MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017272	GTA	2	6	1237359	1237364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431454
31003	NC_017272	GCA	2	6	1237409	1237414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431454
31004	NC_017272	GAG	2	6	1237419	1237424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431454
31005	NC_017272	CTC	2	6	1237446	1237451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
31006	NC_017272	CTG	2	6	1237464	1237469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431454
31007	NC_017272	TGA	2	6	1237478	1237483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431454
31008	NC_017272	CGG	2	6	1237519	1237524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31009	NC_017272	GAT	2	6	1237551	1237556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431454
31010	NC_017272	TCC	2	6	1237627	1237632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
31011	NC_017272	CTTGCC	2	12	1237638	1237649	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384431454
31012	NC_017272	GTT	2	6	1237656	1237661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431454
31013	NC_017272	AGGG	2	8	1237675	1237682	25 %	0 %	75 %	0 %	384431454
31014	NC_017272	GTC	3	9	1237788	1237796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431454
31015	NC_017272	CTT	2	6	1237833	1237838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431454
31016	NC_017272	CAC	2	6	1237845	1237850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431454
31017	NC_017272	GC	3	6	1237855	1237860	0 %	0 %	50 %	50 %	384431454
31018	NC_017272	TGG	2	6	1237868	1237873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431454
31019	NC_017272	CGG	2	6	1237906	1237911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31020	NC_017272	GGC	2	6	1237929	1237934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31021	NC_017272	AGT	2	6	1237958	1237963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431454
31022	NC_017272	G	6	6	1238042	1238047	0 %	0 %	100 %	0 %	384431454
31023	NC_017272	TGG	2	6	1238063	1238068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431454
31024	NC_017272	GTC	2	6	1238070	1238075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431454
31025	NC_017272	TTG	2	6	1238080	1238085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384431454
31026	NC_017272	GGC	2	6	1238169	1238174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31027	NC_017272	CTC	2	6	1238193	1238198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
31028	NC_017272	GGCG	2	8	1238240	1238247	0 %	0 %	75 %	25 %	384431454
31029	NC_017272	GCG	2	6	1238254	1238259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31030	NC_017272	TCA	2	6	1238324	1238329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431454
31031	NC_017272	TGG	2	6	1238336	1238341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431454
31032	NC_017272	TCC	2	6	1238372	1238377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
31033	NC_017272	GGC	2	6	1238434	1238439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31034	NC_017272	GCG	2	6	1238472	1238477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431454
31035	NC_017272	TCC	2	6	1238515	1238520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
31036	NC_017272	CTC	2	6	1238589	1238594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431454
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31038	NC_017272	GAAGA	2	10	1238688	1238697	60 %	0 %	40 %	0 %	384431454
31039	NC_017272	CTT	2	6	1238730	1238735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431454
31040	NC_017272	TC	3	6	1238747	1238752	0 %	50 %	0 %	50 %	384431454
31041	NC_017272	CCT	2	6	1238799	1238804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431455
31042	NC_017272	CTC	3	9	1238821	1238829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431455
31043	NC_017272	CCA	2	6	1238859	1238864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431455
31044	NC_017272	GGA	2	6	1238874	1238879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431455
31045	NC_017272	C	6	6	1238895	1238900	0 %	0 %	0 %	100 %	384431455
31046	NC_017272	GCC	2	6	1238909	1238914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431455
31047	NC_017272	CCT	2	6	1238919	1238924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431455
31048	NC_017272	ATC	2	6	1238939	1238944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431455
31049	NC_017272	CTT	2	6	1238962	1238967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431455
31050	NC_017272	CTG	2	6	1239004	1239009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431455
31051	NC_017272	GAT	2	6	1239025	1239030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431455
31052	NC_017272	AGG	2	6	1239258	1239263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431455
31053	NC_017272	CGC	2	6	1239327	1239332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431455
31054	NC_017272	G	7	7	1239335	1239341	0 %	0 %	100 %	0 %	384431455
31055	NC_017272	CTC	2	6	1239370	1239375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431455
31056	NC_017272	GCCC	2	8	1239397	1239404	0 %	0 %	25 %	75 %	384431455
31057	NC_017272	GGC	2	6	1239415	1239420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
