MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

< Previous12...30313233343536373839404142Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017268	TTGA	2	8	995842	995849	25 %	50 %	25 %	0 %	384422408
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18004	NC_017268	AC	3	6	995880	995885	50 %	0 %	0 %	50 %	384422408
18005	NC_017268	ATG	2	6	995888	995893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422408
18006	NC_017268	AAG	2	6	995897	995902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422408
18007	NC_017268	CGG	2	6	995909	995914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422408
18008	NC_017268	A	6	6	995920	995925	100 %	0 %	0 %	0 %	384422408
18009	NC_017268	TGG	2	6	995948	995953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422408
18010	NC_017268	CAT	2	6	995994	995999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422408
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18014	NC_017268	ACT	2	6	996120	996125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422408
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18017	NC_017268	CAGT	2	8	996246	996253	25 %	25 %	25 %	25 %	384422408
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18053	NC_017268	GC	3	6	998242	998247	0 %	0 %	50 %	50 %	384422412
18054	NC_017268	AGGCG	2	10	998277	998286	20 %	0 %	60 %	20 %	384422412
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18056	NC_017268	CGAG	2	8	998406	998413	25 %	0 %	50 %	25 %	384422412
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18064	NC_017268	GC	3	6	998813	998818	0 %	0 %	50 %	50 %	384422412
18065	NC_017268	A	6	6	998881	998886	100 %	0 %	0 %	0 %	384422412
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18093	NC_017268	TA	3	6	999835	999840	50 %	50 %	0 %	0 %	384422412
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18107	NC_017268	A	6	6	1000763	1000768	100 %	0 %	0 %	0 %	384422413
18108	NC_017268	TTA	2	6	1000822	1000827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422413
18109	NC_017268	A	6	6	1000926	1000931	100 %	0 %	0 %	0 %	384422413
18110	NC_017268	AGC	2	6	1000936	1000941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422413
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18112	NC_017268	A	7	7	1001017	1001023	100 %	0 %	0 %	0 %	384422413
18113	NC_017268	CGATG	2	10	1001036	1001045	20 %	20 %	40 %	20 %	384422413
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18122	NC_017268	GC	3	6	1001537	1001542	0 %	0 %	50 %	50 %	384422413
18123	NC_017268	CG	3	6	1001543	1001548	0 %	0 %	50 %	50 %	384422413
18124	NC_017268	A	7	7	1001649	1001655	100 %	0 %	0 %	0 %	384422413
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18136	NC_017268	GCG	2	6	1002212	1002217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422414
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18233	NC_017268	CGT	2	6	1010468	1010473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422418
18234	NC_017268	CTC	2	6	1010570	1010575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422418
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18239	NC_017268	GCA	2	6	1010853	1010858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422418
18240	NC_017268	CA	3	6	1010878	1010883	50 %	0 %	0 %	50 %	384422418
18241	NC_017268	GAG	2	6	1010922	1010927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422418
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18245	NC_017268	GTA	2	6	1011174	1011179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422418
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18475	NC_017268	AGCG	2	8	1023345	1023352	25 %	0 %	50 %	25 %	384422428
18476	NC_017268	GTG	2	6	1023364	1023369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422428
18477	NC_017268	A	6	6	1023475	1023480	100 %	0 %	0 %	0 %	384422428
18478	NC_017268	CAC	2	6	1023492	1023497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
18479	NC_017268	CCT	2	6	1023563	1023568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
18480	NC_017268	TCT	2	6	1023752	1023757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
18481	NC_017268	ACC	2	6	1023789	1023794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
18482	NC_017268	CTT	2	6	1023798	1023803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
18483	NC_017268	TTA	2	6	1023832	1023837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422428
18484	NC_017268	AAT	2	6	1023852	1023857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422428
18485	NC_017268	AC	3	6	1023921	1023926	50 %	0 %	0 %	50 %	384422428
18486	NC_017268	ATC	2	6	1023933	1023938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
18487	NC_017268	GCT	2	6	1023966	1023971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18488	NC_017268	CAT	2	6	1023980	1023985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422428
18489	NC_017268	ACCG	2	8	1023993	1024000	25 %	0 %	25 %	50 %	384422428
18490	NC_017268	TCT	2	6	1024013	1024018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
18491	NC_017268	ACC	2	6	1024089	1024094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422428
18492	NC_017268	CTT	2	6	1024125	1024130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428
18493	NC_017268	AG	3	6	1024172	1024177	50 %	0 %	50 %	0 %	384422428
18494	NC_017268	TCGA	2	8	1024206	1024213	25 %	25 %	25 %	25 %	384422428
18495	NC_017268	TCC	2	6	1024308	1024313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422428
18496	NC_017268	GTA	2	6	1024401	1024406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422428
18497	NC_017268	CTGTG	2	10	1024533	1024542	0 %	40 %	40 %	20 %	384422428
18498	NC_017268	AGTC	2	8	1024566	1024573	25 %	25 %	25 %	25 %	384422428
18499	NC_017268	TCG	3	9	1024600	1024608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422428
18500	NC_017268	CTT	2	6	1024637	1024642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422428

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