MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_017268	A	7	7	1024680	1024686	100 %	0 %	0 %	0 %	384422428
18502	NC_017268	CG	3	6	1024700	1024705	0 %	0 %	50 %	50 %	384422428
18503	NC_017268	GCA	2	6	1024717	1024722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18504	NC_017268	CCT	2	6	1024748	1024753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
18505	NC_017268	GGC	2	6	1024790	1024795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422428
18506	NC_017268	TGA	2	6	1024810	1024815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422428
18507	NC_017268	GCA	2	6	1024855	1024860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18508	NC_017268	AGC	2	6	1024918	1024923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18509	NC_017268	AGA	2	6	1024947	1024952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422428
18510	NC_017268	CGT	2	6	1024962	1024967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18511	NC_017268	GCCT	2	8	1024995	1025002	0 %	25 %	25 %	50 %	384422428
18512	NC_017268	GGAG	2	8	1025094	1025101	25 %	0 %	75 %	0 %	384422428
18513	NC_017268	CCAT	2	8	1025164	1025171	25 %	25 %	0 %	50 %	384422428
18514	NC_017268	TTC	2	6	1025182	1025187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
18515	NC_017268	CT	4	8	1025205	1025212	0 %	50 %	0 %	50 %	384422429
18516	NC_017268	TAG	2	6	1025285	1025290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422429
18517	NC_017268	T	7	7	1025335	1025341	0 %	100 %	0 %	0 %	384422429
18518	NC_017268	A	6	6	1025343	1025348	100 %	0 %	0 %	0 %	384422429
18519	NC_017268	CGA	2	6	1025445	1025450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422430
18520	NC_017268	CCG	2	6	1025473	1025478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422430
18521	NC_017268	CG	4	8	1025600	1025607	0 %	0 %	50 %	50 %	384422430
18522	NC_017268	A	6	6	1025713	1025718	100 %	0 %	0 %	0 %	384422430
18523	NC_017268	CG	4	8	1025829	1025836	0 %	0 %	50 %	50 %	384422430
18524	NC_017268	TCC	2	6	1026016	1026021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422431
18525	NC_017268	CGC	2	6	1026048	1026053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422431
18526	NC_017268	GCT	2	6	1026068	1026073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422431
18527	NC_017268	GGA	2	6	1026098	1026103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422431
18528	NC_017268	T	7	7	1026112	1026118	0 %	100 %	0 %	0 %	384422431
18529	NC_017268	CTG	2	6	1026195	1026200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422431
18530	NC_017268	CTT	2	6	1026263	1026268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422431
18531	NC_017268	TGC	3	9	1026325	1026333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422431
18532	NC_017268	ACC	2	6	1026337	1026342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422431
18533	NC_017268	GCT	2	6	1026365	1026370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422431
18534	NC_017268	GCA	2	6	1026374	1026379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422431
18535	NC_017268	GGA	2	6	1026503	1026508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422432
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18537	NC_017268	TCA	2	6	1026579	1026584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422432
18538	NC_017268	GCT	2	6	1026613	1026618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422432
18539	NC_017268	TCT	2	6	1026658	1026663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422432
18540	NC_017268	TCG	2	6	1026810	1026815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422432
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18542	NC_017268	CCG	2	6	1026967	1026972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422433
18543	NC_017268	C	6	6	1027057	1027062	0 %	0 %	0 %	100 %	384422433
18544	NC_017268	CAA	2	6	1027171	1027176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422433
18545	NC_017268	CTCCG	2	10	1027194	1027203	0 %	20 %	20 %	60 %	384422433
18546	NC_017268	CGC	2	6	1027217	1027222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422433
18547	NC_017268	CAC	2	6	1027235	1027240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422433
18548	NC_017268	TCG	2	6	1027299	1027304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422433
18549	NC_017268	AAGC	2	8	1027384	1027391	50 %	0 %	25 %	25 %	384422433
18550	NC_017268	TTAT	2	8	1027395	1027402	25 %	75 %	0 %	0 %	384422433
18551	NC_017268	TGC	2	6	1027412	1027417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422433
18552	NC_017268	CTC	2	6	1027529	1027534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422433
18553	NC_017268	CA	3	6	1027605	1027610	50 %	0 %	0 %	50 %	384422433
18554	NC_017268	CGC	2	6	1027872	1027877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422433
18555	NC_017268	CA	3	6	1027900	1027905	50 %	0 %	0 %	50 %	384422433
18556	NC_017268	CG	4	8	1027935	1027942	0 %	0 %	50 %	50 %	384422433
