MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_017272	GAA	2	6	1810874	1810879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432069
45502	NC_017272	GAT	2	6	1810901	1810906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432069
45503	NC_017272	CCT	2	6	1811005	1811010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432069
45504	NC_017272	TCC	2	6	1811058	1811063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432069
45505	NC_017272	CCA	2	6	1811065	1811070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432069
45506	NC_017272	GTC	2	6	1811099	1811104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384432069
45507	NC_017272	CCT	3	9	1811147	1811155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45508	NC_017272	CTC	2	6	1811163	1811168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45509	NC_017272	GTG	2	6	1811173	1811178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
45510	NC_017272	CGC	2	6	1811199	1811204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
45511	NC_017272	GCC	2	6	1811318	1811323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
45512	NC_017272	TGG	2	6	1811354	1811359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
45513	NC_017272	GAG	2	6	1811370	1811375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
45514	NC_017272	GAG	2	6	1811379	1811384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
45515	NC_017272	CCT	2	6	1811402	1811407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45516	NC_017272	ACC	2	6	1811431	1811436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
45517	NC_017272	TCC	2	6	1811462	1811467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45518	NC_017272	CCG	3	9	1811480	1811488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
45519	NC_017272	CCT	2	6	1811636	1811641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45520	NC_017272	GTCGGG	2	12	1811655	1811666	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384432070
45521	NC_017272	CAC	2	6	1811715	1811720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
45522	NC_017272	AGG	2	6	1811803	1811808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
45523	NC_017272	CGG	2	6	1811840	1811845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432070
45524	NC_017272	GAG	2	6	1811847	1811852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432070
45525	NC_017272	GCG	2	6	1811869	1811874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432070
45526	NC_017272	ACC	2	6	1811914	1811919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
45527	NC_017272	CGC	3	9	1811958	1811966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
45528	NC_017272	GGT	2	6	1812021	1812026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
45529	NC_017272	CAC	2	6	1812045	1812050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
45530	NC_017272	CTC	2	6	1812075	1812080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432070
45531	NC_017272	TGG	2	6	1812091	1812096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432070
45532	NC_017272	C	6	6	1812101	1812106	0 %	0 %	0 %	100 %	384432070
45533	NC_017272	CGC	2	6	1812186	1812191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432070
45534	NC_017272	G	6	6	1812236	1812241	0 %	0 %	100 %	0 %	384432070
45535	NC_017272	GAA	2	6	1812267	1812272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432070
45536	NC_017272	CCA	3	9	1812290	1812298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432070
45537	NC_017272	TCCACC	2	12	1812307	1812318	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384432070
45538	NC_017272	CCCG	2	8	1812331	1812338	0 %	0 %	25 %	75 %	384432070
45539	NC_017272	CTC	2	6	1812433	1812438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432071
45540	NC_017272	ACCCGG	2	12	1812440	1812451	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384432071
45541	NC_017272	AAG	2	6	1812542	1812547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432071
45542	NC_017272	AGGT	2	8	1812617	1812624	25 %	25 %	50 %	0 %	384432071
45543	NC_017272	GCC	2	6	1812631	1812636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432071
45544	NC_017272	GGA	2	6	1812643	1812648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432072
45545	NC_017272	CCG	2	6	1812664	1812669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432072
45546	NC_017272	GTG	3	9	1812737	1812745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432072
45547	NC_017272	GAG	3	9	1812812	1812820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432072
45548	NC_017272	GGA	2	6	1812858	1812863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
45549	NC_017272	CTC	2	6	1812874	1812879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
45550	NC_017272	CTC	3	9	1812937	1812945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
45551	NC_017272	CTC	2	6	1812964	1812969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
45552	NC_017272	GCC	2	6	1812990	1812995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432073
45553	NC_017272	GAT	2	6	1813012	1813017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432073
