MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 9420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017273	GCC	2	6	108704	108709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432232
2503	NC_017273	CCT	2	6	108733	108738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432232
2504	NC_017273	TC	3	6	108739	108744	0 %	50 %	0 %	50 %	384432232
2505	NC_017273	TC	3	6	108751	108756	0 %	50 %	0 %	50 %	384432232
2506	NC_017273	GAG	2	6	108854	108859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2507	NC_017273	GAG	2	6	108878	108883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2508	NC_017273	CTC	2	6	108923	108928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432232
2509	NC_017273	GGC	2	6	108934	108939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432232
2510	NC_017273	GGC	2	6	108952	108957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432232
2511	NC_017273	GGC	2	6	108992	108997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432232
2512	NC_017273	CGGG	2	8	109044	109051	0 %	0 %	75 %	25 %	384432232
2513	NC_017273	CCT	2	6	109078	109083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432232
2514	NC_017273	GGA	2	6	109102	109107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2515	NC_017273	GAGG	2	8	109114	109121	25 %	0 %	75 %	0 %	384432232
2516	NC_017273	GAG	2	6	109163	109168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2517	NC_017273	GGA	2	6	109171	109176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2518	NC_017273	GGA	2	6	109312	109317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432232
2519	NC_017273	TGG	2	6	109416	109421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432232
2520	NC_017273	GGGA	2	8	109431	109438	25 %	0 %	75 %	0 %	384432232
2521	NC_017273	CAG	2	6	109460	109465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432232
2522	NC_017273	GCG	2	6	109492	109497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432232
2523	NC_017273	GCG	2	6	109506	109511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432232
2524	NC_017273	CCA	2	6	110233	110238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432233
2525	NC_017273	CAC	2	6	110321	110326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432233
2526	NC_017273	CTC	3	9	110459	110467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432233
2527	NC_017273	CTC	2	6	110510	110515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432233
2528	NC_017273	GTA	2	6	110534	110539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432233
2529	NC_017273	CTCC	2	8	110545	110552	0 %	25 %	0 %	75 %	384432233
2530	NC_017273	CCT	2	6	110569	110574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432233
2531	NC_017273	CCG	2	6	110622	110627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432233
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2533	NC_017273	GGA	2	6	110815	110820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432234
2534	NC_017273	TCCCC	2	10	110918	110927	0 %	20 %	0 %	80 %	384432234
2535	NC_017273	CGC	2	6	111157	111162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432235
2536	NC_017273	CGG	2	6	111235	111240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432235
2537	NC_017273	CCTGG	2	10	111267	111276	0 %	20 %	40 %	40 %	384432235
2538	NC_017273	TGTACG	2	12	111299	111310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384432235
2539	NC_017273	CG	3	6	111315	111320	0 %	0 %	50 %	50 %	384432235
2540	NC_017273	CGC	2	6	111366	111371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432235
2541	NC_017273	CGGG	2	8	111451	111458	0 %	0 %	75 %	25 %	384432235
2542	NC_017273	GGC	2	6	111620	111625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432235
2543	NC_017273	TGG	2	6	111640	111645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432235
2544	NC_017273	CTT	2	6	111674	111679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432235
2545	NC_017273	GAG	2	6	111734	111739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432236
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2551	NC_017273	G	6	6	111962	111967	0 %	0 %	100 %	0 %	384432236
2552	NC_017273	CGG	2	6	111997	112002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432236
2553	NC_017273	C	7	7	112022	112028	0 %	0 %	0 %	100 %	384432236
2554	NC_017273	C	6	6	112064	112069	0 %	0 %	0 %	100 %	384432236
2555	NC_017273	AGGG	2	8	112592	112599	25 %	0 %	75 %	0 %	384432237
2556	NC_017273	CTT	2	6	112610	112615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432237
2557	NC_017273	TGA	2	6	112627	112632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432237
2558	NC_017273	CCT	3	9	112642	112650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432237
2559	NC_017273	CTC	2	6	113218	113223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432238
2560	NC_017273	C	6	6	113223	113228	0 %	0 %	0 %	100 %	384432238
2561	NC_017273	CAC	2	6	113236	113241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432238
2562	NC_017273	CTT	2	6	113289	113294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432238
2563	NC_017273	GCG	2	6	113302	113307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432238
2564	NC_017273	CGC	2	6	113345	113350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432238
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2570	NC_017273	TCC	2	6	113603	113608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432238
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2573	NC_017273	GAG	2	6	113662	113667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432238
2574	NC_017273	GGA	2	6	113673	113678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432238
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2578	NC_017273	C	7	7	113901	113907	0 %	0 %	0 %	100 %	384432238
2579	NC_017273	AGG	2	6	113933	113938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432238
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2587	NC_017273	GAA	2	6	115585	115590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432239
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2590	NC_017273	GGGCA	2	10	115640	115649	20 %	0 %	60 %	20 %	384432239
2591	NC_017273	C	6	6	115665	115670	0 %	0 %	0 %	100 %	384432239
2592	NC_017273	CAC	2	6	115688	115693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432239
2593	NC_017273	CGGG	2	8	115695	115702	0 %	0 %	75 %	25 %	384432239
2594	NC_017273	CCG	2	6	115723	115728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432239
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2597	NC_017273	ACC	2	6	115875	115880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432240
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2599	NC_017273	GCCC	2	8	115910	115917	0 %	0 %	25 %	75 %	384432240
2600	NC_017273	CCT	2	6	115984	115989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432240
2601	NC_017273	TGG	2	6	116004	116009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432240
2602	NC_017273	ACG	2	6	116037	116042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432240
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2604	NC_017273	CTC	2	6	116107	116112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432241
2605	NC_017273	GAG	2	6	116134	116139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432241
2606	NC_017273	CCG	2	6	116154	116159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432241
2607	NC_017273	GCG	2	6	116171	116176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432241
2608	NC_017273	CTC	2	6	116224	116229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432241
2609	NC_017273	GGC	2	6	116247	116252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432241
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2611	NC_017273	GTG	4	12	116284	116295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432241
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2614	NC_017273	G	7	7	116354	116360	0 %	0 %	100 %	0 %	384432241
2615	NC_017273	GGA	2	6	116367	116372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432241
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2617	NC_017273	CGCT	2	8	117544	117551	0 %	25 %	25 %	50 %	384432242
2618	NC_017273	AAG	2	6	117629	117634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432242
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2620	NC_017273	TTG	2	6	117659	117664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432242
2621	NC_017273	GCC	2	6	117738	117743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432242
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2864	NC_017273	GTG	2	6	131982	131987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432255
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2992	NC_017273	TCC	2	6	142437	142442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432267
2993	NC_017273	CCCG	2	8	142489	142496	0 %	0 %	25 %	75 %	384432267
2994	NC_017273	CTT	2	6	142524	142529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432267
2995	NC_017273	GCA	2	6	142553	142558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432267
2996	NC_017273	C	6	6	142625	142630	0 %	0 %	0 %	100 %	384432267
2997	NC_017273	CGTG	2	8	142637	142644	0 %	25 %	50 %	25 %	384432267
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2999	NC_017273	GCC	2	6	142799	142804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432267
3000	NC_017273	CCG	2	6	142818	142823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432267

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