MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40502	NC_017272	GTC	2	6	1611634	1611639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431851
40503	NC_017272	CTC	3	9	1611685	1611693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431851
40504	NC_017272	CCA	2	6	1611702	1611707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431851
40505	NC_017272	CAC	2	6	1611709	1611714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431851
40506	NC_017272	GAG	2	6	1611718	1611723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431851
40507	NC_017272	GAG	2	6	1611742	1611747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431851
40508	NC_017272	TCC	2	6	1611815	1611820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431851
40509	NC_017272	GTC	2	6	1611841	1611846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431851
40510	NC_017272	C	6	6	1611858	1611863	0 %	0 %	0 %	100 %	384431851
40511	NC_017272	ATG	2	6	1611869	1611874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431851
40512	NC_017272	GGA	2	6	1611921	1611926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431851
40513	NC_017272	CTT	2	6	1611943	1611948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431851
40514	NC_017272	CTC	2	6	1611958	1611963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431851
40515	NC_017272	GCCC	2	8	1611991	1611998	0 %	0 %	25 %	75 %	384431851
40516	NC_017272	CCT	2	6	1612038	1612043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431852
40517	NC_017272	CAC	2	6	1612144	1612149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431852
40518	NC_017272	GAG	2	6	1612153	1612158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431852
40519	NC_017272	GAT	2	6	1612204	1612209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
40520	NC_017272	AGG	2	6	1612217	1612222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431852
40521	NC_017272	C	6	6	1612245	1612250	0 %	0 %	0 %	100 %	384431852
40522	NC_017272	C	6	6	1612324	1612329	0 %	0 %	0 %	100 %	384431852
40523	NC_017272	CGG	2	6	1612374	1612379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431852
40524	NC_017272	AGG	2	6	1612406	1612411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431852
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40526	NC_017272	GCA	2	6	1612467	1612472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431852
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40528	NC_017272	GAT	2	6	1612534	1612539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
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40533	NC_017272	CGG	2	6	1612659	1612664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431852
40534	NC_017272	A	6	6	1612699	1612704	100 %	0 %	0 %	0 %	384431852
40535	NC_017272	CCA	2	6	1612713	1612718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431852
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40537	NC_017272	GAT	2	6	1612795	1612800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
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40539	NC_017272	CAC	4	12	1612882	1612893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431852
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40542	NC_017272	C	6	6	1612940	1612945	0 %	0 %	0 %	100 %	384431852
40543	NC_017272	GAA	2	6	1612972	1612977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431852
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40546	NC_017272	CCT	2	6	1613040	1613045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431852
40547	NC_017272	CCT	2	6	1613049	1613054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431852
40548	NC_017272	CAC	2	6	1613077	1613082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431852
40549	NC_017272	ATG	3	9	1613099	1613107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
40550	NC_017272	ATG	2	6	1613126	1613131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
40551	NC_017272	TGA	2	6	1613181	1613186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431852
40552	NC_017272	GGC	2	6	1613278	1613283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431852
40553	NC_017272	GAG	2	6	1613290	1613295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431852
40554	NC_017272	AGG	2	6	1613370	1613375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431853
40555	NC_017272	CCCG	2	8	1613384	1613391	0 %	0 %	25 %	75 %	384431853
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40572	NC_017272	GTA	2	6	1614278	1614283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431855
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40601	NC_017272	CGTCCA	2	12	1615619	1615630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384431858
40602	NC_017272	TGA	2	6	1615646	1615651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431858
40603	NC_017272	CG	3	6	1615660	1615665	0 %	0 %	50 %	50 %	384431858
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