MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017268	ATC	2	6	922406	922411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422343
16502	NC_017268	TG	3	6	922417	922422	0 %	50 %	50 %	0 %	384422343
16503	NC_017268	CAAA	2	8	922452	922459	75 %	0 %	0 %	25 %	384422343
16504	NC_017268	A	6	6	922462	922467	100 %	0 %	0 %	0 %	384422343
16505	NC_017268	TC	3	6	922484	922489	0 %	50 %	0 %	50 %	384422343
16506	NC_017268	GT	3	6	922554	922559	0 %	50 %	50 %	0 %	384422343
16507	NC_017268	AAC	2	6	922704	922709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422343
16508	NC_017268	CAA	2	6	922714	922719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422343
16509	NC_017268	GCA	2	6	922733	922738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422343
16510	NC_017268	GTCA	2	8	922749	922756	25 %	25 %	25 %	25 %	384422343
16511	NC_017268	TGC	2	6	922762	922767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422343
16512	NC_017268	CCA	2	6	922773	922778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422343
16513	NC_017268	ATT	2	6	922817	922822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422343
16514	NC_017268	CTT	2	6	922881	922886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422343
16515	NC_017268	CAA	2	6	922954	922959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422343
16516	NC_017268	TAC	2	6	922994	922999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422343
16517	NC_017268	ACA	2	6	923007	923012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422343
16518	NC_017268	A	8	8	923034	923041	100 %	0 %	0 %	0 %	384422343
16519	NC_017268	GC	3	6	923158	923163	0 %	0 %	50 %	50 %	384422343
16520	NC_017268	GC	3	6	923184	923189	0 %	0 %	50 %	50 %	384422343
16521	NC_017268	CCA	2	6	923220	923225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422343
16522	NC_017268	TCTT	2	8	923357	923364	0 %	75 %	0 %	25 %	384422343
16523	NC_017268	ACA	2	6	923372	923377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422343
16524	NC_017268	CA	4	8	923419	923426	50 %	0 %	0 %	50 %	384422343
16525	NC_017268	GGA	2	6	923441	923446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422343
16526	NC_017268	CAC	2	6	923516	923521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422343
16527	NC_017268	ACG	2	6	923535	923540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422343
16528	NC_017268	TGC	2	6	923545	923550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422343
16529	NC_017268	AGA	3	9	923776	923784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422343
16530	NC_017268	GAC	2	6	923797	923802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422343
16531	NC_017268	GAA	3	9	923804	923812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422343
16532	NC_017268	TTTTCA	2	12	923889	923900	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384422344
16533	NC_017268	CCCA	2	8	923955	923962	25 %	0 %	0 %	75 %	384422344
16534	NC_017268	AC	3	6	923983	923988	50 %	0 %	0 %	50 %	384422344
16535	NC_017268	A	7	7	924102	924108	100 %	0 %	0 %	0 %	384422344
16536	NC_017268	CAC	2	6	924126	924131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422344
16537	NC_017268	AC	3	6	924138	924143	50 %	0 %	0 %	50 %	384422344
16538	NC_017268	CAC	2	6	924178	924183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422344
16539	NC_017268	A	7	7	924210	924216	100 %	0 %	0 %	0 %	384422344
16540	NC_017268	CTT	2	6	924266	924271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422344
16541	NC_017268	TTC	2	6	924419	924424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422344
16542	NC_017268	C	6	6	924511	924516	0 %	0 %	0 %	100 %	384422344
16543	NC_017268	GC	3	6	924521	924526	0 %	0 %	50 %	50 %	384422344
16544	NC_017268	A	6	6	924596	924601	100 %	0 %	0 %	0 %	384422344
16545	NC_017268	TGG	2	6	924647	924652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422344
16546	NC_017268	A	6	6	924653	924658	100 %	0 %	0 %	0 %	384422344
16547	NC_017268	A	7	7	924696	924702	100 %	0 %	0 %	0 %	384422344
16548	NC_017268	GCTC	2	8	924728	924735	0 %	25 %	25 %	50 %	384422344
16549	NC_017268	CGC	2	6	924763	924768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422344
16550	NC_017268	ATT	2	6	924853	924858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422344
16551	NC_017268	ACG	2	6	924872	924877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422344
16552	NC_017268	TTAT	2	8	925066	925073	25 %	75 %	0 %	0 %	384422345
16553	NC_017268	GGA	2	6	925082	925087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422345
16554	NC_017268	CTG	2	6	925122	925127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422345
16555	NC_017268	CA	4	8	925155	925162	50 %	0 %	0 %	50 %	384422345
16556	NC_017268	CTTCTG	3	18	925217	925234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384422345
16557	NC_017268	CCA	2	6	925253	925258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422345
16558	NC_017268	CCT	2	6	925286	925291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422345
16559	NC_017268	ACA	2	6	925363	925368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422345
16560	NC_017268	CTG	2	6	925398	925403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422345
16561	NC_017268	GCG	2	6	925464	925469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422345
16562	NC_017268	CCG	2	6	925625	925630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422345
