MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017272	ACCAA	2	10	64672	64681	60 %	0 %	0 %	40 %	384430275
1502	NC_017272	TCC	2	6	64794	64799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430276
1503	NC_017272	CGG	2	6	64808	64813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430276
1504	NC_017272	AGG	3	9	64862	64870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1505	NC_017272	GTC	2	6	65008	65013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430276
1506	NC_017272	AGGGCC	2	12	65024	65035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430276
1507	NC_017272	AGA	3	9	65055	65063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430276
1508	NC_017272	GCCCA	2	10	65114	65123	20 %	0 %	20 %	60 %	384430276
1509	NC_017272	CCG	2	6	65150	65155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430276
1510	NC_017272	TGT	2	6	65163	65168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384430276
1511	NC_017272	GGC	2	6	65239	65244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430276
1512	NC_017272	GAG	2	6	65245	65250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1513	NC_017272	C	6	6	65256	65261	0 %	0 %	0 %	100 %	384430276
1514	NC_017272	GCGAAG	2	12	65294	65305	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384430276
1515	NC_017272	AGG	2	6	65306	65311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1516	NC_017272	CCA	3	9	65388	65396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430276
1517	NC_017272	GCC	2	6	65411	65416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430276
1518	NC_017272	CAT	2	6	65422	65427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430276
1519	NC_017272	GGC	2	6	65479	65484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430276
1520	NC_017272	CCCG	2	8	65569	65576	0 %	0 %	25 %	75 %	384430276
1521	NC_017272	CGC	2	6	65595	65600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430276
1522	NC_017272	AGG	3	9	65684	65692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1523	NC_017272	GGA	2	6	65694	65699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1524	NC_017272	G	6	6	65799	65804	0 %	0 %	100 %	0 %	384430276
1525	NC_017272	CCA	2	6	65820	65825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430276
1526	NC_017272	GGA	2	6	65877	65882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1527	NC_017272	AGG	2	6	65960	65965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1528	NC_017272	AGG	2	6	66005	66010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1529	NC_017272	CCA	2	6	66085	66090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430276
1530	NC_017272	GGC	2	6	66106	66111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430276
1531	NC_017272	GAG	2	6	66112	66117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1532	NC_017272	AGG	2	6	66201	66206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1533	NC_017272	CCA	2	6	66210	66215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430276
1534	NC_017272	GAA	2	6	66232	66237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430276
1535	NC_017272	GCCCC	2	10	66246	66255	0 %	0 %	20 %	80 %	384430276
1536	NC_017272	GCCGG	2	10	66258	66267	0 %	0 %	60 %	40 %	384430276
1537	NC_017272	GC	3	6	66284	66289	0 %	0 %	50 %	50 %	384430276
1538	NC_017272	GGTG	2	8	66345	66352	0 %	25 %	75 %	0 %	384430276
1539	NC_017272	GC	3	6	66378	66383	0 %	0 %	50 %	50 %	384430276
1540	NC_017272	AGG	2	6	66488	66493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430276
1541	NC_017272	CGC	2	6	66738	66743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1542	NC_017272	CCT	3	9	66747	66755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1543	NC_017272	TGG	2	6	66776	66781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1544	NC_017272	GCCC	2	8	66792	66799	0 %	0 %	25 %	75 %	384430277
1545	NC_017272	CTC	2	6	66808	66813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1546	NC_017272	CGCCTT	2	12	66816	66827	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430277
1547	NC_017272	GCC	2	6	66869	66874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1548	NC_017272	GGT	2	6	66891	66896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1549	NC_017272	CTC	2	6	66910	66915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1550	NC_017272	CCT	2	6	66935	66940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1551	NC_017272	CGC	2	6	66945	66950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1552	NC_017272	GGT	2	6	66957	66962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1553	NC_017272	GGA	2	6	67083	67088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430277
1554	NC_017272	CCT	2	6	67110	67115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1555	NC_017272	G	6	6	67167	67172	0 %	0 %	100 %	0 %	384430277
1556	NC_017272	CCT	2	6	67176	67181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1557	NC_017272	CCTC	2	8	67193	67200	0 %	25 %	0 %	75 %	384430277
1558	NC_017272	CGG	2	6	67203	67208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430277
1559	NC_017272	GGC	2	6	67278	67283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430277
1560	NC_017272	CGC	2	6	67329	67334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1561	NC_017272	GGC	2	6	67354	67359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430277
1562	NC_017272	TGG	2	6	67379	67384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1563	NC_017272	GTG	2	6	67495	67500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1564	NC_017272	GCCC	2	8	67512	67519	0 %	0 %	25 %	75 %	384430277
1565	NC_017272	CTC	2	6	67522	67527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1566	NC_017272	GCC	2	6	67528	67533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1567	NC_017272	G	6	6	67537	67542	0 %	0 %	100 %	0 %	384430277
1568	NC_017272	GGC	2	6	67551	67556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430277
1569	NC_017272	TGG	2	6	67574	67579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430277
1570	NC_017272	GGGC	2	8	67624	67631	0 %	0 %	75 %	25 %	384430277
1571	NC_017272	CGC	2	6	67659	67664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
1572	NC_017272	G	6	6	67674	67679	0 %	0 %	100 %	0 %	384430277
1573	NC_017272	G	6	6	67697	67702	0 %	0 %	100 %	0 %	384430277
1574	NC_017272	CTC	2	6	67705	67710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430277
1575	NC_017272	GCC	2	6	67723	67728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430277
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1583	NC_017272	GGC	2	6	67869	67874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430278
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1589	NC_017272	GGA	2	6	68165	68170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430278
1590	NC_017272	GGT	2	6	68223	68228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430278
1591	NC_017272	GCC	2	6	68238	68243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430278
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1593	NC_017272	GAA	2	6	68310	68315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430278
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1595	NC_017272	GAG	2	6	68394	68399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430278
1596	NC_017272	C	6	6	68405	68410	0 %	0 %	0 %	100 %	384430278
1597	NC_017272	GAG	3	9	68487	68495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430278
1598	NC_017272	GAG	2	6	68499	68504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430278
1599	NC_017272	GCCC	2	8	68508	68515	0 %	0 %	25 %	75 %	384430278
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1609	NC_017272	GCC	2	6	68812	68817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430278
1610	NC_017272	CGG	2	6	68906	68911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430278
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