MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017272	CGGG	2	8	24507	24514	0 %	0 %	75 %	25 %	384430228
502	NC_017272	GGGC	2	8	24602	24609	0 %	0 %	75 %	25 %	384430228
503	NC_017272	CAA	2	6	24641	24646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430228
504	NC_017272	GGCCCT	2	12	24656	24667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430228
505	NC_017272	TGGG	2	8	24684	24691	0 %	25 %	75 %	0 %	384430228
506	NC_017272	C	6	6	24700	24705	0 %	0 %	0 %	100 %	384430228
507	NC_017272	GAG	3	9	24726	24734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430228
508	NC_017272	GCA	2	6	24749	24754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430228
509	NC_017272	CGG	2	6	24862	24867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430228
510	NC_017272	CGC	2	6	24878	24883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430228
511	NC_017272	GGC	2	6	24891	24896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430228
512	NC_017272	AGG	2	6	24934	24939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430228
513	NC_017272	CCT	2	6	24964	24969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430228
514	NC_017272	GCCC	2	8	25019	25026	0 %	0 %	25 %	75 %	384430228
515	NC_017272	ACCG	2	8	25032	25039	25 %	0 %	25 %	50 %	384430228
516	NC_017272	CCT	2	6	25073	25078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430228
517	NC_017272	GAA	2	6	25187	25192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430228
518	NC_017272	CCG	2	6	25229	25234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430228
519	NC_017272	TCC	2	6	25338	25343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430229
520	NC_017272	TGG	3	9	25353	25361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430229
521	NC_017272	TGG	2	6	25365	25370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430229
522	NC_017272	TCT	2	6	25392	25397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430229
523	NC_017272	CTT	2	6	25405	25410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430229
524	NC_017272	TCA	2	6	25572	25577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430229
525	NC_017272	GGT	2	6	25645	25650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430229
526	NC_017272	ACG	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430229
527	NC_017272	TCA	2	6	25695	25700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430229
528	NC_017272	CCT	2	6	25723	25728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430229
529	NC_017272	GGCCC	2	10	25750	25759	0 %	0 %	40 %	60 %	384430229
530	NC_017272	CAT	2	6	25777	25782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430229
531	NC_017272	CTC	4	12	25820	25831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430229
532	NC_017272	GAT	2	6	25843	25848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430229
533	NC_017272	GGA	2	6	25852	25857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430229
534	NC_017272	GGC	2	6	25867	25872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430229
535	NC_017272	GCA	2	6	25897	25902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430229
536	NC_017272	CTC	2	6	25925	25930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430229
537	NC_017272	TGG	3	9	25941	25949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430229
538	NC_017272	GCG	2	6	26007	26012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430229
539	NC_017272	TGG	2	6	26058	26063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430229
540	NC_017272	ATC	2	6	26114	26119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430229
541	NC_017272	AGG	2	6	26157	26162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430229
542	NC_017272	GCC	2	6	26183	26188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430230
543	NC_017272	TCT	2	6	26204	26209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430230
544	NC_017272	CCT	2	6	26211	26216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
545	NC_017272	TCG	3	9	26225	26233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430230
546	NC_017272	TCC	2	6	26315	26320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
547	NC_017272	CCT	2	6	26382	26387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
548	NC_017272	TCG	2	6	26399	26404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430230
549	NC_017272	CTC	2	6	26419	26424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
550	NC_017272	CGC	2	6	26445	26450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430230
551	NC_017272	CTTCC	2	10	26467	26476	0 %	40 %	0 %	60 %	384430230
552	NC_017272	GGC	2	6	26542	26547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430230
553	NC_017272	TCC	3	9	26552	26560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
554	NC_017272	ACCT	2	8	26605	26612	25 %	25 %	0 %	50 %	384430230
555	NC_017272	TGG	2	6	26645	26650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430230
556	NC_017272	GGA	2	6	26679	26684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430230
557	NC_017272	GGC	2	6	26685	26690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430230
558	NC_017272	CTC	2	6	26722	26727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
559	NC_017272	CAC	2	6	26763	26768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430230
560	NC_017272	CTC	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430230
561	NC_017272	CGC	2	6	26787	26792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430230
562	NC_017272	C	6	6	26851	26856	0 %	0 %	0 %	100 %	384430230
563	NC_017272	CGG	2	6	26871	26876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430230
564	NC_017272	CAT	2	6	26907	26912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430230
565	NC_017272	GCC	2	6	26914	26919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430230
566	NC_017272	GTG	2	6	26923	26928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430230
567	NC_017272	TGG	2	6	26942	26947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430230
568	NC_017272	TCCTCG	2	12	26948	26959	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430230
569	NC_017272	GGA	2	6	27047	27052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
570	NC_017272	GCC	2	6	27166	27171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430231
571	NC_017272	ACC	2	6	27172	27177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430231
572	NC_017272	GGA	2	6	27227	27232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
573	NC_017272	CCT	2	6	27263	27268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430231
