MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 46934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017272	GAC	2	6	36	41	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
2	NC_017272	CCG	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
3	NC_017272	CCT	2	6	190	195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
4	NC_017272	CTGGA	2	10	201	210	20 %	20 %	40 %	20 %	384430209
5	NC_017272	AGG	2	6	238	243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
6	NC_017272	CCT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
7	NC_017272	GTG	2	6	288	293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
8	NC_017272	AGG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
9	NC_017272	GCC	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
10	NC_017272	CCG	2	6	334	339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
11	NC_017272	C	6	6	343	348	0 %	0 %	0 %	100 %	384430209
12	NC_017272	GTG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
13	NC_017272	CAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430209
14	NC_017272	CGC	3	9	416	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
15	NC_017272	CGTGGC	2	12	425	436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384430209
16	NC_017272	CCGG	2	8	445	452	0 %	0 %	50 %	50 %	384430209
17	NC_017272	TCA	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
18	NC_017272	CCT	2	6	653	658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
19	NC_017272	TGG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
20	NC_017272	ACG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
21	NC_017272	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
22	NC_017272	ATC	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
23	NC_017272	CTC	2	6	761	766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
24	NC_017272	GCC	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
25	NC_017272	GC	3	6	801	806	0 %	0 %	50 %	50 %	384430209
26	NC_017272	C	6	6	849	854	0 %	0 %	0 %	100 %	384430209
27	NC_017272	AGC	2	6	895	900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
28	NC_017272	TCGCCT	2	12	994	1005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384430209
29	NC_017272	ATC	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
30	NC_017272	GGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
31	NC_017272	AAG	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430209
32	NC_017272	GGT	2	6	1169	1174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
33	NC_017272	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430209
34	NC_017272	ACCAC	2	10	1261	1270	40 %	0 %	0 %	60 %	384430209
35	NC_017272	TCC	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
36	NC_017272	CTC	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
37	NC_017272	CCT	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
38	NC_017272	ACCT	2	8	1756	1763	25 %	25 %	0 %	50 %	384430210
39	NC_017272	CCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
40	NC_017272	CTT	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430210
41	NC_017272	GCCTC	2	10	1931	1940	0 %	20 %	20 %	60 %	384430210
42	NC_017272	AGGC	2	8	1943	1950	25 %	0 %	50 %	25 %	384430210
43	NC_017272	G	7	7	1953	1959	0 %	0 %	100 %	0 %	384430210
44	NC_017272	CTC	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
45	NC_017272	GGA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
46	NC_017272	CGC	2	6	2124	2129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
47	NC_017272	GAG	2	6	2137	2142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
48	NC_017272	C	6	6	2180	2185	0 %	0 %	0 %	100 %	384430210
49	NC_017272	CCTGCC	2	12	2235	2246	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384430210
50	NC_017272	GGCCGA	2	12	2325	2336	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384430210
51	NC_017272	TGGCCC	2	12	2360	2371	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430210
52	NC_017272	ACC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430210
53	NC_017272	CCT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
54	NC_017272	GGA	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
55	NC_017272	TCC	2	6	2570	2575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
56	NC_017272	CCG	2	6	2579	2584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
57	NC_017272	AGG	3	9	2606	2614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
58	NC_017272	GCCC	2	8	2616	2623	0 %	0 %	25 %	75 %	384430210
59	NC_017272	CCT	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
60	NC_017272	CGAGCC	2	12	2726	2737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384430210
61	NC_017272	G	6	6	2744	2749	0 %	0 %	100 %	0 %	384430210
62	NC_017272	GGT	3	9	2769	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430210
63	NC_017272	ACC	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430211
64	NC_017272	TCG	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430211
65	NC_017272	GGGCC	2	10	2940	2949	0 %	0 %	60 %	40 %	384430211
66	NC_017272	CGG	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
67	NC_017272	GCTGGA	2	12	3123	3134	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384430211
68	NC_017272	CAA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430211
69	NC_017272	GCG	2	6	3202	3207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
70	NC_017272	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430211
71	NC_017272	G	6	6	3295	3300	0 %	0 %	100 %	0 %	384430211
72	NC_017272	CCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430211
73	NC_017272	GAGG	2	8	3454	3461	25 %	0 %	75 %	0 %	384430211
74	NC_017272	GAG	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
75	NC_017272	CTC	2	6	3508	3513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430211
76	NC_017272	GCGG	2	8	3522	3529	0 %	0 %	75 %	25 %	384430211
77	NC_017272	AGG	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
78	NC_017272	CCCTGG	2	12	3554	3565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430211
79	NC_017272	CGAG	2	8	3575	3582	25 %	0 %	50 %	25 %	384430211
80	NC_017272	CGGGA	2	10	3589	3598	20 %	0 %	60 %	20 %	384430211
