MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017268	GGA	2	6	88498	88503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421632
1502	NC_017268	T	6	6	88511	88516	0 %	100 %	0 %	0 %	384421632
1503	NC_017268	AGT	2	6	88520	88525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421632
1504	NC_017268	GT	3	6	88606	88611	0 %	50 %	50 %	0 %	384421632
1505	NC_017268	AAG	2	6	88682	88687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421632
1506	NC_017268	GTG	2	6	88703	88708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421632
1507	NC_017268	CTG	2	6	88779	88784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421632
1508	NC_017268	GCAC	2	8	88839	88846	25 %	0 %	25 %	50 %	384421632
1509	NC_017268	TAT	2	6	88861	88866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421632
1510	NC_017268	GTTT	2	8	88918	88925	0 %	75 %	25 %	0 %	384421632
1511	NC_017268	GTACC	2	10	88960	88969	20 %	20 %	20 %	40 %	384421632
1512	NC_017268	GC	3	6	89030	89035	0 %	0 %	50 %	50 %	384421632
1513	NC_017268	ATC	2	6	89051	89056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421632
1514	NC_017268	ATCC	2	8	89058	89065	25 %	25 %	0 %	50 %	384421632
1515	NC_017268	CTC	2	6	89070	89075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421632
1516	NC_017268	TGC	3	9	89104	89112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421632
1517	NC_017268	CTG	2	6	89148	89153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421632
1518	NC_017268	TAC	2	6	89156	89161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421632
1519	NC_017268	GCA	2	6	89162	89167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421632
1520	NC_017268	TTG	2	6	89217	89222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421632
1521	NC_017268	T	6	6	89232	89237	0 %	100 %	0 %	0 %	384421632
1522	NC_017268	CTTC	2	8	89365	89372	0 %	50 %	0 %	50 %	384421633
1523	NC_017268	GA	3	6	89396	89401	50 %	0 %	50 %	0 %	384421633
1524	NC_017268	T	6	6	89458	89463	0 %	100 %	0 %	0 %	384421633
1525	NC_017268	T	7	7	89496	89502	0 %	100 %	0 %	0 %	384421633
1526	NC_017268	TTG	2	6	89528	89533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421633
1527	NC_017268	GCA	2	6	89544	89549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421633
1528	NC_017268	AG	3	6	89598	89603	50 %	0 %	50 %	0 %	384421633
1529	NC_017268	TTA	2	6	89605	89610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421633
1530	NC_017268	GAA	2	6	89632	89637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421633
1531	NC_017268	TTAT	2	8	89777	89784	25 %	75 %	0 %	0 %	384421634
1532	NC_017268	TG	3	6	89807	89812	0 %	50 %	50 %	0 %	384421634
1533	NC_017268	TAC	2	6	89816	89821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421634
1534	NC_017268	GTT	2	6	89911	89916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421634
1535	NC_017268	TGG	2	6	89973	89978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421634
1536	NC_017268	GCAA	2	8	89991	89998	50 %	0 %	25 %	25 %	384421634
1537	NC_017268	GAA	2	6	90011	90016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421634
1538	NC_017268	A	6	6	90015	90020	100 %	0 %	0 %	0 %	384421634
1539	NC_017268	CGCA	2	8	90050	90057	25 %	0 %	25 %	50 %	384421634
1540	NC_017268	G	6	6	90091	90096	0 %	0 %	100 %	0 %	384421634
1541	NC_017268	CTA	2	6	90294	90299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421634
1542	NC_017268	ATT	2	6	90321	90326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384421634
1543	NC_017268	CAG	3	9	90358	90366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421634
1544	NC_017268	T	7	7	90397	90403	0 %	100 %	0 %	0 %	384421634
1545	NC_017268	GTA	2	6	90409	90414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421634
1546	NC_017268	AG	3	6	90502	90507	50 %	0 %	50 %	0 %	384421634
1547	NC_017268	CTT	2	6	90552	90557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421634
1548	NC_017268	CTG	2	6	90562	90567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421634
1549	NC_017268	AGA	2	6	92241	92246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421635
1550	NC_017268	CGTGT	2	10	92288	92297	0 %	40 %	40 %	20 %	384421635
1551	NC_017268	GGTAT	2	10	92302	92311	20 %	40 %	40 %	0 %	384421635
1552	NC_017268	T	6	6	92338	92343	0 %	100 %	0 %	0 %	384421635
1553	NC_017268	GAA	2	6	94458	94463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421636
1554	NC_017268	GCT	2	6	94503	94508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421636
1555	NC_017268	AAC	2	6	94524	94529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421636
1556	NC_017268	T	7	7	94600	94606	0 %	100 %	0 %	0 %	384421636
1557	NC_017268	GC	4	8	94641	94648	0 %	0 %	50 %	50 %	384421636
1558	NC_017268	TAA	2	6	94816	94821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384421637
1559	NC_017268	TTG	2	6	94834	94839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421637
1560	NC_017268	ACT	2	6	95021	95026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421637
1561	NC_017268	TCGA	2	8	95093	95100	25 %	25 %	25 %	25 %	384421637
1562	NC_017268	CA	3	6	95102	95107	50 %	0 %	0 %	50 %	384421637
1563	NC_017268	GCA	2	6	95115	95120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421637
1564	NC_017268	TCG	2	6	95166	95171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421637
1565	NC_017268	TCC	2	6	95178	95183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421637
1566	NC_017268	ATTC	2	8	95240	95247	25 %	50 %	0 %	25 %	384421637