574	NC_017272	GGC	2	6	27338	27343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430231
575	NC_017272	CAT	2	6	27399	27404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430231
576	NC_017272	CCG	2	6	27407	27412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430231
577	NC_017272	GGA	2	6	27470	27475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
578	NC_017272	CTC	2	6	27492	27497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430231
579	NC_017272	GAG	2	6	27522	27527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
580	NC_017272	AGG	2	6	27601	27606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
581	NC_017272	CCG	2	6	27617	27622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430231
582	NC_017272	GTG	2	6	27655	27660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430231
583	NC_017272	GGT	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430231
584	NC_017272	GCG	2	6	27676	27681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430231
585	NC_017272	TCA	2	6	27701	27706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430231
586	NC_017272	GAG	2	6	27786	27791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
587	NC_017272	CGT	2	6	27836	27841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430231
588	NC_017272	CAC	2	6	27885	27890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430231
589	NC_017272	C	7	7	27944	27950	0 %	0 %	0 %	100 %	384430231
590	NC_017272	GAG	2	6	28110	28115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
591	NC_017272	CTC	2	6	28128	28133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430231
592	NC_017272	CCG	2	6	28157	28162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430231
593	NC_017272	C	6	6	28165	28170	0 %	0 %	0 %	100 %	384430231
594	NC_017272	G	7	7	28173	28179	0 %	0 %	100 %	0 %	384430231
595	NC_017272	GCC	2	6	28191	28196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430231
596	NC_017272	TCC	2	6	28198	28203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430231
597	NC_017272	G	6	6	28204	28209	0 %	0 %	100 %	0 %	384430231
598	NC_017272	GAG	2	6	28224	28229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
599	NC_017272	GTG	2	6	28251	28256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430231
600	NC_017272	GCG	2	6	28342	28347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430231
601	NC_017272	GCT	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430231
602	NC_017272	GTA	2	6	28572	28577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430231
603	NC_017272	GAG	2	6	28584	28589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430231
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605	NC_017272	TTC	2	6	28696	28701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430232
606	NC_017272	CCT	2	6	28779	28784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
607	NC_017272	GGGCCT	2	12	28803	28814	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430232
608	NC_017272	CTG	2	6	28843	28848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430232
609	NC_017272	CCT	2	6	28851	28856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
610	NC_017272	CTC	2	6	28882	28887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
611	NC_017272	GAG	2	6	28906	28911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430232
612	NC_017272	CGG	2	6	29013	29018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430232
613	NC_017272	CTT	2	6	29061	29066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430232
614	NC_017272	TCC	2	6	29135	29140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
615	NC_017272	CCT	3	9	29217	29225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
616	NC_017272	GCC	2	6	29315	29320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430232
617	NC_017272	CCA	2	6	29322	29327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430232
618	NC_017272	GAAG	2	8	29364	29371	50 %	0 %	50 %	0 %	384430232
619	NC_017272	CTG	2	6	29398	29403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430232
620	NC_017272	CTG	2	6	29419	29424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430232
621	NC_017272	GAG	2	6	29455	29460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430232
622	NC_017272	CGGG	2	8	29487	29494	0 %	0 %	75 %	25 %	384430232
623	NC_017272	CTT	2	6	29539	29544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430232
624	NC_017272	TTC	2	6	29551	29556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430232
625	NC_017272	CCT	2	6	29622	29627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
626	NC_017272	TCC	2	6	29657	29662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430232
627	NC_017272	GTA	2	6	29674	29679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430232
628	NC_017272	CGG	2	6	29688	29693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430232
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630	NC_017272	ACC	2	6	29759	29764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430232
631	NC_017272	GCCC	2	8	29797	29804	0 %	0 %	25 %	75 %	384430232
632	NC_017272	GCG	2	6	29855	29860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430232
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634	NC_017272	GGCCTT	2	12	29872	29883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430232
635	NC_017272	GGC	2	6	29884	29889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430232
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644	NC_017272	GCG	2	6	30200	30205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430232
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658	NC_017272	CTC	2	6	30903	30908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430233
659	NC_017272	TGG	2	6	30928	30933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430233
660	NC_017272	CCTGGC	2	12	30989	31000	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430233
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746	NC_017272	TCCTC	2	10	34090	34099	0 %	40 %	0 %	60 %	384430237
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750	NC_017272	GGCGG	2	10	34259	34268	0 %	0 %	80 %	20 %	384430237
751	NC_017272	CCA	2	6	34333	34338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430237
752	NC_017272	GGACA	2	10	34508	34517	40 %	0 %	40 %	20 %	384430238
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880	NC_017272	GGGCCC	2	12	39632	39643	0 %	0 %	50 %	50 %	384430244
881	NC_017272	GGC	2	6	39693	39698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430244
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