81	NC_017272	ACC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430211
82	NC_017272	TCCTC	2	10	3626	3635	0 %	40 %	0 %	60 %	384430211
83	NC_017272	GGA	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
84	NC_017272	TGG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430211
85	NC_017272	GAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430211
86	NC_017272	GGC	2	6	3728	3733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
87	NC_017272	G	6	6	3750	3755	0 %	0 %	100 %	0 %	384430211
88	NC_017272	GAC	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430211
89	NC_017272	CGGG	2	8	3808	3815	0 %	0 %	75 %	25 %	384430211
90	NC_017272	G	6	6	3824	3829	0 %	0 %	100 %	0 %	384430211
91	NC_017272	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
92	NC_017272	GAG	3	9	4063	4071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
93	NC_017272	GGGCC	2	10	4074	4083	0 %	0 %	60 %	40 %	384430211
94	NC_017272	GCC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430211
95	NC_017272	GAC	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
96	NC_017272	AGG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
97	NC_017272	GGA	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
98	NC_017272	TCC	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
99	NC_017272	TCC	3	9	4353	4361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
100	NC_017272	CCG	2	6	4386	4391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
101	NC_017272	CCT	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
102	NC_017272	GAC	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
103	NC_017272	GGAGGT	2	12	4534	4545	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430212
104	NC_017272	CAA	3	9	4561	4569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430212
105	NC_017272	GAC	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
106	NC_017272	CTC	3	9	4700	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
107	NC_017272	GAG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
108	NC_017272	GGA	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
109	NC_017272	TGG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
110	NC_017272	G	6	6	4830	4835	0 %	0 %	100 %	0 %	384430212
111	NC_017272	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
112	NC_017272	TCC	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
113	NC_017272	CGC	2	6	4903	4908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
114	NC_017272	CGG	2	6	5043	5048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
115	NC_017272	ATG	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430212
116	NC_017272	TCC	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
117	NC_017272	TCC	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
118	NC_017272	GCCCC	2	10	5145	5154	0 %	0 %	20 %	80 %	384430212
119	NC_017272	CAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430212
120	NC_017272	GGC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
121	NC_017272	GAC	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
122	NC_017272	GTG	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
123	NC_017272	GGC	2	6	5246	5251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
124	NC_017272	GGA	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
125	NC_017272	G	6	6	5343	5348	0 %	0 %	100 %	0 %	384430212
126	NC_017272	CGA	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
127	NC_017272	GGT	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
128	NC_017272	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
129	NC_017272	GAC	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
130	NC_017272	AGG	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
131	NC_017272	GAG	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
132	NC_017272	GGGGTA	2	12	5675	5686	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384430213
133	NC_017272	CCT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
134	NC_017272	GAG	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
135	NC_017272	GC	3	6	5765	5770	0 %	0 %	50 %	50 %	384430213
136	NC_017272	GAG	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
137	NC_017272	TCC	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
138	NC_017272	GGAAG	2	10	5992	6001	40 %	0 %	60 %	0 %	384430213
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141	NC_017272	GGA	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
142	NC_017272	GGT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430213
143	NC_017272	AGA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430213
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158	NC_017272	GGGCCC	2	12	6930	6941	0 %	0 %	50 %	50 %	384430214
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172	NC_017272	GAG	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430215
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254	NC_017272	TGGG	2	8	11248	11255	0 %	25 %	75 %	0 %	384430218
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265	NC_017272	GCCTCG	2	12	15058	15069	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384430219
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267	NC_017272	CGG	2	6	15161	15166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430219
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394	NC_017272	GCG	2	6	20303	20308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430223
395	NC_017272	TCC	2	6	20316	20321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430223
396	NC_017272	GAG	3	9	20324	20332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430223
397	NC_017272	G	6	6	20348	20353	0 %	0 %	100 %	0 %	384430223
398	NC_017272	TCC	2	6	20355	20360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430223
399	NC_017272	TCC	2	6	20448	20453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430223
400	NC_017272	C	8	8	20460	20467	0 %	0 %	0 %	100 %	384430223
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402	NC_017272	CTT	2	6	20488	20493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430223
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