MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_017272	GGGCC	2	10	1099495	1099504	0 %	0 %	60 %	40 %	384431322
27503	NC_017272	TCCTGC	2	12	1099563	1099574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384431322
27504	NC_017272	TCT	2	6	1099596	1099601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431322
27505	NC_017272	CTGC	2	8	1099613	1099620	0 %	25 %	25 %	50 %	384431322
27506	NC_017272	TCC	3	9	1099632	1099640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27507	NC_017272	CCG	2	6	1099717	1099722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431322
27508	NC_017272	TCC	2	6	1099725	1099730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27509	NC_017272	TCGCCC	2	12	1099746	1099757	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431322
27510	NC_017272	TCC	2	6	1099760	1099765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27511	NC_017272	TCC	4	12	1099773	1099784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27512	NC_017272	AGG	3	9	1099809	1099817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431322
27513	NC_017272	CCT	2	6	1099843	1099848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27514	NC_017272	CTC	2	6	1099856	1099861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27515	NC_017272	GGC	2	6	1099874	1099879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431322
27516	NC_017272	TGG	2	6	1099908	1099913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431322
27517	NC_017272	CTTCCT	2	12	1099987	1099998	0 %	50 %	0 %	50 %	384431322
27518	NC_017272	GAG	2	6	1100063	1100068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431322
27519	NC_017272	GTG	2	6	1100102	1100107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431322
27520	NC_017272	TCC	3	9	1100112	1100120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27521	NC_017272	CCT	2	6	1100131	1100136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27522	NC_017272	CCT	2	6	1100143	1100148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27523	NC_017272	GCGGCC	2	12	1100165	1100176	0 %	0 %	50 %	50 %	384431322
27524	NC_017272	GCC	2	6	1100189	1100194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431322
27525	NC_017272	CTC	3	9	1100210	1100218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
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27527	NC_017272	GA	3	6	1100275	1100280	50 %	0 %	50 %	0 %	384431322
27528	NC_017272	CCCA	2	8	1100361	1100368	25 %	0 %	0 %	75 %	384431323
27529	NC_017272	C	6	6	1100382	1100387	0 %	0 %	0 %	100 %	384431323
27530	NC_017272	CCA	2	6	1100399	1100404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431323
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27532	NC_017272	CGCCCC	2	12	1100474	1100485	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	384431323
27533	NC_017272	C	6	6	1100525	1100530	0 %	0 %	0 %	100 %	384431323
27534	NC_017272	CCT	2	6	1100534	1100539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431323
27535	NC_017272	AGG	2	6	1100580	1100585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431323
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27537	NC_017272	CAC	2	6	1100640	1100645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431323
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27539	NC_017272	CG	3	6	1100704	1100709	0 %	0 %	50 %	50 %	384431323
27540	NC_017272	CGC	2	6	1100722	1100727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431323
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27543	NC_017272	GTG	2	6	1100785	1100790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431323
27544	NC_017272	GAAG	2	8	1101379	1101386	50 %	0 %	50 %	0 %	384431324
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27550	NC_017272	GGA	2	6	1101583	1101588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431324
27551	NC_017272	GGCGG	2	10	1101749	1101758	0 %	0 %	80 %	20 %	384431325
27552	NC_017272	GTCC	2	8	1101803	1101810	0 %	25 %	25 %	50 %	384431325
27553	NC_017272	TCC	2	6	1101880	1101885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431325
27554	NC_017272	CCGC	2	8	1101985	1101992	0 %	0 %	25 %	75 %	384431325
27555	NC_017272	ATC	2	6	1102050	1102055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431325
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27559	NC_017272	GCC	2	6	1102119	1102124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431325
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27589	NC_017272	C	6	6	1103362	1103367	0 %	0 %	0 %	100 %	384431325
27590	NC_017272	C	6	6	1103389	1103394	0 %	0 %	0 %	100 %	384431325
27591	NC_017272	GC	3	6	1103462	1103467	0 %	0 %	50 %	50 %	384431325
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27613	NC_017272	TCC	3	9	1104207	1104215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431326
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