MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27003	NC_017272	CGC	2	6	1079356	1079361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431296
27004	NC_017272	TCCAGG	2	12	1079469	1079480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384431296
27005	NC_017272	TCCAG	2	10	1079518	1079527	20 %	20 %	20 %	40 %	384431296
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27007	NC_017272	CCGCT	2	10	1079591	1079600	0 %	20 %	20 %	60 %	384431296
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27009	NC_017272	G	6	6	1079615	1079620	0 %	0 %	100 %	0 %	384431296
27010	NC_017272	CTC	2	6	1079651	1079656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431296
27011	NC_017272	CCT	2	6	1079659	1079664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431296
27012	NC_017272	CTC	2	6	1079672	1079677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431296
27013	NC_017272	GGA	2	6	1079716	1079721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431296
27014	NC_017272	TCC	2	6	1079748	1079753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431296
27015	NC_017272	CTG	3	9	1079759	1079767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431296
27016	NC_017272	CCGC	2	8	1079821	1079828	0 %	0 %	25 %	75 %	384431296
27017	NC_017272	TCC	2	6	1079925	1079930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431296
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27469	NC_017272	GGC	2	6	1098576	1098581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431320
27470	NC_017272	CTC	2	6	1098648	1098653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27471	NC_017272	CTT	2	6	1098692	1098697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431321
27472	NC_017272	GGGCTT	2	12	1098711	1098722	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384431321
27473	NC_017272	GCGGT	2	10	1098780	1098789	0 %	20 %	60 %	20 %	384431321
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27475	NC_017272	TCC	2	6	1098835	1098840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27476	NC_017272	TCC	3	9	1098874	1098882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27477	NC_017272	C	7	7	1098905	1098911	0 %	0 %	0 %	100 %	384431321
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27479	NC_017272	GGC	2	6	1098928	1098933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431321
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27481	NC_017272	CTC	4	12	1098957	1098968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27482	NC_017272	TCC	2	6	1098970	1098975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27483	NC_017272	CTTCC	2	10	1098993	1099002	0 %	40 %	0 %	60 %	384431321
27484	NC_017272	CTC	2	6	1099023	1099028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
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27488	NC_017272	TCC	2	6	1099081	1099086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27489	NC_017272	CTC	2	6	1099092	1099097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431321
27490	NC_017272	CCT	2	6	1099135	1099140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
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27492	NC_017272	CCT	2	6	1099189	1099194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27493	NC_017272	GGGC	2	8	1099218	1099225	0 %	0 %	75 %	25 %	384431322
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27495	NC_017272	GGT	2	6	1099282	1099287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431322
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27497	NC_017272	GAG	2	6	1099315	1099320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431322
27498	NC_017272	TCC	3	9	1099329	1099337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27499	NC_017272	TCC	2	6	1099401	1099406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431322
27500	NC_017272	GGACC	2	10	1099420	1099429	20 %	0 %	40 %	40 %	384431322

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