MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017272	CAC	2	6	1005470	1005475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431221
25003	NC_017272	CCA	2	6	1005538	1005543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431221
25004	NC_017272	C	7	7	1005656	1005662	0 %	0 %	0 %	100 %	384431222
25005	NC_017272	GCC	2	6	1005673	1005678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431222
25006	NC_017272	TCC	2	6	1005684	1005689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431222
25007	NC_017272	CCA	2	6	1005700	1005705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431222
25008	NC_017272	CCT	2	6	1005718	1005723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431222
25009	NC_017272	CCA	2	6	1005763	1005768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431222
25010	NC_017272	CCA	2	6	1005787	1005792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431222
25011	NC_017272	CCT	2	6	1005878	1005883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431223
25012	NC_017272	GGA	2	6	1005905	1005910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431223
25013	NC_017272	GCGG	2	8	1005915	1005922	0 %	0 %	75 %	25 %	384431223
25014	NC_017272	TGGGC	2	10	1005929	1005938	0 %	20 %	60 %	20 %	384431223
25015	NC_017272	GTA	2	6	1006011	1006016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431223
25016	NC_017272	TCT	2	6	1006022	1006027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431223
25017	NC_017272	GAACC	2	10	1006096	1006105	40 %	0 %	20 %	40 %	384431223
25018	NC_017272	CCT	2	6	1006135	1006140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25019	NC_017272	GCG	2	6	1006168	1006173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431224
25020	NC_017272	TCA	2	6	1006185	1006190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431224
25021	NC_017272	CCT	2	6	1006230	1006235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25022	NC_017272	GTG	2	6	1006241	1006246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431224
25023	NC_017272	GCC	2	6	1006266	1006271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25024	NC_017272	CTC	2	6	1006306	1006311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25025	NC_017272	GGCCC	2	10	1006384	1006393	0 %	0 %	40 %	60 %	384431224
25026	NC_017272	GAA	2	6	1006401	1006406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431224
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25028	NC_017272	GCCTCG	2	12	1006499	1006510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431224
25029	NC_017272	CGC	2	6	1006655	1006660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25030	NC_017272	GCCCC	2	10	1006673	1006682	0 %	0 %	20 %	80 %	384431224
25031	NC_017272	CCT	2	6	1006761	1006766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25032	NC_017272	GAG	2	6	1006789	1006794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431224
25033	NC_017272	TCG	2	6	1006799	1006804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431224
25034	NC_017272	GCC	2	6	1006814	1006819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25035	NC_017272	CTC	2	6	1006834	1006839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25036	NC_017272	GGC	2	6	1006863	1006868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431224
25037	NC_017272	CGG	2	6	1006869	1006874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431224
25038	NC_017272	CCA	2	6	1006878	1006883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431224
25039	NC_017272	TCC	2	6	1006916	1006921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25040	NC_017272	CGC	2	6	1006925	1006930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25041	NC_017272	GCT	2	6	1007004	1007009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431224
25042	NC_017272	CGC	2	6	1007014	1007019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25043	NC_017272	CCG	2	6	1007034	1007039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25044	NC_017272	CCA	2	6	1007040	1007045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431224
25045	NC_017272	CGC	2	6	1007054	1007059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25046	NC_017272	GTA	2	6	1007071	1007076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431224
25047	NC_017272	GGC	2	6	1007089	1007094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431224
25048	NC_017272	GGT	3	9	1007095	1007103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431224
25049	NC_017272	CCT	2	6	1007184	1007189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25050	NC_017272	ACC	2	6	1007216	1007221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431224
25051	NC_017272	CCT	2	6	1007274	1007279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25052	NC_017272	GCG	2	6	1007329	1007334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431224
25053	NC_017272	TCC	3	9	1007360	1007368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25054	NC_017272	CCGGCC	2	12	1007374	1007385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431224
25055	NC_017272	CCT	2	6	1007403	1007408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431224
25056	NC_017272	CG	3	6	1007414	1007419	0 %	0 %	50 %	50 %	384431224
25057	NC_017272	GCT	2	6	1007424	1007429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431224
25058	NC_017272	GCCC	2	8	1007537	1007544	0 %	0 %	25 %	75 %	384431225
25059	NC_017272	CGC	2	6	1007545	1007550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431225
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25062	NC_017272	TCC	2	6	1007638	1007643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431225
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25066	NC_017272	GGCCGC	2	12	1007780	1007791	0 %	0 %	50 %	50 %	384431225
25067	NC_017272	CCA	2	6	1007812	1007817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431225
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25069	NC_017272	GGGGC	2	10	1007867	1007876	0 %	0 %	80 %	20 %	384431225
25070	NC_017272	G	6	6	1007979	1007984	0 %	0 %	100 %	0 %	384431225
25071	NC_017272	TAG	2	6	1007985	1007990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431225
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25085	NC_017272	GC	3	6	1008570	1008575	0 %	0 %	50 %	50 %	384431227
25086	NC_017272	CCT	2	6	1008592	1008597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431227
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25088	NC_017272	TCG	2	6	1008702	1008707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431227
