MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017268	TGC	2	6	240355	240360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4002	NC_017268	G	6	6	240361	240366	0 %	0 %	100 %	0 %	384421768
4003	NC_017268	CGT	2	6	240372	240377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4004	NC_017268	G	8	8	240401	240408	0 %	0 %	100 %	0 %	384421768
4005	NC_017268	CCG	2	6	240411	240416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421768
4006	NC_017268	GGT	2	6	240425	240430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421768
4007	NC_017268	CT	3	6	240456	240461	0 %	50 %	0 %	50 %	384421768
4008	NC_017268	TGG	2	6	240469	240474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421768
4009	NC_017268	AGG	2	6	240493	240498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421768
4010	NC_017268	TCG	2	6	240527	240532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4011	NC_017268	GCAAT	2	10	240627	240636	40 %	20 %	20 %	20 %	384421768
4012	NC_017268	GGCA	2	8	240648	240655	25 %	0 %	50 %	25 %	384421768
4013	NC_017268	GCC	2	6	240662	240667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421768
4014	NC_017268	TCAT	2	8	240686	240693	25 %	50 %	0 %	25 %	384421768
4015	NC_017268	CGG	2	6	240707	240712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421768
4016	NC_017268	TGCGC	2	10	240788	240797	0 %	20 %	40 %	40 %	384421768
4017	NC_017268	GCA	2	6	240809	240814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4018	NC_017268	CG	3	6	240831	240836	0 %	0 %	50 %	50 %	384421768
4019	NC_017268	CGC	2	6	240953	240958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421768
4020	NC_017268	TGA	2	6	240976	240981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421768
4021	NC_017268	TCA	2	6	241027	241032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421768
4022	NC_017268	GGT	2	6	241061	241066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421768
4023	NC_017268	GT	3	6	241065	241070	0 %	50 %	50 %	0 %	384421768
4024	NC_017268	GCA	2	6	241073	241078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4025	NC_017268	GTTT	2	8	241160	241167	0 %	75 %	25 %	0 %	384421768
4026	NC_017268	GCA	2	6	241171	241176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4027	NC_017268	CGC	2	6	241199	241204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421768
4028	NC_017268	GT	3	6	241271	241276	0 %	50 %	50 %	0 %	384421768
4029	NC_017268	GGCA	2	8	241289	241296	25 %	0 %	50 %	25 %	384421768
4030	NC_017268	CTG	2	6	241314	241319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4031	NC_017268	CAT	2	6	241327	241332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421768
4032	NC_017268	GTG	2	6	241338	241343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421768
4033	NC_017268	CAG	2	6	241344	241349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421768
4034	NC_017268	GC	3	6	241353	241358	0 %	0 %	50 %	50 %	384421768
4035	NC_017268	CGG	2	6	241384	241389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421768
4036	NC_017268	ATT	2	6	241546	241551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421769
4037	NC_017268	GGT	2	6	241566	241571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421769
4038	NC_017268	GCGGGT	2	12	241614	241625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384421769
4039	NC_017268	TGC	2	6	241706	241711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421769
4040	NC_017268	GCT	2	6	241735	241740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421769
4041	NC_017268	GCA	2	6	241760	241765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421769
4042	NC_017268	GTG	2	6	241820	241825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421769
4043	NC_017268	GCA	2	6	241855	241860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421769
4044	NC_017268	GGC	2	6	241862	241867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421769
4045	NC_017268	GT	3	6	241901	241906	0 %	50 %	50 %	0 %	384421769
4046	NC_017268	TGCG	2	8	241907	241914	0 %	25 %	50 %	25 %	384421769
4047	NC_017268	CATA	2	8	241924	241931	50 %	25 %	0 %	25 %	384421769
4048	NC_017268	CG	3	6	242031	242036	0 %	0 %	50 %	50 %	384421769
4049	NC_017268	CGTG	2	8	242053	242060	0 %	25 %	50 %	25 %	384421769
4050	NC_017268	CA	3	6	242087	242092	50 %	0 %	0 %	50 %	384421769
4051	NC_017268	TGT	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421770
4052	NC_017268	CGT	2	6	242517	242522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421770
4053	NC_017268	TTC	2	6	242556	242561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421770
4054	NC_017268	T	6	6	242563	242568	0 %	100 %	0 %	0 %	384421770
4055	NC_017268	GTATT	2	10	242609	242618	20 %	60 %	20 %	0 %	384421770
4056	NC_017268	TCC	2	6	242644	242649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421770
4057	NC_017268	T	6	6	242770	242775	0 %	100 %	0 %	0 %	384421770
4058	NC_017268	AAG	2	6	242881	242886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421770
4059	NC_017268	GTT	2	6	242915	242920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421770
4060	NC_017268	TC	3	6	242965	242970	0 %	50 %	0 %	50 %	384421770
4061	NC_017268	CGG	2	6	243225	243230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421771
4062	NC_017268	GCG	2	6	243265	243270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421771
4063	NC_017268	TGC	2	6	243354	243359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421771
4064	NC_017268	AG	3	6	243362	243367	50 %	0 %	50 %	0 %	384421771
4065	NC_017268	AGG	2	6	243577	243582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421772
4066	NC_017268	GTG	2	6	243583	243588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421772
4067	NC_017268	GC	3	6	243595	243600	0 %	0 %	50 %	50 %	384421772
4068	NC_017268	TCT	3	9	243701	243709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421772
4069	NC_017268	CA	3	6	243745	243750	50 %	0 %	0 %	50 %	384421773
4070	NC_017268	AACG	2	8	243816	243823	50 %	0 %	25 %	25 %	384421773
4071	NC_017268	AAG	2	6	243877	243882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421773
