MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 9420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017273	TCC	2	6	66418	66423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432202
1502	NC_017273	CGT	2	6	66446	66451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432202
1503	NC_017273	GCAG	2	8	66520	66527	25 %	0 %	50 %	25 %	384432202
1504	NC_017273	GCC	2	6	66562	66567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432202
1505	NC_017273	CCT	2	6	66568	66573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432202
1506	NC_017273	G	6	6	66598	66603	0 %	0 %	100 %	0 %	384432202
1507	NC_017273	CCG	2	6	66632	66637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432202
1508	NC_017273	GAG	2	6	66654	66659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432202
1509	NC_017273	CTC	2	6	66669	66674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432202
1510	NC_017273	GGTA	2	8	66703	66710	25 %	25 %	50 %	0 %	384432202
1511	NC_017273	CCA	2	6	66776	66781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432202
1512	NC_017273	CCCT	2	8	66785	66792	0 %	25 %	0 %	75 %	384432202
1513	NC_017273	CCA	2	6	66836	66841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432202
1514	NC_017273	C	6	6	66842	66847	0 %	0 %	0 %	100 %	384432202
1515	NC_017273	AGG	3	9	66856	66864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432202
1516	NC_017273	GAA	2	6	66908	66913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432202
1517	NC_017273	GCC	2	6	66921	66926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432202
1518	NC_017273	CCT	2	6	66970	66975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432203
1519	NC_017273	GCC	2	6	66990	66995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432203
1520	NC_017273	AGTGGT	2	12	67120	67131	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384432203
1521	NC_017273	CTT	2	6	67144	67149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432203
1522	NC_017273	CCA	2	6	67189	67194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432203
1523	NC_017273	ACC	2	6	67266	67271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432203
1524	NC_017273	AGG	3	9	67296	67304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432203
1525	NC_017273	CCAGG	2	10	67361	67370	20 %	0 %	40 %	40 %	384432203
1526	NC_017273	CCA	2	6	67387	67392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432203
1527	NC_017273	CCAGGT	2	12	67402	67413	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432203
1528	NC_017273	G	7	7	67465	67471	0 %	0 %	100 %	0 %	384432203
1529	NC_017273	CTC	2	6	67526	67531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432203
1530	NC_017273	CCT	2	6	67624	67629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432203
1531	NC_017273	AGA	2	6	67666	67671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432203
1532	NC_017273	CGG	2	6	67683	67688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432203
1533	NC_017273	GGGGTA	2	12	67719	67730	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384432203
1534	NC_017273	ACC	2	6	67737	67742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432203
1535	NC_017273	C	6	6	67813	67818	0 %	0 %	0 %	100 %	384432203
1536	NC_017273	GCCACC	2	12	67845	67856	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384432203
1537	NC_017273	TCC	2	6	67965	67970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1538	NC_017273	GCC	2	6	68000	68005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432204
1539	NC_017273	GGT	3	9	68028	68036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432204
1540	NC_017273	ACC	2	6	68099	68104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432204
1541	NC_017273	CCT	2	6	68118	68123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1542	NC_017273	CCA	2	6	68253	68258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432204
1543	NC_017273	CTC	2	6	68303	68308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1544	NC_017273	TCC	2	6	68309	68314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1545	NC_017273	GCC	2	6	68330	68335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432204
1546	NC_017273	GCC	2	6	68345	68350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432204
1547	NC_017273	CCT	2	6	68397	68402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1548	NC_017273	GGA	3	9	68496	68504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432204
1549	NC_017273	CCT	2	6	68517	68522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1550	NC_017273	CCT	2	6	68574	68579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432204
1551	NC_017273	GGA	2	6	68592	68597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432204
1552	NC_017273	CG	3	6	68623	68628	0 %	0 %	50 %	50 %	384432204
1553	NC_017273	CA	3	6	68629	68634	50 %	0 %	0 %	50 %	384432204
1554	NC_017273	GAG	2	6	68834	68839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432205
1555	NC_017273	CCT	2	6	68845	68850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432205
1556	NC_017273	CGG	2	6	68887	68892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432205
1557	NC_017273	GAA	2	6	68969	68974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432205
1558	NC_017273	C	6	6	68983	68988	0 %	0 %	0 %	100 %	384432205
1559	NC_017273	C	6	6	68994	68999	0 %	0 %	0 %	100 %	384432205
1560	NC_017273	CTT	2	6	69046	69051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432205
1561	NC_017273	ACCG	2	8	69102	69109	25 %	0 %	25 %	50 %	384432205
