MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_017268	CCCA	2	8	971248	971255	25 %	0 %	0 %	75 %	384422384
17503	NC_017268	TCC	2	6	971297	971302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422384
17504	NC_017268	TCC	2	6	971420	971425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422384
17505	NC_017268	AC	3	6	971520	971525	50 %	0 %	0 %	50 %	384422384
17506	NC_017268	GCA	2	6	971531	971536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422384
17507	NC_017268	CTTT	2	8	971553	971560	0 %	75 %	0 %	25 %	384422384
17508	NC_017268	GC	3	6	971561	971566	0 %	0 %	50 %	50 %	384422384
17509	NC_017268	TCT	2	6	971577	971582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422384
17510	NC_017268	TTA	2	6	971583	971588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422384
17511	NC_017268	ACTC	2	8	971788	971795	25 %	25 %	0 %	50 %	384422385
17512	NC_017268	AGT	2	6	971801	971806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422385
17513	NC_017268	TCA	2	6	971847	971852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422385
17514	NC_017268	CCA	2	6	971853	971858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422385
17515	NC_017268	CCT	2	6	971884	971889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422385
17516	NC_017268	CTC	2	6	971894	971899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422385
17517	NC_017268	GGC	2	6	971924	971929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422385
17518	NC_017268	GAA	2	6	972069	972074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422385
17519	NC_017268	CTT	2	6	972085	972090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422385
17520	NC_017268	ACG	2	6	972122	972127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422385
17521	NC_017268	CATC	2	8	972142	972149	25 %	25 %	0 %	50 %	384422385
17522	NC_017268	CT	3	6	972162	972167	0 %	50 %	0 %	50 %	384422385
17523	NC_017268	CAA	2	6	972259	972264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422385
17524	NC_017268	TCA	2	6	972288	972293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422385
17525	NC_017268	ACG	2	6	972300	972305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422385
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17528	NC_017268	ATCT	2	8	972374	972381	25 %	50 %	0 %	25 %	384422385
17529	NC_017268	TAA	2	6	972400	972405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422385
17530	NC_017268	CAT	2	6	972457	972462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422385
17531	NC_017268	CAA	2	6	972526	972531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422385
17532	NC_017268	CGT	2	6	972535	972540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422385
17533	NC_017268	AGC	2	6	972564	972569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422385
17534	NC_017268	ATC	2	6	972680	972685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422385
17535	NC_017268	CG	4	8	972756	972763	0 %	0 %	50 %	50 %	384422385
17536	NC_017268	GTA	2	6	972767	972772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422385
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17538	NC_017268	CTT	2	6	972790	972795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422385
17539	NC_017268	GCTCA	2	10	972839	972848	20 %	20 %	20 %	40 %	384422385
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17542	NC_017268	GC	3	6	973010	973015	0 %	0 %	50 %	50 %	384422385
17543	NC_017268	AC	3	6	973022	973027	50 %	0 %	0 %	50 %	384422385
17544	NC_017268	CTC	2	6	973031	973036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422385
17545	NC_017268	ACG	2	6	973047	973052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422385
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17550	NC_017268	CG	4	8	973517	973524	0 %	0 %	50 %	50 %	384422386
17551	NC_017268	CTG	2	6	973584	973589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422386
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17553	NC_017268	CAC	2	6	973898	973903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422387
17554	NC_017268	GC	3	6	973917	973922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422387
17555	NC_017268	TCA	2	6	973935	973940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422387
17556	NC_017268	AGGCA	2	10	973997	974006	40 %	0 %	40 %	20 %	384422387
17557	NC_017268	CAC	2	6	974140	974145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422387
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17559	NC_017268	AAT	2	6	974161	974166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422387
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17561	NC_017268	CCA	2	6	974218	974223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422387
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17565	NC_017268	TAA	2	6	974598	974603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422387
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17568	NC_017268	CTG	2	6	974714	974719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422387
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17585	NC_017268	CCACG	2	10	977573	977582	20 %	0 %	20 %	60 %	384422391
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17591	NC_017268	TCA	2	6	977809	977814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422391
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17594	NC_017268	TGCA	2	8	977868	977875	25 %	25 %	25 %	25 %	384422391
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17601	NC_017268	CG	3	6	978078	978083	0 %	0 %	50 %	50 %	384422391
17602	NC_017268	GC	3	6	978094	978099	0 %	0 %	50 %	50 %	384422391
17603	NC_017268	CG	3	6	978191	978196	0 %	0 %	50 %	50 %	384422391
17604	NC_017268	CA	5	10	978231	978240	50 %	0 %	0 %	50 %	384422391
17605	NC_017268	CG	3	6	978297	978302	0 %	0 %	50 %	50 %	384422391
17606	NC_017268	CAGCTC	2	12	978315	978326	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384422391
17607	NC_017268	CAGA	2	8	978344	978351	50 %	0 %	25 %	25 %	384422391
17608	NC_017268	CGC	2	6	978406	978411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422391
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17611	NC_017268	TCG	2	6	978524	978529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422391
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17613	NC_017268	CG	3	6	978554	978559	0 %	0 %	50 %	50 %	384422391
17614	NC_017268	A	6	6	978561	978566	100 %	0 %	0 %	0 %	384422391
17615	NC_017268	AC	3	6	978583	978588	50 %	0 %	0 %	50 %	384422391
17616	NC_017268	CGC	2	6	978591	978596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422391
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