31058	NC_017272	GGC	2	6	1239427	1239432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
31059	NC_017272	G	7	7	1239439	1239445	0 %	0 %	100 %	0 %	384431455
31060	NC_017272	GGC	2	6	1239474	1239479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
31061	NC_017272	GGC	2	6	1239601	1239606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
31062	NC_017272	CGGTG	2	10	1239639	1239648	0 %	20 %	60 %	20 %	384431455
31063	NC_017272	C	7	7	1239658	1239664	0 %	0 %	0 %	100 %	384431455
31064	NC_017272	CGTC	2	8	1239702	1239709	0 %	25 %	25 %	50 %	384431455
31065	NC_017272	ACC	2	6	1239743	1239748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431455
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31067	NC_017272	GGC	2	6	1239820	1239825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
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31069	NC_017272	CGG	2	6	1239923	1239928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431455
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31085	NC_017272	CCGC	2	8	1240647	1240654	0 %	0 %	25 %	75 %	384431456
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31087	NC_017272	CCA	2	6	1240686	1240691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431456
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31089	NC_017272	AGG	2	6	1240724	1240729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431456
31090	NC_017272	CCT	2	6	1240737	1240742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431456
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31092	NC_017272	AGG	2	6	1240749	1240754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431456
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31094	NC_017272	CCT	3	9	1240838	1240846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431457
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31098	NC_017272	C	7	7	1241130	1241136	0 %	0 %	0 %	100 %	384431457
31099	NC_017272	GAA	2	6	1241142	1241147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431457
31100	NC_017272	GCC	2	6	1241257	1241262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431457
31101	NC_017272	AAG	2	6	1241278	1241283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431457
31102	NC_017272	CCT	2	6	1241429	1241434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431457
31103	NC_017272	GAG	3	9	1241451	1241459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431457
31104	NC_017272	CCT	2	6	1241462	1241467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431457
31105	NC_017272	GGC	2	6	1241474	1241479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431457
31106	NC_017272	AGG	3	9	1241530	1241538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431457
31107	NC_017272	CCG	2	6	1241656	1241661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431457
31108	NC_017272	GAG	2	6	1241676	1241681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431457
31109	NC_017272	GGA	2	6	1241684	1241689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431457
31110	NC_017272	CCT	2	6	1241714	1241719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431457
31111	NC_017272	GAA	2	6	1241721	1241726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431457
31112	NC_017272	CT	3	6	1241728	1241733	0 %	50 %	0 %	50 %	384431457
31113	NC_017272	GAG	2	6	1241736	1241741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431457
31114	NC_017272	CCGCAC	2	12	1241751	1241762	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384431457
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31116	NC_017272	TCT	2	6	1241795	1241800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431457
31117	NC_017272	GGA	2	6	1241826	1241831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431458
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31212	NC_017272	GCG	2	6	1245230	1245235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431462
31213	NC_017272	CCTCGC	2	12	1245239	1245250	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431462
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31220	NC_017272	ACT	2	6	1245442	1245447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431462
31221	NC_017272	CCT	2	6	1245494	1245499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
31222	NC_017272	ACG	2	6	1245553	1245558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431462
31223	NC_017272	CTC	2	6	1245603	1245608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
31224	NC_017272	TGG	2	6	1245658	1245663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431462
31225	NC_017272	AGA	2	6	1245679	1245684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431462
31226	NC_017272	G	7	7	1245770	1245776	0 %	0 %	100 %	0 %	384431462
31227	NC_017272	GGT	2	6	1245809	1245814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431462
31228	NC_017272	CTC	2	6	1245824	1245829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
31229	NC_017272	GAG	2	6	1245852	1245857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431462
31230	NC_017272	CCT	2	6	1245914	1245919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431462
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31499	NC_017272	ACC	2	6	1255897	1255902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431471
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