18557	NC_017268	AGAGA	2	10	1028316	1028325	60 %	0 %	40 %	0 %	384422434
18558	NC_017268	A	8	8	1028340	1028347	100 %	0 %	0 %	0 %	384422434
18559	NC_017268	ATC	2	6	1028498	1028503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422434
18560	NC_017268	GCA	2	6	1028559	1028564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422434
18561	NC_017268	GCA	2	6	1028576	1028581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422434
18562	NC_017268	TGCA	2	8	1028653	1028660	25 %	25 %	25 %	25 %	384422434
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18564	NC_017268	CGCC	2	8	1028694	1028701	0 %	0 %	25 %	75 %	384422434
18565	NC_017268	GCA	2	6	1028787	1028792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422434
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18567	NC_017268	CG	3	6	1029157	1029162	0 %	0 %	50 %	50 %	384422435
18568	NC_017268	GAA	2	6	1029203	1029208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422435
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18570	NC_017268	AC	4	8	1029248	1029255	50 %	0 %	0 %	50 %	384422435
18571	NC_017268	CA	3	6	1029268	1029273	50 %	0 %	0 %	50 %	384422435
18572	NC_017268	CG	4	8	1029316	1029323	0 %	0 %	50 %	50 %	384422435
18573	NC_017268	GCG	2	6	1029421	1029426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422435
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18575	NC_017268	ACC	2	6	1029564	1029569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422435
18576	NC_017268	TA	3	6	1029576	1029581	50 %	50 %	0 %	0 %	384422435
18577	NC_017268	GGC	2	6	1029605	1029610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422435
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18579	NC_017268	TCC	2	6	1029708	1029713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422435
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18583	NC_017268	TGAG	2	8	1029909	1029916	25 %	25 %	50 %	0 %	384422436
18584	NC_017268	TGCA	2	8	1029940	1029947	25 %	25 %	25 %	25 %	384422436
18585	NC_017268	TCCA	2	8	1029991	1029998	25 %	25 %	0 %	50 %	384422436
18586	NC_017268	TAA	2	6	1030020	1030025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422436
18587	NC_017268	A	6	6	1030024	1030029	100 %	0 %	0 %	0 %	384422436
18588	NC_017268	CGTT	2	8	1030038	1030045	0 %	50 %	25 %	25 %	384422436
18589	NC_017268	ACA	2	6	1030068	1030073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422436
18590	NC_017268	TGTCG	2	10	1030083	1030092	0 %	40 %	40 %	20 %	384422436
18591	NC_017268	C	6	6	1030160	1030165	0 %	0 %	0 %	100 %	384422436
18592	NC_017268	GAC	2	6	1030218	1030223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422436
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18594	NC_017268	GCG	2	6	1030278	1030283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422436
18595	NC_017268	A	8	8	1030291	1030298	100 %	0 %	0 %	0 %	384422436
18596	NC_017268	GA	3	6	1030301	1030306	50 %	0 %	50 %	0 %	384422436
18597	NC_017268	AT	3	6	1030339	1030344	50 %	50 %	0 %	0 %	384422436
18598	NC_017268	T	6	6	1030380	1030385	0 %	100 %	0 %	0 %	384422436
18599	NC_017268	AAC	2	6	1030418	1030423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422436
18600	NC_017268	CA	3	6	1030432	1030437	50 %	0 %	0 %	50 %	384422436
18601	NC_017268	AC	3	6	1030479	1030484	50 %	0 %	0 %	50 %	384422436
18602	NC_017268	TTC	2	6	1030656	1030661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422437
18603	NC_017268	A	6	6	1030725	1030730	100 %	0 %	0 %	0 %	384422437
18604	NC_017268	TTC	2	6	1030762	1030767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422437
18605	NC_017268	CTT	2	6	1030770	1030775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422437
18606	NC_017268	ACC	3	9	1030813	1030821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422437
18607	NC_017268	A	6	6	1030888	1030893	100 %	0 %	0 %	0 %	384422437
18608	NC_017268	CTG	2	6	1030923	1030928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422437
18609	NC_017268	CTCA	2	8	1030929	1030936	25 %	25 %	0 %	50 %	384422437
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18612	NC_017268	AG	3	6	1031035	1031040	50 %	0 %	50 %	0 %	384422437
18613	NC_017268	TCA	2	6	1031198	1031203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422438
18614	NC_017268	CTG	2	6	1031208	1031213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422438
18615	NC_017268	AGA	2	6	1031251	1031256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422438
18616	NC_017268	CAT	2	6	1031267	1031272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422438
18617	NC_017268	AAAAGA	3	18	1031273	1031290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384422438
18618	NC_017268	T	6	6	1031327	1031332	0 %	100 %	0 %	0 %	384422438
18619	NC_017268	GCT	2	6	1031333	1031338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422438
18620	NC_017268	TG	3	6	1031340	1031345	0 %	50 %	50 %	0 %	384422438
18621	NC_017268	GA	3	6	1031378	1031383	50 %	0 %	50 %	0 %	384422438
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