MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46502	NC_017272	ACT	2	6	1846911	1846916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432112
46503	NC_017272	CAG	2	6	1846940	1846945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432112
46504	NC_017272	CCA	2	6	1846963	1846968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432112
46505	NC_017272	GTG	2	6	1846973	1846978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
46506	NC_017272	CGGC	2	8	1846987	1846994	0 %	0 %	50 %	50 %	384432112
46507	NC_017272	AGGCC	2	10	1847041	1847050	20 %	0 %	40 %	40 %	384432112
46508	NC_017272	TGG	2	6	1847086	1847091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432113
46509	NC_017272	GCG	2	6	1847146	1847151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432113
46510	NC_017272	GCT	2	6	1847236	1847241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432113
46511	NC_017272	C	6	6	1847251	1847256	0 %	0 %	0 %	100 %	384432113
46512	NC_017272	GTG	2	6	1847346	1847351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432113
46513	NC_017272	CGGGGA	2	12	1847360	1847371	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384432113
46514	NC_017272	GCC	2	6	1847410	1847415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432113
46515	NC_017272	CCT	2	6	1847426	1847431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
46516	NC_017272	AACCC	2	10	1847524	1847533	40 %	0 %	0 %	60 %	384432113
46517	NC_017272	CTC	3	9	1847553	1847561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
46518	NC_017272	ACG	2	6	1847605	1847610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432113
46519	NC_017272	TCA	2	6	1847629	1847634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432113
46520	NC_017272	TCC	2	6	1847665	1847670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
46521	NC_017272	TCC	2	6	1847674	1847679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432113
46522	NC_017272	GGA	3	9	1847744	1847752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432113
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46524	NC_017272	G	6	6	1847839	1847844	0 %	0 %	100 %	0 %	384432113
46525	NC_017272	TCT	2	6	1847863	1847868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432113
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46528	NC_017272	CCTT	2	8	1848018	1848025	0 %	50 %	0 %	50 %	384432114
46529	NC_017272	CCT	2	6	1848085	1848090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432114
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46534	NC_017272	GTA	2	6	1848224	1848229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432114
46535	NC_017272	C	6	6	1848230	1848235	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
46536	NC_017272	AGG	2	6	1848279	1848284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432114
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46538	NC_017272	GGGGA	2	10	1848327	1848336	20 %	0 %	80 %	0 %	384432114
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46543	NC_017272	CCT	3	9	1848457	1848465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432114
46544	NC_017272	GAG	2	6	1848518	1848523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432114
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46550	NC_017272	C	6	6	1848716	1848721	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
46551	NC_017272	C	6	6	1848761	1848766	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
46552	NC_017272	GCC	2	6	1848842	1848847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432114
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46555	NC_017272	GCC	2	6	1848942	1848947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432114
46556	NC_017272	C	6	6	1848946	1848951	0 %	0 %	0 %	100 %	384432114
46557	NC_017272	GGC	2	6	1849012	1849017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432114
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46583	NC_017272	CCGGG	2	10	1849947	1849956	0 %	0 %	60 %	40 %	384432115
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46585	NC_017272	CCAC	2	8	1849981	1849988	25 %	0 %	0 %	75 %	384432115
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46590	NC_017272	GAA	2	6	1850246	1850251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432115
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46608	NC_017272	CGT	2	6	1851133	1851138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432116
46609	NC_017272	GCCCA	2	10	1851170	1851179	20 %	0 %	20 %	60 %	384432116
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46611	NC_017272	GGGCG	2	10	1851352	1851361	0 %	0 %	80 %	20 %	384432116
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46614	NC_017272	G	6	6	1851486	1851491	0 %	0 %	100 %	0 %	384432116
46615	NC_017272	CCT	2	6	1851535	1851540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432116
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.