16563	NC_017268	A	7	7	925654	925660	100 %	0 %	0 %	0 %	384422345
16564	NC_017268	ACA	2	6	925694	925699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422345
16565	NC_017268	T	6	6	925714	925719	0 %	100 %	0 %	0 %	384422345
16566	NC_017268	GAA	2	6	925780	925785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422345
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16568	NC_017268	TGCC	2	8	925817	925824	0 %	25 %	25 %	50 %	384422345
16569	NC_017268	CAC	2	6	925836	925841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422345
16570	NC_017268	CGC	2	6	925882	925887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422345
16571	NC_017268	GCA	2	6	925903	925908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422345
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16573	NC_017268	CTA	3	9	926078	926086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422345
16574	NC_017268	CTT	2	6	926088	926093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422345
16575	NC_017268	GCAA	2	8	926128	926135	50 %	0 %	25 %	25 %	384422345
16576	NC_017268	TCTT	2	8	926243	926250	0 %	75 %	0 %	25 %	384422346
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16579	NC_017268	GC	3	6	926340	926345	0 %	0 %	50 %	50 %	384422346
16580	NC_017268	T	6	6	926394	926399	0 %	100 %	0 %	0 %	384422346
16581	NC_017268	GGTT	2	8	926420	926427	0 %	50 %	50 %	0 %	384422346
16582	NC_017268	TGC	2	6	926600	926605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422346
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16585	NC_017268	ATCA	2	8	926817	926824	50 %	25 %	0 %	25 %	384422346
16586	NC_017268	GCA	2	6	926845	926850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422346
16587	NC_017268	TGC	2	6	926887	926892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422346
16588	NC_017268	ATTAT	2	10	926908	926917	40 %	60 %	0 %	0 %	384422346
16589	NC_017268	CG	3	6	926999	927004	0 %	0 %	50 %	50 %	384422346
16590	NC_017268	GA	3	6	927026	927031	50 %	0 %	50 %	0 %	384422346
16591	NC_017268	AAG	2	6	927079	927084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422346
16592	NC_017268	ATG	2	6	927157	927162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422346
16593	NC_017268	ATC	2	6	927174	927179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422346
16594	NC_017268	AGT	2	6	927197	927202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422346
16595	NC_017268	GC	3	6	927218	927223	0 %	0 %	50 %	50 %	384422346
16596	NC_017268	ATC	2	6	927252	927257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422346
16597	NC_017268	TTTCC	2	10	927326	927335	0 %	60 %	0 %	40 %	384422346
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16601	NC_017268	TTC	2	6	927456	927461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422346
16602	NC_017268	T	7	7	927463	927469	0 %	100 %	0 %	0 %	384422346
16603	NC_017268	ATC	2	6	927481	927486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422346
16604	NC_017268	TGA	2	6	927518	927523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422346
16605	NC_017268	GTT	2	6	927786	927791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422346
16606	NC_017268	A	6	6	927803	927808	100 %	0 %	0 %	0 %	384422346
16607	NC_017268	ATC	2	6	927852	927857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422346
16608	NC_017268	CCT	2	6	927905	927910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422346
16609	NC_017268	TCTT	2	8	927949	927956	0 %	75 %	0 %	25 %	384422346
16610	NC_017268	CTGT	2	8	927960	927967	0 %	50 %	25 %	25 %	384422346
16611	NC_017268	TCC	2	6	927973	927978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422346
16612	NC_017268	CAA	2	6	928010	928015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422346
16613	NC_017268	TTGCC	2	10	928024	928033	0 %	40 %	20 %	40 %	384422346
16614	NC_017268	CA	3	6	928084	928089	50 %	0 %	0 %	50 %	384422346
16615	NC_017268	CTT	2	6	928100	928105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422346
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16619	NC_017268	GCC	2	6	928225	928230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422346
16620	NC_017268	A	6	6	928262	928267	100 %	0 %	0 %	0 %	384422346
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16988	NC_017268	TCCCT	2	10	946101	946110	0 %	40 %	0 %	60 %	384422358
16989	NC_017268	GC	3	6	946219	946224	0 %	0 %	50 %	50 %	384422359
16990	NC_017268	TCC	2	6	946273	946278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422359
16991	NC_017268	GCT	2	6	946290	946295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422359
16992	NC_017268	GCA	2	6	946325	946330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422359
16993	NC_017268	TGA	2	6	946411	946416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422359
16994	NC_017268	GC	3	6	946498	946503	0 %	0 %	50 %	50 %	384422359
16995	NC_017268	CAG	2	6	946525	946530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422359
16996	NC_017268	GGC	2	6	946544	946549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422359
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16998	NC_017268	TGC	2	6	946716	946721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422359
16999	NC_017268	GACT	2	8	946734	946741	25 %	25 %	25 %	25 %	384422359
17000	NC_017268	AAG	2	6	946814	946819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422359

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