4072	NC_017268	GGT	2	6	243885	243890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421773
4073	NC_017268	TTG	2	6	243916	243921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421773
4074	NC_017268	GGA	2	6	243950	243955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421773
4075	NC_017268	GT	3	6	243958	243963	0 %	50 %	50 %	0 %	384421773
4076	NC_017268	T	6	6	243996	244001	0 %	100 %	0 %	0 %	384421773
4077	NC_017268	TTC	2	6	244005	244010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421773
4078	NC_017268	CTC	2	6	244094	244099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421773
4079	NC_017268	T	6	6	244113	244118	0 %	100 %	0 %	0 %	384421773
4080	NC_017268	ACA	2	6	244125	244130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421773
4081	NC_017268	GGA	2	6	244176	244181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421773
4082	NC_017268	TGA	2	6	244184	244189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421773
4083	NC_017268	CAA	2	6	244197	244202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421773
4084	NC_017268	GAA	3	9	244393	244401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421774
4085	NC_017268	CGC	2	6	244452	244457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421774
4086	NC_017268	GCA	2	6	244507	244512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421774
4087	NC_017268	TGG	2	6	244548	244553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421774
4088	NC_017268	CGC	2	6	244608	244613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421774
4089	NC_017268	TTA	2	6	244626	244631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421774
4090	NC_017268	CGA	2	6	244659	244664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421774
4091	NC_017268	GC	3	6	244685	244690	0 %	0 %	50 %	50 %	384421774
4092	NC_017268	TGC	2	6	244759	244764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421774
4093	NC_017268	ATC	2	6	244772	244777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421774
4094	NC_017268	GCA	2	6	244791	244796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421774
4095	NC_017268	GAA	2	6	244833	244838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421775
4096	NC_017268	AAG	2	6	244969	244974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421775
4097	NC_017268	T	6	6	245039	245044	0 %	100 %	0 %	0 %	384421775
4098	NC_017268	TGC	2	6	245073	245078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421775
4099	NC_017268	TGC	2	6	245082	245087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421775
4100	NC_017268	AGG	2	6	245124	245129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421775
4101	NC_017268	ATG	2	6	245167	245172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421775
4102	NC_017268	GTCG	2	8	245179	245186	0 %	25 %	50 %	25 %	384421775
4103	NC_017268	GCT	2	6	245260	245265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421775
4104	NC_017268	CG	3	6	245299	245304	0 %	0 %	50 %	50 %	384421775
4105	NC_017268	ACG	2	6	245341	245346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421775
4106	NC_017268	AAG	2	6	245404	245409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421775
4107	NC_017268	AGT	2	6	245498	245503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421775
4108	NC_017268	GCT	2	6	245543	245548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421776
4109	NC_017268	CTT	3	9	245580	245588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421776
4110	NC_017268	AGC	2	6	245622	245627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421776
4111	NC_017268	CG	3	6	245642	245647	0 %	0 %	50 %	50 %	384421776
4112	NC_017268	CGTG	2	8	245661	245668	0 %	25 %	50 %	25 %	384421776
4113	NC_017268	GTG	2	6	245675	245680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421776
4114	NC_017268	TGG	2	6	245739	245744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421776
4115	NC_017268	CG	3	6	245791	245796	0 %	0 %	50 %	50 %	384421776
4116	NC_017268	TGCC	2	8	245823	245830	0 %	25 %	25 %	50 %	384421776
4117	NC_017268	GTG	2	6	245834	245839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421776
4118	NC_017268	GAAA	2	8	245907	245914	75 %	0 %	25 %	0 %	384421776
4119	NC_017268	ACG	2	6	245951	245956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421776
4120	NC_017268	GTG	2	6	246020	246025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421776
4121	NC_017268	ATA	2	6	246150	246155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421777
4122	NC_017268	GGC	2	6	246157	246162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421777
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4350	NC_017268	GAT	2	6	258125	258130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421783
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4354	NC_017268	GAA	2	6	258298	258303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421783
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4358	NC_017268	GTG	2	6	258398	258403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421783
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4364	NC_017268	AGTGT	2	10	258746	258755	20 %	40 %	40 %	0 %	384421783
4365	NC_017268	CT	3	6	258770	258775	0 %	50 %	0 %	50 %	384421783
4366	NC_017268	ACA	2	6	258872	258877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421783
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4492	NC_017268	GCG	2	6	265477	265482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421789
4493	NC_017268	CTT	2	6	265483	265488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421789
4494	NC_017268	CCG	2	6	265513	265518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421789
4495	NC_017268	CTT	2	6	265602	265607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421789
4496	NC_017268	GC	3	6	265621	265626	0 %	0 %	50 %	50 %	384421789
4497	NC_017268	GTG	2	6	265739	265744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421789
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4499	NC_017268	GTGC	2	8	265855	265862	0 %	25 %	50 %	25 %	384421789
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