MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_017272	AGG	2	6	1750303	1750308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432012
44003	NC_017272	TGG	2	6	1750309	1750314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432012
44004	NC_017272	C	6	6	1750340	1750345	0 %	0 %	0 %	100 %	384432012
44005	NC_017272	CGG	2	6	1750354	1750359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432012
44006	NC_017272	TGG	2	6	1750360	1750365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432012
44007	NC_017272	ACC	2	6	1750386	1750391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432012
44008	NC_017272	CCT	2	6	1750400	1750405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432012
44009	NC_017272	CAG	2	6	1750521	1750526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432012
44010	NC_017272	CTC	3	9	1750575	1750583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432012
44011	NC_017272	AGG	2	6	1750596	1750601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432012
44012	NC_017272	GCGG	2	8	1750613	1750620	0 %	0 %	75 %	25 %	384432012
44013	NC_017272	CCA	2	6	1750658	1750663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432012
44014	NC_017272	GCC	2	6	1750672	1750677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432012
44015	NC_017272	CGG	2	6	1750682	1750687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384432012
44016	NC_017272	CAG	2	6	1750692	1750697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432012
44017	NC_017272	GCCCTG	2	12	1750716	1750727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384432012
44018	NC_017272	C	7	7	1750730	1750736	0 %	0 %	0 %	100 %	384432012
44019	NC_017272	CGA	2	6	1750748	1750753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384432012
44020	NC_017272	ACCTGG	2	12	1750765	1750776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384432012
44021	NC_017272	CTTCT	2	10	1750800	1750809	0 %	60 %	0 %	40 %	384432012
44022	NC_017272	GGGCG	2	10	1750867	1750876	0 %	0 %	80 %	20 %	384432012
44023	NC_017272	TCC	2	6	1750879	1750884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432012
44024	NC_017272	GGGT	2	8	1750892	1750899	0 %	25 %	75 %	0 %	384432012
44025	NC_017272	GAG	2	6	1750911	1750916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432012
44026	NC_017272	TGG	2	6	1750998	1751003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432013
44027	NC_017272	GGCG	2	8	1751017	1751024	0 %	0 %	75 %	25 %	384432013
44028	NC_017272	CCG	3	9	1751031	1751039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432013
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44030	NC_017272	GGGT	2	8	1751093	1751100	0 %	25 %	75 %	0 %	384432013
44031	NC_017272	TGG	2	6	1751163	1751168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432013
44032	NC_017272	GAG	2	6	1751180	1751185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432013
44033	NC_017272	GGT	2	6	1751224	1751229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432013
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44035	NC_017272	C	7	7	1751341	1751347	0 %	0 %	0 %	100 %	384432013
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44041	NC_017272	CCT	2	6	1751512	1751517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432013
44042	NC_017272	CTC	2	6	1751567	1751572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432013
44043	NC_017272	AGG	2	6	1751574	1751579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432013
44044	NC_017272	GTG	2	6	1751675	1751680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384432013
44045	NC_017272	CCG	2	6	1751682	1751687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432013
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44051	NC_017272	CCA	2	6	1751994	1751999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384432013
44052	NC_017272	AGG	2	6	1752027	1752032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432013
44053	NC_017272	AAG	2	6	1752044	1752049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384432013
44054	NC_017272	ACT	2	6	1752078	1752083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384432013
44055	NC_017272	GAG	2	6	1752122	1752127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432013
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44060	NC_017272	GGA	2	6	1752226	1752231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432013
44061	NC_017272	CGCCC	2	10	1752256	1752265	0 %	0 %	20 %	80 %	384432013
44062	NC_017272	CTC	2	6	1752287	1752292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384432013
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44099	NC_017272	CGGG	2	8	1753972	1753979	0 %	0 %	75 %	25 %	384432015
44100	NC_017272	GAG	2	6	1754020	1754025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384432015
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44338	NC_017272	GCGCC	2	10	1763266	1763275	0 %	0 %	40 %	60 %	384432022
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44474	NC_017272	G	6	6	1768841	1768846	0 %	0 %	100 %	0 %	384432028
44475	NC_017272	GGCT	2	8	1768855	1768862	0 %	25 %	50 %	25 %	384432028
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44499	NC_017272	CGC	2	6	1769577	1769582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384432028
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