45554	NC_017272	G	6	6	1813046	1813051	0 %	0 %	100 %	0 %	384432073
45555	NC_017272	GTT	2	6	1813138	1813143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384432073
45556	NC_017272	CCA	2	6	1813161	1813166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
45557	NC_017272	CCA	2	6	1813173	1813178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
45558	NC_017272	C	6	6	1813261	1813266	0 %	0 %	0 %	100 %	384432073
45559	NC_017272	TGG	2	6	1813305	1813310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432073
45560	NC_017272	GTGG	2	8	1813318	1813325	0 %	25 %	75 %	0 %	384432073
45561	NC_017272	CAC	2	6	1813411	1813416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432073
45562	NC_017272	CCG	2	6	1813417	1813422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432073
45563	NC_017272	GAG	2	6	1813525	1813530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
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45565	NC_017272	CGG	2	6	1813560	1813565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432073
45566	NC_017272	G	6	6	1813584	1813589	0 %	0 %	100 %	0 %	384432073
45567	NC_017272	CCT	2	6	1813614	1813619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
45568	NC_017272	CCT	2	6	1813623	1813628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432073
45569	NC_017272	GGC	2	6	1813657	1813662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432073
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45573	NC_017272	AGG	2	6	1813782	1813787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432073
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45575	NC_017272	GTG	2	6	1813832	1813837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432073
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45579	NC_017272	AGG	2	6	1814233	1814238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
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45582	NC_017272	GTCGGG	2	12	1814280	1814291	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384432074
45583	NC_017272	CGG	2	6	1814297	1814302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
45584	NC_017272	GGCG	2	8	1814312	1814319	0 %	0 %	75 %	25 %	384432074
45585	NC_017272	TCC	2	6	1814323	1814328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
45586	NC_017272	CCT	2	6	1814348	1814353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
45587	NC_017272	GCCTCC	2	12	1814371	1814382	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384432074
45588	NC_017272	AGA	2	6	1814383	1814388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432074
45589	NC_017272	TCC	2	6	1814413	1814418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
45590	NC_017272	C	6	6	1814421	1814426	0 %	0 %	0 %	100 %	384432074
45591	NC_017272	TCC	2	6	1814471	1814476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432074
45592	NC_017272	ACC	2	6	1814500	1814505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432074
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45595	NC_017272	G	6	6	1814632	1814637	0 %	0 %	100 %	0 %	384432074
45596	NC_017272	ACGGTC	2	12	1814668	1814679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432074
45597	NC_017272	CAC	2	6	1814698	1814703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432074
45598	NC_017272	TGG	2	6	1814747	1814752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432074
45599	NC_017272	GCG	2	6	1814778	1814783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
45600	NC_017272	CCTC	2	8	1814834	1814841	0 %	25 %	0 %	75 %	384432074
45601	NC_017272	AGG	2	6	1814842	1814847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
45602	NC_017272	GAG	2	6	1814886	1814891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432074
45603	NC_017272	GCG	2	6	1814892	1814897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432074
45604	NC_017272	GTA	2	6	1815020	1815025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384432075
45605	NC_017272	GGT	2	6	1815046	1815051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432075
45606	NC_017272	C	7	7	1815059	1815065	0 %	0 %	0 %	100 %	384432075
45607	NC_017272	CGG	3	9	1815097	1815105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432075
45608	NC_017272	GGC	2	6	1815122	1815127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432075
45609	NC_017272	C	6	6	1815151	1815156	0 %	0 %	0 %	100 %	384432075
45610	NC_017272	CTT	2	6	1815161	1815166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432075
45611	NC_017272	GCGG	2	8	1815191	1815198	0 %	0 %	75 %	25 %	384432075
45612	NC_017272	CTT	2	6	1815257	1815262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384432075
45613	NC_017272	CTC	2	6	1815278	1815283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432075
45614	NC_017272	C	6	6	1815310	1815315	0 %	0 %	0 %	100 %	384432075
45615	NC_017272	GCC	2	6	1815336	1815341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432075
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45974	NC_017272	TCC	2	6	1828061	1828066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432088
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