MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_017268	GCA	2	6	1131532	1131537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422528
20503	NC_017268	GAGC	2	8	1131552	1131559	25 %	0 %	50 %	25 %	384422528
20504	NC_017268	AAT	2	6	1131687	1131692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422528
20505	NC_017268	GC	3	6	1131750	1131755	0 %	0 %	50 %	50 %	384422528
20506	NC_017268	ATC	2	6	1131756	1131761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422528
20507	NC_017268	GTA	2	6	1131808	1131813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422528
20508	NC_017268	ATG	2	6	1131817	1131822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422528
20509	NC_017268	CTT	3	9	1131872	1131880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422528
20510	NC_017268	ATA	2	6	1131909	1131914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422528
20511	NC_017268	GC	3	6	1131917	1131922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422528
20512	NC_017268	TGA	2	6	1131934	1131939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422528
20513	NC_017268	AACG	2	8	1132032	1132039	50 %	0 %	25 %	25 %	384422528
20514	NC_017268	CTG	2	6	1132158	1132163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422528
20515	NC_017268	CG	3	6	1132184	1132189	0 %	0 %	50 %	50 %	384422528
20516	NC_017268	CCTT	2	8	1132210	1132217	0 %	50 %	0 %	50 %	384422528
20517	NC_017268	TGC	2	6	1132240	1132245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422528
20518	NC_017268	TCTG	2	8	1132421	1132428	0 %	50 %	25 %	25 %	384422528
20519	NC_017268	CG	3	6	1132469	1132474	0 %	0 %	50 %	50 %	384422528
20520	NC_017268	TGCC	2	8	1132488	1132495	0 %	25 %	25 %	50 %	384422528
20521	NC_017268	GCT	2	6	1132496	1132501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422528
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20525	NC_017268	T	6	6	1132632	1132637	0 %	100 %	0 %	0 %	384422528
20526	NC_017268	TGT	2	6	1132750	1132755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422529
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20531	NC_017268	CAT	2	6	1132909	1132914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422529
20532	NC_017268	ACCGC	2	10	1132970	1132979	20 %	0 %	20 %	60 %	384422529
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20537	NC_017268	TC	4	8	1133265	1133272	0 %	50 %	0 %	50 %	384422529
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20539	NC_017268	CG	3	6	1133526	1133531	0 %	0 %	50 %	50 %	384422529
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20555	NC_017268	CA	3	6	1134441	1134446	50 %	0 %	0 %	50 %	384422529
20556	NC_017268	TC	4	8	1134469	1134476	0 %	50 %	0 %	50 %	384422529
20557	NC_017268	CA	3	6	1134480	1134485	50 %	0 %	0 %	50 %	384422529
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20591	NC_017268	AAC	2	6	1136341	1136346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422532
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20599	NC_017268	T	7	7	1136708	1136714	0 %	100 %	0 %	0 %	384422532
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20602	NC_017268	GATT	2	8	1136910	1136917	25 %	50 %	25 %	0 %	384422533
20603	NC_017268	A	6	6	1136923	1136928	100 %	0 %	0 %	0 %	384422533
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20608	NC_017268	GAC	2	6	1137232	1137237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422533
20609	NC_017268	GC	3	6	1137268	1137273	0 %	0 %	50 %	50 %	384422533
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