MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_017272	GC	3	6	860740	860745	0 %	0 %	50 %	50 %	384431086
21502	NC_017272	CCTCGG	2	12	860757	860768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384431086
21503	NC_017272	CTCCGC	2	12	860815	860826	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384431086
21504	NC_017272	TTCC	2	8	860859	860866	0 %	50 %	0 %	50 %	384431086
21505	NC_017272	GCC	2	6	860918	860923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21506	NC_017272	CCG	2	6	860926	860931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21507	NC_017272	AGG	2	6	860966	860971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21508	NC_017272	TCC	3	9	860999	861007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21509	NC_017272	TTC	2	6	861043	861048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431086
21510	NC_017272	CGC	2	6	861130	861135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21511	NC_017272	CTC	2	6	861136	861141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21512	NC_017272	CTC	2	6	861157	861162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21513	NC_017272	AAG	2	6	861182	861187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384431086
21514	NC_017272	CTG	2	6	861205	861210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431086
21515	NC_017272	GAG	2	6	861211	861216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21516	NC_017272	GCC	2	6	861230	861235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21517	NC_017272	CGG	2	6	861277	861282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431086
21518	NC_017272	G	7	7	861301	861307	0 %	0 %	100 %	0 %	384431086
21519	NC_017272	A	6	6	861336	861341	100 %	0 %	0 %	0 %	384431086
21520	NC_017272	GGGCCT	2	12	861345	861356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431086
21521	NC_017272	AGGG	2	8	861370	861377	25 %	0 %	75 %	0 %	384431086
21522	NC_017272	GGGCCT	2	12	861402	861413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384431086
21523	NC_017272	TCC	2	6	861431	861436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21524	NC_017272	TCA	2	6	861446	861451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384431086
21525	NC_017272	GCC	3	9	861453	861461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21526	NC_017272	AGG	3	9	861464	861472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21527	NC_017272	C	7	7	861477	861483	0 %	0 %	0 %	100 %	384431086
21528	NC_017272	GC	3	6	861485	861490	0 %	0 %	50 %	50 %	384431086
21529	NC_017272	CCG	2	6	861497	861502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21530	NC_017272	CCA	2	6	861522	861527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21531	NC_017272	TCCCC	2	10	861554	861563	0 %	20 %	0 %	80 %	384431086
21532	NC_017272	CCT	2	6	861639	861644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21533	NC_017272	GCGG	2	8	861679	861686	0 %	0 %	75 %	25 %	384431086
21534	NC_017272	GGGGGC	2	12	861723	861734	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384431086
21535	NC_017272	GGA	2	6	861735	861740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21536	NC_017272	GGA	2	6	861750	861755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21537	NC_017272	GCCC	2	8	861761	861768	0 %	0 %	25 %	75 %	384431086
21538	NC_017272	C	7	7	861766	861772	0 %	0 %	0 %	100 %	384431086
21539	NC_017272	GCC	2	6	861803	861808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21540	NC_017272	TCC	2	6	861815	861820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21541	NC_017272	GGA	2	6	861888	861893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21542	NC_017272	CCA	2	6	861900	861905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21543	NC_017272	CCA	2	6	861969	861974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21544	NC_017272	CTG	2	6	862012	862017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431086
21545	NC_017272	CCT	2	6	862086	862091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21546	NC_017272	GGCG	2	8	862146	862153	0 %	0 %	75 %	25 %	384431086
21547	NC_017272	CGG	2	6	862193	862198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431086
21548	NC_017272	TCC	2	6	862205	862210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21549	NC_017272	TCC	2	6	862244	862249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21550	NC_017272	CTT	2	6	862287	862292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384431086
21551	NC_017272	G	6	6	862321	862326	0 %	0 %	100 %	0 %	384431086
21552	NC_017272	GGA	2	6	862347	862352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21553	NC_017272	TCC	2	6	862415	862420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21554	NC_017272	TCC	2	6	862439	862444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21555	NC_017272	GAG	2	6	862450	862455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21556	NC_017272	GAG	2	6	862471	862476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21557	NC_017272	CCT	2	6	862488	862493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21558	NC_017272	TCC	2	6	862550	862555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21559	NC_017272	CCT	2	6	862563	862568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21560	NC_017272	AGG	3	9	862577	862585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21561	NC_017272	CCT	3	9	862665	862673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21562	NC_017272	CTC	2	6	862699	862704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21563	NC_017272	GCC	3	9	862712	862720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21564	NC_017272	CTC	2	6	862732	862737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21565	NC_017272	CGC	2	6	862774	862779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431086
