MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017272	GTAGGG	2	12	149966	149977	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430364
3502	NC_017272	GGGCG	2	10	150002	150011	0 %	0 %	80 %	20 %	384430364
3503	NC_017272	AGG	2	6	150024	150029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430364
3504	NC_017272	TGG	2	6	150040	150045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430364
3505	NC_017272	ACC	2	6	150096	150101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430364
3506	NC_017272	TCA	2	6	150124	150129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430364
3507	NC_017272	CGG	2	6	150175	150180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430364
3508	NC_017272	CCG	2	6	150205	150210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430364
3509	NC_017272	GCA	2	6	150214	150219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430364
3510	NC_017272	TCC	2	6	150306	150311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430364
3511	NC_017272	CCT	3	9	150319	150327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430364
3512	NC_017272	TCG	2	6	150375	150380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430364
3513	NC_017272	GGC	2	6	150386	150391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430364
3514	NC_017272	GAG	2	6	150395	150400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430364
3515	NC_017272	CGT	2	6	150409	150414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430364
3516	NC_017272	CCA	2	6	150430	150435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430364
3517	NC_017272	CGG	2	6	150445	150450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430364
3518	NC_017272	GTG	3	9	150482	150490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430364
3519	NC_017272	CAC	2	6	150524	150529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430364
3520	NC_017272	C	6	6	150549	150554	0 %	0 %	0 %	100 %	384430364
3521	NC_017272	GGC	2	6	150653	150658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430364
3522	NC_017272	GCC	2	6	150684	150689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430364
3523	NC_017272	G	6	6	150697	150702	0 %	0 %	100 %	0 %	384430364
3524	NC_017272	TCC	2	6	150780	150785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430364
3525	NC_017272	CTC	2	6	150884	150889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3526	NC_017272	GAG	2	6	150893	150898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430365
3527	NC_017272	CCT	2	6	150901	150906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3528	NC_017272	G	6	6	150959	150964	0 %	0 %	100 %	0 %	384430365
3529	NC_017272	CTT	2	6	150976	150981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430365
3530	NC_017272	CCT	2	6	150985	150990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3531	NC_017272	TCC	2	6	151020	151025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3532	NC_017272	TCC	3	9	151032	151040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3533	NC_017272	CTC	2	6	151043	151048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3534	NC_017272	CTT	2	6	151100	151105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430365
3535	NC_017272	CCT	3	9	151120	151128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3536	NC_017272	GTC	3	9	151145	151153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430365
3537	NC_017272	GGA	2	6	151157	151162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430365
3538	NC_017272	C	6	6	151210	151215	0 %	0 %	0 %	100 %	384430365
3539	NC_017272	CCT	2	6	151234	151239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3540	NC_017272	CATC	2	8	151264	151271	25 %	25 %	0 %	50 %	384430365
3541	NC_017272	CCA	2	6	151276	151281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430365
3542	NC_017272	TGG	2	6	151321	151326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430365
3543	NC_017272	TGG	2	6	151338	151343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430365
3544	NC_017272	GTT	2	6	151370	151375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430365
3545	NC_017272	CGG	2	6	151408	151413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3546	NC_017272	CTCG	2	8	151442	151449	0 %	25 %	25 %	50 %	384430365
3547	NC_017272	GGC	2	6	151511	151516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3548	NC_017272	CGG	2	6	151522	151527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3549	NC_017272	G	7	7	151526	151532	0 %	0 %	100 %	0 %	384430365
3550	NC_017272	GAA	2	6	151562	151567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430365
3551	NC_017272	GGC	2	6	151603	151608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3552	NC_017272	TTG	2	6	151611	151616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430365
3553	NC_017272	TGG	2	6	151627	151632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430365
3554	NC_017272	GTA	2	6	151697	151702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430365
3555	NC_017272	CCGG	2	8	151723	151730	0 %	0 %	50 %	50 %	384430365
3556	NC_017272	GGC	2	6	151754	151759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3557	NC_017272	CGG	2	6	151771	151776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430365
3558	NC_017272	GCC	2	6	151839	151844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430365
3559	NC_017272	CCT	2	6	151862	151867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3560	NC_017272	TCC	2	6	151917	151922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3561	NC_017272	CTC	2	6	151940	151945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430365
3562	NC_017272	GTG	2	6	152124	152129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430366
3563	NC_017272	GGA	2	6	152171	152176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430366
3564	NC_017272	GCG	2	6	152192	152197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430366
