MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_017272	GTG	2	6	1024014	1024019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431244
25503	NC_017272	AGG	2	6	1024024	1024029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431244
25504	NC_017272	CCA	2	6	1024066	1024071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431244
25505	NC_017272	CCG	2	6	1024085	1024090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431244
25506	NC_017272	GGCG	2	8	1024122	1024129	0 %	0 %	75 %	25 %	384431244
25507	NC_017272	CGC	2	6	1024163	1024168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431244
25508	NC_017272	GTG	2	6	1024200	1024205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431244
25509	NC_017272	CGGGGA	2	12	1024217	1024228	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431244
25510	NC_017272	CACC	2	8	1024334	1024341	25 %	0 %	0 %	75 %	384431244
25511	NC_017272	ACC	2	6	1024419	1024424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431245
25512	NC_017272	C	7	7	1024426	1024432	0 %	0 %	0 %	100 %	384431245
25513	NC_017272	TGG	2	6	1024482	1024487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431245
25514	NC_017272	AGG	2	6	1024520	1024525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431245
25515	NC_017272	G	6	6	1024621	1024626	0 %	0 %	100 %	0 %	384431245
25516	NC_017272	TCC	2	6	1024638	1024643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431245
25517	NC_017272	CCT	2	6	1024678	1024683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431245
25518	NC_017272	C	6	6	1024703	1024708	0 %	0 %	0 %	100 %	384431245
25519	NC_017272	TCC	2	6	1024722	1024727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431245
25520	NC_017272	GGT	2	6	1024771	1024776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431245
25521	NC_017272	GGA	3	9	1024783	1024791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431245
25522	NC_017272	CCT	2	6	1024801	1024806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431245
25523	NC_017272	GGA	2	6	1024837	1024842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431245
25524	NC_017272	C	6	6	1024862	1024867	0 %	0 %	0 %	100 %	384431245
25525	NC_017272	GCC	2	6	1024934	1024939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431245
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25529	NC_017272	GTC	2	6	1025150	1025155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431245
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25532	NC_017272	GGCG	2	8	1025218	1025225	0 %	0 %	75 %	25 %	384431245
25533	NC_017272	C	6	6	1025251	1025256	0 %	0 %	0 %	100 %	384431245
25534	NC_017272	CTC	2	6	1025315	1025320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431245
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25537	NC_017272	GGGA	2	8	1025342	1025349	25 %	0 %	75 %	0 %	384431245
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25544	NC_017272	CCG	2	6	1025671	1025676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431246
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25555	NC_017272	ACC	2	6	1026029	1026034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431247
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25559	NC_017272	GAG	2	6	1026094	1026099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431247
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25564	NC_017272	AGGATC	2	12	1026284	1026295	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384431247
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25567	NC_017272	GGCCTC	2	12	1026397	1026408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431247
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25589	NC_017272	CTC	2	6	1026961	1026966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431247
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25602	NC_017272	CCCG	2	8	1027438	1027445	0 %	0 %	25 %	75 %	384431248
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25609	NC_017272	CCCTC	2	10	1027768	1027777	0 %	20 %	0 %	80 %	384431248
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