MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_017272	AGGACC	2	12	1829349	1829360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432089
46002	NC_017272	GAA	2	6	1829390	1829395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432089
46003	NC_017272	GTG	2	6	1829399	1829404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432089
46004	NC_017272	CCT	2	6	1829485	1829490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432090
46005	NC_017272	GGC	2	6	1829497	1829502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432090
46006	NC_017272	CCA	2	6	1829557	1829562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432090
46007	NC_017272	TCC	2	6	1829571	1829576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432090
46008	NC_017272	CGGGG	3	15	1829599	1829613	0 %	0 %	80 %	20 %	384432090
46009	NC_017272	GGCC	2	8	1829614	1829621	0 %	0 %	50 %	50 %	384432090
46010	NC_017272	ACC	2	6	1829622	1829627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432090
46011	NC_017272	GGC	2	6	1829675	1829680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432090
46012	NC_017272	CCAC	2	8	1829692	1829699	25 %	0 %	0 %	75 %	384432090
46013	NC_017272	GGTG	2	8	1829719	1829726	0 %	25 %	75 %	0 %	384432090
46014	NC_017272	CGG	2	6	1829731	1829736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432090
46015	NC_017272	CCA	2	6	1829743	1829748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432090
46016	NC_017272	CGC	2	6	1829830	1829835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432090
46017	NC_017272	ACC	2	6	1829841	1829846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432090
46018	NC_017272	CTC	2	6	1829900	1829905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432090
46019	NC_017272	TGGGCT	2	12	1829914	1829925	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384432090
46020	NC_017272	C	6	6	1829931	1829936	0 %	0 %	0 %	100 %	384432090
46021	NC_017272	CCT	2	6	1829989	1829994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432090
46022	NC_017272	GCC	2	6	1830079	1830084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432090
46023	NC_017272	TCACC	2	10	1830125	1830134	20 %	20 %	0 %	60 %	384432091
46024	NC_017272	TCC	2	6	1830152	1830157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432091
46025	NC_017272	GAA	2	6	1830181	1830186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432091
46026	NC_017272	GCG	2	6	1830187	1830192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432091
46027	NC_017272	GCC	2	6	1830209	1830214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432091
46028	NC_017272	GAG	2	6	1830289	1830294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432091
46029	NC_017272	GAA	2	6	1830301	1830306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432091
46030	NC_017272	AGG	3	9	1830323	1830331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432091
46031	NC_017272	GGC	2	6	1830381	1830386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432091
46032	NC_017272	CTC	2	6	1830493	1830498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432091
46033	NC_017272	AGG	2	6	1830512	1830517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432091
46034	NC_017272	GGC	2	6	1830544	1830549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432091
46035	NC_017272	CGC	2	6	1830562	1830567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432091
46036	NC_017272	GTT	2	6	1830634	1830639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432092
46037	NC_017272	CGA	2	6	1830672	1830677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432092
46038	NC_017272	TCC	2	6	1830680	1830685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432092
46039	NC_017272	GAC	2	6	1830733	1830738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432092
46040	NC_017272	ATC	2	6	1830746	1830751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432092
46041	NC_017272	GGGC	2	8	1830783	1830790	0 %	0 %	75 %	25 %	384432092
46042	NC_017272	TGG	2	6	1830821	1830826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432092
46043	NC_017272	GCG	2	6	1830830	1830835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432092
46044	NC_017272	GCC	2	6	1830896	1830901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432092
46045	NC_017272	GCC	2	6	1830910	1830915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432092
46046	NC_017272	TGGGCC	2	12	1830920	1830931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384432092
46047	NC_017272	GGGC	2	8	1830936	1830943	0 %	0 %	75 %	25 %	384432092
46048	NC_017272	CCT	2	6	1830951	1830956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432092
46049	NC_017272	GA	3	6	1830978	1830983	50 %	0 %	50 %	0 %	384432092
46050	NC_017272	ACC	2	6	1831013	1831018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432092
46051	NC_017272	CGG	2	6	1831020	1831025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432092
46052	NC_017272	G	6	6	1831053	1831058	0 %	0 %	100 %	0 %	384432092
46053	NC_017272	GTT	2	6	1831159	1831164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432092
46054	NC_017272	CCG	2	6	1831199	1831204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432092
46055	NC_017272	CAC	2	6	1831216	1831221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432092
46056	NC_017272	G	6	6	1831276	1831281	0 %	0 %	100 %	0 %	384432092