3565	NC_017272	GAG	2	6	152235	152240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430366
3566	NC_017272	CTC	2	6	152241	152246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430366
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3569	NC_017272	GAG	2	6	152307	152312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430366
3570	NC_017272	CTC	2	6	152325	152330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430366
3571	NC_017272	AGG	2	6	152383	152388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430366
3572	NC_017272	GAG	2	6	152397	152402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430366
3573	NC_017272	CCT	3	9	152408	152416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430366
3574	NC_017272	C	6	6	152425	152430	0 %	0 %	0 %	100 %	384430366
3575	NC_017272	GCA	2	6	152438	152443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430366
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3578	NC_017272	ACC	2	6	152512	152517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430366
3579	NC_017272	TGG	2	6	152547	152552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430367
3580	NC_017272	GAG	2	6	152564	152569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430367
3581	NC_017272	GAG	2	6	152576	152581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430367
3582	NC_017272	AGCCGG	2	12	152625	152636	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430367
3583	NC_017272	GCC	2	6	152680	152685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430367
3584	NC_017272	GGC	2	6	152715	152720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430367
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3586	NC_017272	CTC	2	6	152798	152803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430367
3587	NC_017272	CAC	2	6	152816	152821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430367
3588	NC_017272	GGCGG	2	10	152833	152842	0 %	0 %	80 %	20 %	384430367
3589	NC_017272	GAC	2	6	152843	152848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430367
3590	NC_017272	GGA	2	6	152857	152862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430367
3591	NC_017272	GGGC	2	8	152890	152897	0 %	0 %	75 %	25 %	384430367
3592	NC_017272	TTC	2	6	152919	152924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430368
3593	NC_017272	GGT	2	6	152963	152968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430368
3594	NC_017272	CAG	2	6	152998	153003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430368
3595	NC_017272	ACC	2	6	153010	153015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430368
3596	NC_017272	C	6	6	153018	153023	0 %	0 %	0 %	100 %	384430368
3597	NC_017272	CCGG	2	8	153027	153034	0 %	0 %	50 %	50 %	384430368
3598	NC_017272	CCA	2	6	153041	153046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430368
3599	NC_017272	AGG	2	6	153118	153123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430368
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3601	NC_017272	CGC	2	6	153148	153153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430368
3602	NC_017272	GGGCCT	2	12	153179	153190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430368
3603	NC_017272	AGG	2	6	153247	153252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430368
3604	NC_017272	CTT	2	6	153260	153265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430368
3605	NC_017272	AGG	2	6	153393	153398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3606	NC_017272	GAG	2	6	153443	153448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3607	NC_017272	GGA	2	6	153460	153465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3608	NC_017272	CCA	2	6	153484	153489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430369
3609	NC_017272	GCACCC	2	12	153505	153516	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384430369
3610	NC_017272	GAGG	2	8	153530	153537	25 %	0 %	75 %	0 %	384430369
3611	NC_017272	AGG	2	6	153555	153560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3612	NC_017272	AGG	2	6	153576	153581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3613	NC_017272	AGG	2	6	153585	153590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
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3615	NC_017272	CGG	2	6	153627	153632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430369
3616	NC_017272	G	6	6	153637	153642	0 %	0 %	100 %	0 %	384430369
3617	NC_017272	GGA	2	6	153652	153657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
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3619	NC_017272	AGG	2	6	153702	153707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430369
3620	NC_017272	CCT	2	6	153718	153723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430369
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3622	NC_017272	GCC	2	6	153764	153769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430369
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3741	NC_017272	G	7	7	158749	158755	0 %	0 %	100 %	0 %	384430375
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3987	NC_017272	AAG	2	6	169328	169333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430386
3988	NC_017272	TGG	2	6	169403	169408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430387
3989	NC_017272	CCT	2	6	169427	169432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
3990	NC_017272	GAG	2	6	169437	169442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430387
3991	NC_017272	GGC	2	6	169443	169448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430387
3992	NC_017272	TCC	2	6	169462	169467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430387
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3999	NC_017272	GAG	2	6	169707	169712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430387
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