1562	NC_017273	GGA	2	6	69163	69168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432205
1563	NC_017273	GTCCAG	2	12	69224	69235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432205
1564	NC_017273	CCGCT	2	10	69263	69272	0 %	20 %	20 %	60 %	384432205
1565	NC_017273	TGC	2	6	69286	69291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432205
1566	NC_017273	CCT	2	6	69340	69345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432205
1567	NC_017273	GGC	2	6	69359	69364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432205
1568	NC_017273	TCCAGG	2	12	69369	69380	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432205
1569	NC_017273	GCC	2	6	69393	69398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432205
1570	NC_017273	CCG	2	6	69458	69463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432205
1571	NC_017273	GCC	2	6	69511	69516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432205
1572	NC_017273	GAAC	2	8	69520	69527	50 %	0 %	25 %	25 %	384432205
1573	NC_017273	C	7	7	69614	69620	0 %	0 %	0 %	100 %	384432205
1574	NC_017273	CCT	2	6	69658	69663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432205
1575	NC_017273	GGC	2	6	69688	69693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432205
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1577	NC_017273	GAG	2	6	69838	69843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432206
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1579	NC_017273	CGG	2	6	69932	69937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432206
1580	NC_017273	GCG	2	6	70000	70005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432206
1581	NC_017273	CCA	3	9	70014	70022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432206
1582	NC_017273	CGC	2	6	70038	70043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432206
1583	NC_017273	CCA	2	6	70095	70100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432206
1584	NC_017273	TCC	2	6	70112	70117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432206
1585	NC_017273	GTG	3	9	70141	70149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432206
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1587	NC_017273	CCA	2	6	70212	70217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432206
1588	NC_017273	CTC	2	6	70225	70230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432206
1589	NC_017273	CCGG	2	8	70248	70255	0 %	0 %	50 %	50 %	384432206
1590	NC_017273	CG	3	6	70264	70269	0 %	0 %	50 %	50 %	384432206
1591	NC_017273	GAG	2	6	70312	70317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432206
1592	NC_017273	GCC	2	6	70349	70354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432206
1593	NC_017273	CTC	2	6	70465	70470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432206
1594	NC_017273	GCTC	2	8	70515	70522	0 %	25 %	25 %	50 %	384432206
1595	NC_017273	CCT	2	6	70681	70686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432207
1596	NC_017273	GCCTG	2	10	70696	70705	0 %	20 %	40 %	40 %	384432207
1597	NC_017273	AGG	2	6	70759	70764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432207
1598	NC_017273	ACC	2	6	70797	70802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1599	NC_017273	CCGC	2	8	70809	70816	0 %	0 %	25 %	75 %	384432207
1600	NC_017273	CCT	2	6	70825	70830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432207
1601	NC_017273	TGGA	2	8	70986	70993	25 %	25 %	50 %	0 %	384432207
1602	NC_017273	CCA	2	6	71011	71016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1603	NC_017273	CAC	2	6	71021	71026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1604	NC_017273	TCA	3	9	71068	71076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432207
1605	NC_017273	ACC	3	9	71100	71108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1606	NC_017273	GCCA	2	8	71349	71356	25 %	0 %	25 %	50 %	384432207
1607	NC_017273	CCT	2	6	71377	71382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432207
1608	NC_017273	GGT	2	6	71399	71404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432207
1609	NC_017273	CCA	2	6	71455	71460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1610	NC_017273	CCT	2	6	71599	71604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432207
1611	NC_017273	C	6	6	71627	71632	0 %	0 %	0 %	100 %	384432207
1612	NC_017273	CTG	2	6	71754	71759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432207
1613	NC_017273	ACCCC	2	10	71766	71775	20 %	0 %	0 %	80 %	384432207
1614	NC_017273	AGC	2	6	71784	71789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432207
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1616	NC_017273	CGG	3	9	71843	71851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432207
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1618	NC_017273	TCC	2	6	71886	71891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432207
1619	NC_017273	ACC	2	6	71937	71942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432207
1620	NC_017273	AAG	2	6	71996	72001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432207
1621	NC_017273	CGT	2	6	72052	72057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432207
1622	NC_017273	TGG	2	6	72166	72171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432207
1623	NC_017273	GCC	2	6	72177	72182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432207
1624	NC_017273	TGG	2	6	72196	72201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432207
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