25089	NC_017272	GAT	2	6	1008728	1008733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431227
25090	NC_017272	CCT	2	6	1008751	1008756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431227
25091	NC_017272	GGTAGC	2	12	1008760	1008771	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384431227
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25095	NC_017272	C	6	6	1008825	1008830	0 %	0 %	0 %	100 %	384431227
25096	NC_017272	GCG	2	6	1008833	1008838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431227
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25099	NC_017272	GAT	2	6	1008950	1008955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431227
25100	NC_017272	CTG	2	6	1008956	1008961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431227
25101	NC_017272	TGG	2	6	1008976	1008981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431227
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25103	NC_017272	CAGGGC	2	12	1008998	1009009	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431227
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25116	NC_017272	CCG	2	6	1009366	1009371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431227
25117	NC_017272	CGGAGA	2	12	1009399	1009410	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384431227
25118	NC_017272	G	7	7	1009481	1009487	0 %	0 %	100 %	0 %	384431227
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25121	NC_017272	GGT	2	6	1009634	1009639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431227
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25123	NC_017272	GGT	2	6	1009735	1009740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431227
25124	NC_017272	CTT	2	6	1009811	1009816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431227
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25202	NC_017272	GCT	2	6	1012971	1012976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431230
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25221	NC_017272	GAG	2	6	1013723	1013728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431232
25222	NC_017272	CT	3	6	1013837	1013842	0 %	50 %	0 %	50 %	384431232
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25224	NC_017272	TCC	4	12	1013867	1013878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431233
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25226	NC_017272	GAG	2	6	1013893	1013898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431233
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25228	NC_017272	AGGACC	2	12	1013921	1013932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431233
25229	NC_017272	TCC	3	9	1013933	1013941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431233
25230	NC_017272	AGG	2	6	1013943	1013948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431233
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25232	NC_017272	G	7	7	1014009	1014015	0 %	0 %	100 %	0 %	384431233
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25465	NC_017272	GGC	2	6	1022612	1022617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431243
25466	NC_017272	A	6	6	1022641	1022646	100 %	0 %	0 %	0 %	384431243
25467	NC_017272	TCC	2	6	1022656	1022661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25468	NC_017272	CCT	2	6	1022690	1022695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25469	NC_017272	GCC	2	6	1022700	1022705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431243
25470	NC_017272	GGC	2	6	1022708	1022713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431243
25471	NC_017272	TCC	2	6	1022755	1022760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25472	NC_017272	CGG	2	6	1022803	1022808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431243
25473	NC_017272	TTC	2	6	1022859	1022864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431243
25474	NC_017272	CGA	2	6	1022888	1022893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431243
25475	NC_017272	GAG	3	9	1022898	1022906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431243
25476	NC_017272	ACC	2	6	1022929	1022934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431243
25477	NC_017272	TCC	2	6	1022995	1023000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25478	NC_017272	CTT	2	6	1023113	1023118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431243
25479	NC_017272	CCAC	2	8	1023160	1023167	25 %	0 %	0 %	75 %	384431243
25480	NC_017272	GTG	2	6	1023189	1023194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431243
25481	NC_017272	GACGGG	2	12	1023225	1023236	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431243
25482	NC_017272	CGC	2	6	1023299	1023304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431243
25483	NC_017272	GTG	2	6	1023327	1023332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431243
25484	NC_017272	TGA	2	6	1023340	1023345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431243
25485	NC_017272	GGGAG	2	10	1023455	1023464	20 %	0 %	80 %	0 %	384431243
25486	NC_017272	TCC	2	6	1023484	1023489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25487	NC_017272	CCA	2	6	1023491	1023496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431243
25488	NC_017272	CAC	2	6	1023497	1023502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431243
25489	NC_017272	CCT	2	6	1023512	1023517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25490	NC_017272	CTC	2	6	1023525	1023530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25491	NC_017272	CTC	2	6	1023606	1023611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431243
25492	NC_017272	CGAGGC	2	12	1023674	1023685	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384431243
25493	NC_017272	G	6	6	1023693	1023698	0 %	0 %	100 %	0 %	384431243
25494	NC_017272	TGG	2	6	1023751	1023756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431243
25495	NC_017272	GGA	2	6	1023761	1023766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431243
25496	NC_017272	GGA	2	6	1023773	1023778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431243
25497	NC_017272	ATG	2	6	1023836	1023841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431243
25498	NC_017272	AGC	2	6	1023877	1023882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384431244
25499	NC_017272	ACT	2	6	1023931	1023936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431244
25500	NC_017272	CCT	2	6	1023962	1023967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431244

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