1567	NC_017268	CCA	2	6	95372	95377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421638
1568	NC_017268	AGC	2	6	95381	95386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421638
1569	NC_017268	TAC	2	6	95395	95400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384421638
1570	NC_017268	GTGC	2	8	95475	95482	0 %	25 %	50 %	25 %	384421638
1571	NC_017268	TGG	2	6	95528	95533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421638
1572	NC_017268	CAG	2	6	95550	95555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421638
1573	NC_017268	AGT	2	6	95560	95565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421638
1574	NC_017268	TCTT	2	8	95614	95621	0 %	75 %	0 %	25 %	384421638
1575	NC_017268	CTT	2	6	95649	95654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421638
1576	NC_017268	GTG	2	6	95707	95712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421638
1577	NC_017268	TTG	2	6	95771	95776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421638
1578	NC_017268	AAG	2	6	95794	95799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384421638
1579	NC_017268	TGA	2	6	95852	95857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421638
1580	NC_017268	TTCA	2	8	95875	95882	25 %	50 %	0 %	25 %	384421638
1581	NC_017268	CGC	2	6	95893	95898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421638
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1583	NC_017268	ATG	2	6	95941	95946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421638
1584	NC_017268	GAG	2	6	95998	96003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421638
1585	NC_017268	GTG	2	6	96034	96039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421638
1586	NC_017268	TGG	2	6	96071	96076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421638
1587	NC_017268	CGTAT	2	10	96116	96125	20 %	40 %	20 %	20 %	384421638
1588	NC_017268	GCG	2	6	96190	96195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421638
1589	NC_017268	GTC	2	6	96216	96221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421638
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1591	NC_017268	GC	3	6	96327	96332	0 %	0 %	50 %	50 %	384421639
1592	NC_017268	AGT	2	6	96364	96369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421639
1593	NC_017268	CGTAC	2	10	96407	96416	20 %	20 %	20 %	40 %	384421639
1594	NC_017268	TGC	2	6	96425	96430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421639
1595	NC_017268	TG	4	8	96437	96444	0 %	50 %	50 %	0 %	384421639
1596	NC_017268	TCT	2	6	96460	96465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421639
1597	NC_017268	GA	4	8	96501	96508	50 %	0 %	50 %	0 %	384421639
1598	NC_017268	GT	3	6	96545	96550	0 %	50 %	50 %	0 %	384421639
1599	NC_017268	CCCGT	2	10	96574	96583	0 %	20 %	20 %	60 %	384421639
1600	NC_017268	CGC	2	6	96613	96618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421639
1601	NC_017268	CTT	2	6	96623	96628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421639
1602	NC_017268	ACC	2	6	96649	96654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384421639
1603	NC_017268	CCT	2	6	96667	96672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384421639
1604	NC_017268	CA	3	6	96720	96725	50 %	0 %	0 %	50 %	384421639
1605	NC_017268	GCA	2	6	96757	96762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421639
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1607	NC_017268	T	6	6	96985	96990	0 %	100 %	0 %	0 %	384421640
1608	NC_017268	AGT	2	6	97011	97016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421640
1609	NC_017268	TCAA	2	8	97115	97122	50 %	25 %	0 %	25 %	384421640
1610	NC_017268	CGC	2	6	97161	97166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384421640
1611	NC_017268	GC	3	6	97233	97238	0 %	0 %	50 %	50 %	384421640
1612	NC_017268	CGG	2	6	97245	97250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384421640
1613	NC_017268	AGGGGA	2	12	97327	97338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384421640
1614	NC_017268	ATAA	2	8	97344	97351	75 %	25 %	0 %	0 %	384421640
1615	NC_017268	TGT	2	6	97448	97453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384421641
1616	NC_017268	GTC	2	6	97524	97529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421641
1617	NC_017268	GA	3	6	97595	97600	50 %	0 %	50 %	0 %	384421641
1618	NC_017268	TG	3	6	97625	97630	0 %	50 %	50 %	0 %	384421641
1619	NC_017268	T	6	6	97724	97729	0 %	100 %	0 %	0 %	384421641
1620	NC_017268	GTG	2	6	97795	97800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384421641
1621	NC_017268	TG	3	6	97825	97830	0 %	50 %	50 %	0 %	384421641
1622	NC_017268	CTT	2	6	97952	97957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384421641
1623	NC_017268	CAA	2	6	97988	97993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384421641
1624	NC_017268	ATG	2	6	98023	98028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421641
1625	NC_017268	AGC	2	6	98081	98086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384421641
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1627	NC_017268	GTA	2	6	98256	98261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384421641
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1744	NC_017268	TC	3	6	103829	103834	0 %	50 %	0 %	50 %	384421647
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1749	NC_017268	GTC	2	6	104080	104085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384421648
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