MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 9420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017273	CTT	2	6	122	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432130
2	NC_017273	CAC	2	6	135	140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432130
3	NC_017273	AGT	3	9	208	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432130
4	NC_017273	GCT	2	6	225	230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432130
5	NC_017273	CTCC	2	8	304	311	0 %	25 %	0 %	75 %	384432130
6	NC_017273	CG	3	6	366	371	0 %	0 %	50 %	50 %	384432130
7	NC_017273	AAG	2	6	489	494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432130
8	NC_017273	TGA	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432130
9	NC_017273	CAC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432130
10	NC_017273	TCCG	2	8	778	785	0 %	25 %	25 %	50 %	384432130
11	NC_017273	ACC	2	6	834	839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432130
12	NC_017273	GAA	2	6	875	880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432130
13	NC_017273	CAG	2	6	891	896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432130
14	NC_017273	GGC	2	6	946	951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432130
15	NC_017273	GT	3	6	1064	1069	0 %	50 %	50 %	0 %	384432130
16	NC_017273	GAG	2	6	1151	1156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432130
17	NC_017273	GTTG	2	8	1178	1185	0 %	50 %	50 %	0 %	384432130
18	NC_017273	CTAT	2	8	1231	1238	25 %	50 %	0 %	25 %	384432131
19	NC_017273	TGC	2	6	1268	1273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432131
20	NC_017273	TGGCA	2	10	1285	1294	20 %	20 %	40 %	20 %	384432131
21	NC_017273	GGA	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432131
22	NC_017273	T	6	6	1329	1334	0 %	100 %	0 %	0 %	384432131
23	NC_017273	GCA	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432131
24	NC_017273	GGA	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432131
25	NC_017273	CTCG	2	8	1479	1486	0 %	25 %	25 %	50 %	384432131
26	NC_017273	CAT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432131
27	NC_017273	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432131
28	NC_017273	TCT	2	6	1659	1664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432131
29	NC_017273	CGG	2	6	1696	1701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432131
30	NC_017273	TGG	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432131
31	NC_017273	TGG	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432131
32	NC_017273	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432131
33	NC_017273	TAG	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432131
34	NC_017273	CT	3	6	1905	1910	0 %	50 %	0 %	50 %	384432131
35	NC_017273	TTG	2	6	2003	2008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432131
36	NC_017273	CCGG	2	8	2075	2082	0 %	0 %	50 %	50 %	384432131
37	NC_017273	CTG	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432131
38	NC_017273	GAG	2	6	2257	2262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432131
39	NC_017273	TTG	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432132
40	NC_017273	CTC	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432132
41	NC_017273	ATG	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432132
42	NC_017273	ATGA	2	8	2643	2650	50 %	25 %	25 %	0 %	384432132
43	NC_017273	GAT	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432132
44	NC_017273	GTCG	2	8	2814	2821	0 %	25 %	50 %	25 %	384432132
45	NC_017273	G	6	6	3050	3055	0 %	0 %	100 %	0 %	384432132
46	NC_017273	CGAC	2	8	3161	3168	25 %	0 %	25 %	50 %	384432132
47	NC_017273	ACT	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432132
48	NC_017273	CCGT	2	8	3226	3233	0 %	25 %	25 %	50 %	384432132
49	NC_017273	AC	3	6	3298	3303	50 %	0 %	0 %	50 %	384432132
50	NC_017273	CTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432132
51	NC_017273	CGC	2	6	3369	3374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432132
52	NC_017273	TGG	2	6	3453	3458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432133
53	NC_017273	AAT	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384432133
54	NC_017273	GTG	2	6	3563	3568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432133
55	NC_017273	GCC	2	6	3599	3604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432133
56	NC_017273	GGT	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432133
57	NC_017273	GCG	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432133
58	NC_017273	GCC	2	6	3680	3685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432133
59	NC_017273	CTC	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432133
60	NC_017273	GGA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432133
61	NC_017273	AAG	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432133
62	NC_017273	CTTCT	2	10	3794	3803	0 %	60 %	0 %	40 %	384432133
63	NC_017273	GCA	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432133
64	NC_017273	GCG	2	6	4034	4039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432133
65	NC_017273	TCC	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432133
66	NC_017273	CG	3	6	4047	4052	0 %	0 %	50 %	50 %	384432133
67	NC_017273	GCCCAT	2	12	4055	4066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384432133
68	NC_017273	G	6	6	4183	4188	0 %	0 %	100 %	0 %	384432133
69	NC_017273	CTC	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432133
70	NC_017273	TTC	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432133
71	NC_017273	TGG	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432133
72	NC_017273	GGA	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432133
73	NC_017273	AGGA	2	8	4301	4308	50 %	0 %	50 %	0 %	384432133
74	NC_017273	CTGG	2	8	4324	4331	0 %	25 %	50 %	25 %	384432133
75	NC_017273	CTC	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432133
76	NC_017273	ACCT	2	8	4364	4371	25 %	25 %	0 %	50 %	384432133
77	NC_017273	CCT	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432133