46057	NC_017272	ATC	2	6	1831343	1831348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432092
46058	NC_017272	GAG	2	6	1831436	1831441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432093
46059	NC_017272	GGC	2	6	1831442	1831447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432093
46060	NC_017272	CCG	2	6	1831463	1831468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432093
46061	NC_017272	GCC	2	6	1831481	1831486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432093
46062	NC_017272	CAC	2	6	1831487	1831492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432093
46063	NC_017272	GGC	2	6	1831499	1831504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432093
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46067	NC_017272	CCA	2	6	1831672	1831677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432093
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46070	NC_017272	GGA	2	6	1831813	1831818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432093
46071	NC_017272	TCC	2	6	1831830	1831835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432093
46072	NC_017272	GCA	2	6	1831894	1831899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432093
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46085	NC_017272	TGC	2	6	1832711	1832716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432094
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46087	NC_017272	GGC	2	6	1832763	1832768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432094
46088	NC_017272	GTC	2	6	1832799	1832804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432094
46089	NC_017272	C	7	7	1832818	1832824	0 %	0 %	0 %	100 %	384432094
46090	NC_017272	GGT	2	6	1832895	1832900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432094
46091	NC_017272	CCT	2	6	1832915	1832920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432094
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46098	NC_017272	CCA	2	6	1833197	1833202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432094
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46101	NC_017272	GAA	2	6	1833380	1833385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432094
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46103	NC_017272	GC	3	6	1833543	1833548	0 %	0 %	50 %	50 %	384432095
46104	NC_017272	GACC	2	8	1833565	1833572	25 %	0 %	25 %	50 %	384432095
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46114	NC_017272	CTCC	2	8	1834075	1834082	0 %	25 %	0 %	75 %	384432095
46115	NC_017272	GAC	2	6	1834091	1834096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432095
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46117	NC_017272	ACT	2	6	1834167	1834172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432095
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46469	NC_017272	GAG	2	6	1845866	1845871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
46470	NC_017272	CTTCC	2	10	1845881	1845890	0 %	40 %	0 %	60 %	384432112
46471	NC_017272	CCGG	2	8	1845915	1845922	0 %	0 %	50 %	50 %	384432112
46472	NC_017272	GCC	3	9	1845944	1845952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432112
46473	NC_017272	G	6	6	1845968	1845973	0 %	0 %	100 %	0 %	384432112
46474	NC_017272	CTA	2	6	1845988	1845993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432112
46475	NC_017272	TGG	2	6	1846065	1846070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
46476	NC_017272	CGC	2	6	1846090	1846095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432112
46477	NC_017272	GGC	2	6	1846135	1846140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432112
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46480	NC_017272	TGG	2	6	1846215	1846220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
46481	NC_017272	GCGGG	2	10	1846234	1846243	0 %	0 %	80 %	20 %	384432112
46482	NC_017272	GGGC	2	8	1846300	1846307	0 %	0 %	75 %	25 %	384432112
46483	NC_017272	GGT	3	9	1846405	1846413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432112
46484	NC_017272	CCT	2	6	1846417	1846422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112
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46488	NC_017272	GAG	2	6	1846490	1846495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
46489	NC_017272	AGGC	2	8	1846512	1846519	25 %	0 %	50 %	25 %	384432112
46490	NC_017272	GCCC	2	8	1846522	1846529	0 %	0 %	25 %	75 %	384432112
46491	NC_017272	C	6	6	1846575	1846580	0 %	0 %	0 %	100 %	384432112
46492	NC_017272	TCT	2	6	1846596	1846601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432112
46493	NC_017272	TCC	2	6	1846656	1846661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112
46494	NC_017272	GAG	2	6	1846709	1846714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
46495	NC_017272	AGG	2	6	1846722	1846727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432112
46496	NC_017272	GGTCCT	2	12	1846756	1846767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432112
46497	NC_017272	CTC	2	6	1846793	1846798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112
46498	NC_017272	ACC	2	6	1846809	1846814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432112
46499	NC_017272	GGGTA	2	10	1846821	1846830	20 %	20 %	60 %	0 %	384432112
46500	NC_017272	CTC	2	6	1846844	1846849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432112

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