25 %	384438574
4532	NC_017278	CCG	2	6	196861	196866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438574
4533	NC_017278	C	6	6	196930	196935	0 %	0 %	0 %	100 %	384438574
4534	NC_017278	CCT	2	6	196943	196948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4535	NC_017278	ACC	2	6	196954	196959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438574
4536	NC_017278	CCT	2	6	196961	196966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438574
4537	NC_017278	GGAG	2	8	196988	196995	25 %	0 %	75 %	0 %	384438574
4538	NC_017278	ACC	2	6	197011	197016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438574
4539	NC_017278	G	6	6	197099	197104	0 %	0 %	100 %	0 %	384438574
4540	NC_017278	CTA	2	6	197147	197152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438574
4541	NC_017278	GAA	2	6	197173	197178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438574
4542	NC_017278	GCC	2	6	197179	197184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438574
4543	NC_017278	TCA	2	6	197862	197867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438575
4544	NC_017278	GCC	2	6	197918	197923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438575
4545	NC_017278	CCGC	2	8	197943	197950	0 %	0 %	25 %	75 %	384438575
4546	NC_017278	AGCC	2	8	197992	197999	25 %	0 %	25 %	50 %	384438575
4547	NC_017278	TGGCC	2	10	198039	198048	0 %	20 %	40 %	40 %	384438575
4548	NC_017278	CTC	2	6	198089	198094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438575
4549	NC_017278	CTC	2	6	198107	198112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438575
4550	NC_017278	GGACC	2	10	198121	198130	20 %	0 %	40 %	40 %	384438575
4551	NC_017278	CCT	2	6	198160	198165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438575
4552	NC_017278	CTTC	2	8	198214	198221	0 %	50 %	0 %	50 %	384438575
4553	NC_017278	ACG	2	6	198225	198230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438575
4554	NC_017278	CTC	2	6	198235	198240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438575
4555	NC_017278	GGA	2	6	198367	198372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438575
4556	NC_017278	GA	3	6	198474	198479	50 %	0 %	50 %	0 %	384438575
4557	NC_017278	GGC	2	6	198492	198497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438575
4558	NC_017278	GCG	2	6	198514	198519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438575
4559	NC_017278	GTG	2	6	198527	198532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438575
4560	NC_017278	CACG	2	8	198673	198680	25 %	0 %	25 %	50 %	384438575
4561	NC_017278	G	6	6	198687	198692	0 %	0 %	100 %	0 %	384438575
4562	NC_017278	TGC	2	6	198759	198764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438575
4563	NC_017278	AAG	2	6	198788	198793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384438575
4564	NC_017278	CGGG	2	8	198821	198828	0 %	0 %	75 %	25 %	384438575
4565	NC_017278	GGA	2	6	198875	198880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438575
4566	NC_017278	GTG	2	6	199619	199624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4567	NC_017278	AAC	2	6	199637	199642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438576
4568	NC_017278	AAC	2	6	199763	199768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438576
4569	NC_017278	C	6	6	199916	199921	0 %	0 %	0 %	100 %	384438576
4570	NC_017278	GTA	2	6	200033	200038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384438576
4571	NC_017278	AACCA	2	10	200105	200114	60 %	0 %	0 %	40 %	384438576
4572	NC_017278	ATGG	2	8	200267	200274	25 %	25 %	50 %	0 %	384438576
4573	NC_017278	TTCC	2	8	200344	200351	0 %	50 %	0 %	50 %	384438576
4574	NC_017278	TGGG	2	8	200393	200400	0 %	25 %	75 %	0 %	384438576
4575	NC_017278	AACCC	2	10	200458	200467	40 %	0 %	0 %	60 %	384438576
4576	NC_017278	TGG	2	6	200520	200525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4577	NC_017278	ACT	2	6	200556	200561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438576
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4579	NC_017278	GGT	2	6	200715	200720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4580	NC_017278	CAA	3	9	200773	200781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384438576
4581	NC_017278	CCG	2	6	200841	200846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438576
4582	NC_017278	TGG	2	6	200901	200906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4583	NC_017278	CTG	2	6	200975	200980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384438576
4584	NC_017278	CACCCC	2	12	201010	201021	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	384438576
4585	NC_017278	C	7	7	201018	201024	0 %	0 %	0 %	100 %	384438576
4586	NC_017278	GGCT	2	8	201029	201036	0 %	25 %	50 %	25 %	384438576
4587	NC_017278	C	6	6	201047	201052	0 %	0 %	0 %	100 %	384438576
4588	NC_017278	CCT	2	6	201094	201099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438576
4589	NC_017278	TGG	2	6	201123	201128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4590	NC_017278	GAC	2	6	201146	201151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438576
4591	NC_017278	TGGG	2	8	201156	201163	0 %	25 %	75 %	0 %	384438576
4592	NC_017278	ACG	2	6	201174	201179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438576
4593	NC_017278	CGG	2	6	201190	201195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438576
4594	NC_017278	AGG	2	6	201199	201204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438576
4595	NC_017278	GCG	2	6	201210	201215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438576
4596	NC_017278	ACGG	2	8	201230	201237	25 %	0 %	50 %	25 %	384438576
4597	NC_017278	CCT	2	6	201297	201302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438576
4598	NC_017278	CT	3	6	201317	201322	0 %	50 %	0 %	50 %	384438576
4599	NC_017278	ACG	2	6	201351	201356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438576
4600	NC_017278	CCT	2	6	201378	201383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438576
4601	NC_017278	TCC	2	6	201404	201409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384438576
4602	NC_017278	GGC	2	6	201433	201438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384438576
4603	NC_017278	GCC	2	6	201492	201497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384438576
4604	NC_017278	CCGGC	2	10	201559	201568	0 %	0 %	40 %	60 %	384438576
4605	NC_017278	CCCCG	2	10	201600	201609	0 %	0 %	20 %	80 %	384438576
4606	NC_017278	AGG	2	6	201849	201854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438576
4607	NC_017278	GGT	2	6	201880	201885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4608	NC_017278	G	6	6	201886	201891	0 %	0 %	100 %	0 %	384438576
4609	NC_017278	CAC	2	6	201946	201951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438576
4610	NC_017278	CTT	2	6	202051	202056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384438576
4611	NC_017278	AGC	2	6	202070	202075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384438576
4612	NC_017278	CAC	2	6	202120	202125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438576
4613	NC_017278	TCCT	2	8	202127	202134	0 %	50 %	0 %	50 %	384438576
4614	NC_017278	GGT	2	6	202177	202182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438576
4615	NC_017278	CGGGTG	2	12	202235	202246	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384438576
4616	NC_017278	TGGCCC	2	12	202300	202311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384438577
4617	NC_017278	GGCC	2	8	202361	202368	0 %	0 %	50 %	50 %	384438577
4618	NC_017278	G	6	6	202385	202390	0 %	0 %	100 %	0 %	384438577
4619	NC_017278	CCA	2	6	202411	202416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438577
4620	NC_017278	CCA	2	6	202456	202461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438577
4621	NC_017278	GTGGGT	2	12	202523	202534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384438577
4622	NC_017278	GAG	2	6	202538	202543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384438577
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4624	NC_017278	CCA	2	6	202612	202617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384438577
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4996	NC_017278	TAC	2	6	216658	216663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384438590
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