78	NC_017273	GCC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432133
79	NC_017273	TGG	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432133
80	NC_017273	GGTG	2	8	4489	4496	0 %	25 %	75 %	0 %	384432133
81	NC_017273	GGCCTC	2	12	4598	4609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384432133
82	NC_017273	TCG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432133
83	NC_017273	CCG	2	6	4687	4692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432133
84	NC_017273	C	7	7	4744	4750	0 %	0 %	0 %	100 %	384432134
85	NC_017273	GC	3	6	4814	4819	0 %	0 %	50 %	50 %	384432134
86	NC_017273	CG	3	6	4935	4940	0 %	0 %	50 %	50 %	384432134
87	NC_017273	ATCG	2	8	4972	4979	25 %	25 %	25 %	25 %	384432134
88	NC_017273	AGT	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432134
89	NC_017273	CTA	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432134
90	NC_017273	TCA	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432134
91	NC_017273	ATG	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432134
92	NC_017273	CA	3	6	5230	5235	50 %	0 %	0 %	50 %	384432134
93	NC_017273	AAGA	2	8	5236	5243	75 %	0 %	25 %	0 %	384432134
94	NC_017273	TGCCT	2	10	5289	5298	0 %	40 %	20 %	40 %	384432134
95	NC_017273	GGAA	2	8	5354	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	384432134
96	NC_017273	ATG	2	6	5455	5460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432134
97	NC_017273	GAG	3	9	5461	5469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432134
98	NC_017273	AAG	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432134
99	NC_017273	A	6	6	5513	5518	100 %	0 %	0 %	0 %	384432134
100	NC_017273	ATTC	2	8	5568	5575	25 %	50 %	0 %	25 %	384432134
101	NC_017273	TAC	2	6	5610	5615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432134
102	NC_017273	TGG	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432134
103	NC_017273	GCA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432134
104	NC_017273	ATCT	2	8	5746	5753	25 %	50 %	0 %	25 %	384432134
105	NC_017273	GCG	2	6	6110	6115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432134
106	NC_017273	TCA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432134
107	NC_017273	TGC	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432134
108	NC_017273	CTG	2	6	6493	6498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432135
109	NC_017273	GCC	2	6	6511	6516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432135
110	NC_017273	TAC	2	6	6646	6651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432135
111	NC_017273	CGCC	2	8	6672	6679	0 %	0 %	25 %	75 %	384432135
112	NC_017273	CGC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432135
113	NC_017273	GAG	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432135
114	NC_017273	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432135
115	NC_017273	GCGGGG	2	12	7041	7052	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384432135
116	NC_017273	TGC	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432135
117	NC_017273	TCG	2	6	7073	7078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432135
118	NC_017273	AGG	2	6	7100	7105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432135
119	NC_017273	CCG	2	6	7110	7115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432135
120	NC_017273	GTG	2	6	7147	7152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432135
121	NC_017273	G	6	6	7220	7225	0 %	0 %	100 %	0 %	384432135
122	NC_017273	CGGGG	2	10	7230	7239	0 %	0 %	80 %	20 %	384432135
123	NC_017273	GAG	2	6	7246	7251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432135
124	NC_017273	G	6	6	7286	7291	0 %	0 %	100 %	0 %	384432135
125	NC_017273	TGG	2	6	7307	7312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432135
126	NC_017273	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432135
127	NC_017273	G	6	6	7322	7327	0 %	0 %	100 %	0 %	384432135
128	NC_017273	TGC	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432135
129	NC_017273	GCA	2	6	7385	7390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432135
130	NC_017273	GAG	2	6	7422	7427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432135
131	NC_017273	AGG	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432135
132	NC_017273	G	6	6	7517	7522	0 %	0 %	100 %	0 %	384432135
133	NC_017273	C	6	6	7589	7594	0 %	0 %	0 %	100 %	384432135
134	NC_017273	TGG	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432136
135	NC_017273	GGC	2	6	7897	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432136
136	NC_017273	CTC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432136
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139	NC_017273	CGG	3	9	8088	8096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432136
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141	NC_017273	GGCGG	2	10	8125	8134	0 %	0 %	80 %	20 %	384432136
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262	NC_017273	CTTCC	2	10	15249	15258	0 %	40 %	0 %	60 %	384432139
263	NC_017273	TGA	2	6	15263	15268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432139
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266	NC_017273	C	6	6	15526	15531	0 %	0 %	0 %	100 %	384432139
267	NC_017273	AGGCC	2	10	15647	15656	20 %	0 %	40 %	40 %	384432139
268	NC_017273	GTA	2	6	15663	15668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432139
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271	NC_017273	C	7	7	15777	15783	0 %	0 %	0 %	100 %	384432139
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392	NC_017273	CGCCCT	2	12	21202	21213	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384432146
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395	NC_017273	AGG	2	6	21336	21341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432146
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400	NC_017273	TGG	2	6	21510	21515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432146
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