MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017268	GA	3	6	895153	895158	50 %	0 %	50 %	0 %	384422317
16003	NC_017268	GC	3	6	895183	895188	0 %	0 %	50 %	50 %	384422317
16004	NC_017268	TTCT	2	8	895228	895235	0 %	75 %	0 %	25 %	384422317
16005	NC_017268	GTA	2	6	895257	895262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422317
16006	NC_017268	CG	3	6	895316	895321	0 %	0 %	50 %	50 %	384422317
16007	NC_017268	A	6	6	895498	895503	100 %	0 %	0 %	0 %	384422317
16008	NC_017268	AGA	2	6	895529	895534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422317
16009	NC_017268	GC	3	6	895540	895545	0 %	0 %	50 %	50 %	384422317
16010	NC_017268	TAC	2	6	895572	895577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422317
16011	NC_017268	GCA	2	6	895672	895677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422317
16012	NC_017268	CTG	2	6	895768	895773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422318
16013	NC_017268	GC	3	6	895779	895784	0 %	0 %	50 %	50 %	384422318
16014	NC_017268	GC	3	6	895866	895871	0 %	0 %	50 %	50 %	384422318
16015	NC_017268	TCC	2	6	895930	895935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422318
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16018	NC_017268	CAT	2	6	896031	896036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422318
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16020	NC_017268	AC	3	6	896186	896191	50 %	0 %	0 %	50 %	384422318
16021	NC_017268	CG	3	6	896227	896232	0 %	0 %	50 %	50 %	384422318
16022	NC_017268	ACA	2	6	896347	896352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422318
16023	NC_017268	CAGGTG	2	12	896419	896430	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384422318
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16025	NC_017268	GTACA	2	10	896554	896563	40 %	20 %	20 %	20 %	384422318
16026	NC_017268	CAGT	2	8	896599	896606	25 %	25 %	25 %	25 %	384422318
16027	NC_017268	CGG	2	6	896609	896614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422318
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16029	NC_017268	TAG	2	6	896650	896655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422319
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16031	NC_017268	CTT	2	6	896705	896710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422319
16032	NC_017268	TCA	2	6	896711	896716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422319
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16034	NC_017268	GT	3	6	896847	896852	0 %	50 %	50 %	0 %	384422319
16035	NC_017268	ATGG	2	8	896857	896864	25 %	25 %	50 %	0 %	384422319
16036	NC_017268	TGC	2	6	896891	896896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422319
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16039	NC_017268	A	6	6	897029	897034	100 %	0 %	0 %	0 %	384422320
16040	NC_017268	AGA	2	6	897103	897108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422320
16041	NC_017268	GGA	2	6	897119	897124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422320
16042	NC_017268	AAG	2	6	897160	897165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422320
16043	NC_017268	TCC	2	6	897202	897207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422320
16044	NC_017268	CCA	2	6	897303	897308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422320
16045	NC_017268	CTC	2	6	897376	897381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422320
16046	NC_017268	GCG	2	6	897386	897391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422320
16047	NC_017268	TAC	2	6	897395	897400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422320
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16049	NC_017268	GC	3	6	897465	897470	0 %	0 %	50 %	50 %	384422320
16050	NC_017268	GCA	2	6	897476	897481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422320
16051	NC_017268	T	6	6	897486	897491	0 %	100 %	0 %	0 %	384422320
16052	NC_017268	A	8	8	897501	897508	100 %	0 %	0 %	0 %	384422320
16053	NC_017268	TCT	2	6	897541	897546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422320
16054	NC_017268	T	7	7	897561	897567	0 %	100 %	0 %	0 %	384422320
16055	NC_017268	GAA	2	6	897602	897607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422320
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16057	NC_017268	AACA	2	8	897749	897756	75 %	0 %	0 %	25 %	384422320
16058	NC_017268	ATGA	2	8	897880	897887	50 %	25 %	25 %	0 %	384422320
16059	NC_017268	CGCA	2	8	898796	898803	25 %	0 %	25 %	50 %	384422321
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16061	NC_017268	TAA	2	6	898909	898914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422321
16062	NC_017268	GC	3	6	898938	898943	0 %	0 %	50 %	50 %	384422321
16063	NC_017268	AC	3	6	898947	898952	50 %	0 %	0 %	50 %	384422321
16064	NC_017268	CGTG	2	8	898996	899003	0 %	25 %	50 %	25 %	384422321
16065	NC_017268	CTT	2	6	899063	899068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422321
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16067	NC_017268	AAAGAC	2	12	899127	899138	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384422321
16068	NC_017268	GACT	2	8	899170	899177	25 %	25 %	25 %	25 %	384422321
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16089	NC_017268	TCT	2	6	900282	900287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422321
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16093	NC_017268	GCC	2	6	900475	900480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422321
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16095	NC_017268	GAAC	2	8	900528	900535	50 %	0 %	25 %	25 %	384422322
16096	NC_017268	TCAA	2	8	900598	900605	50 %	25 %	0 %	25 %	384422322
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16101	NC_017268	CCT	2	6	900881	900886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422322
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16104	NC_017268	ACG	2	6	901110	901115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422322
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16106	NC_017268	TCT	2	6	901197	901202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422322
16107	NC_017268	GAAA	2	8	901208	901215	75 %	0 %	25 %	0 %	384422322
16108	NC_017268	TGA	2	6	901263	901268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422322
16109	NC_017268	TGC	2	6	901331	901336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422322
16110	NC_017268	AC	3	6	901337	901342	50 %	0 %	0 %	50 %	384422323
16111	NC_017268	A	6	6	901363	901368	100 %	0 %	0 %	0 %	384422323
16112	NC_017268	AGC	2	6	901389	901394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422323
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16114	NC_017268	CTG	2	6	901482	901487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422324
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16118	NC_017268	TAC	2	6	901733	901738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422324
16119	NC_017268	GCG	2	6	901744	901749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422324
16120	NC_017268	CG	3	6	901752	901757	0 %	0 %	50 %	50 %	384422324
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16122	NC_017268	GCG	2	6	901840	901845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422324
16123	NC_017268	GCG	2	6	901860	901865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422324
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16135	NC_017268	CCGTC	2	10	902245	902254	0 %	20 %	20 %	60 %	384422325
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