21566	NC_017272	CTC	2	6	862780	862785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21567	NC_017272	GAG	2	6	862795	862800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21568	NC_017272	CAC	2	6	862846	862851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21569	NC_017272	GAGGGC	2	12	862891	862902	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431086
21570	NC_017272	GGC	2	6	862917	862922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431086
21571	NC_017272	CCA	3	9	862965	862973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21572	NC_017272	G	8	8	863022	863029	0 %	0 %	100 %	0 %	384431086
21573	NC_017272	AGG	2	6	863051	863056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21574	NC_017272	CTC	2	6	863065	863070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431086
21575	NC_017272	C	6	6	863070	863075	0 %	0 %	0 %	100 %	384431086
21576	NC_017272	CCA	2	6	863118	863123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431086
21577	NC_017272	GAT	2	6	863152	863157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431086
21578	NC_017272	AGG	2	6	863183	863188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21579	NC_017272	GGA	2	6	863217	863222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431086
21580	NC_017272	TCCAGG	2	12	863272	863283	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384431087
21581	NC_017272	CCA	2	6	863312	863317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431087
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21584	NC_017272	CCG	2	6	863450	863455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431087
21585	NC_017272	G	6	6	863468	863473	0 %	0 %	100 %	0 %	384431087
21586	NC_017272	GAG	2	6	863502	863507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431087
21587	NC_017272	GGA	2	6	863561	863566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431087
21588	NC_017272	TCC	2	6	863611	863616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431087
21589	NC_017272	CG	3	6	863617	863622	0 %	0 %	50 %	50 %	384431087
21590	NC_017272	GGGCAG	2	12	863634	863645	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384431087
21591	NC_017272	G	6	6	863653	863658	0 %	0 %	100 %	0 %	384431087
21592	NC_017272	GAG	2	6	863715	863720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431087
21593	NC_017272	GC	3	6	863749	863754	0 %	0 %	50 %	50 %	384431088
21594	NC_017272	C	6	6	863754	863759	0 %	0 %	0 %	100 %	384431088
21595	NC_017272	CCT	2	6	863812	863817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431088
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21598	NC_017272	GGCG	2	8	863950	863957	0 %	0 %	75 %	25 %	384431088
21599	NC_017272	GGAG	2	8	864091	864098	25 %	0 %	75 %	0 %	384431088
21600	NC_017272	ACC	2	6	864099	864104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431088
21601	NC_017272	GC	3	6	864131	864136	0 %	0 %	50 %	50 %	384431088
21602	NC_017272	TCG	2	6	864153	864158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384431088
21603	NC_017272	AGG	2	6	864186	864191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431088
21604	NC_017272	CGG	2	6	864201	864206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431088
21605	NC_017272	CCT	2	6	864223	864228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431088
21606	NC_017272	CCA	2	6	864232	864237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384431088
21607	NC_017272	TCC	2	6	864261	864266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431088
21608	NC_017272	CCG	2	6	864267	864272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431088
21609	NC_017272	AGG	2	6	864285	864290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431088
21610	NC_017272	GAGGG	2	10	864300	864309	20 %	0 %	80 %	0 %	384431088
21611	NC_017272	G	6	6	864313	864318	0 %	0 %	100 %	0 %	384431088
21612	NC_017272	GCC	2	6	864338	864343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384431088
21613	NC_017272	GTA	2	6	864350	864355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384431088
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21616	NC_017272	CCT	2	6	864400	864405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384431088
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21619	NC_017272	GGA	2	6	864490	864495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384431088
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21983	NC_017272	GTG	2	6	878415	878420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384431104
21984	NC_017272	CAA	2	6	878477	878482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384431104
21985	NC_017272	GCG	2	6	878566	878571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431104
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21987	NC_017272	G	6	6	878640	878645	0 %	0 %	100 %	0 %	384431104
21988	NC_017272	CGG	2	6	878680	878685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384431104
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