MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017268	A	6	6	863115	863120	100 %	0 %	0 %	0 %	384422287
15503	NC_017268	GCGCT	2	10	863205	863214	0 %	20 %	40 %	40 %	384422288
15504	NC_017268	CGCA	2	8	863253	863260	25 %	0 %	25 %	50 %	384422288
15505	NC_017268	CA	4	8	863266	863273	50 %	0 %	0 %	50 %	384422288
15506	NC_017268	ATG	2	6	863276	863281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422288
15507	NC_017268	T	6	6	863299	863304	0 %	100 %	0 %	0 %	384422288
15508	NC_017268	AC	3	6	863305	863310	50 %	0 %	0 %	50 %	384422288
15509	NC_017268	CACG	2	8	863362	863369	25 %	0 %	25 %	50 %	384422289
15510	NC_017268	GC	3	6	863391	863396	0 %	0 %	50 %	50 %	384422289
15511	NC_017268	GCATCT	2	12	863499	863510	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384422289
15512	NC_017268	GT	3	6	863550	863555	0 %	50 %	50 %	0 %	384422289
15513	NC_017268	GAT	2	6	863579	863584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422289
15514	NC_017268	ATG	2	6	863585	863590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422289
15515	NC_017268	CAC	2	6	863639	863644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422289
15516	NC_017268	ACC	2	6	863664	863669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422289
15517	NC_017268	CGTGC	2	10	863687	863696	0 %	20 %	40 %	40 %	384422289
15518	NC_017268	TTCCA	2	10	863715	863724	20 %	40 %	0 %	40 %	384422289
15519	NC_017268	GCT	2	6	863736	863741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422289
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15521	NC_017268	GT	3	6	863910	863915	0 %	50 %	50 %	0 %	384422289
15522	NC_017268	GC	3	6	863917	863922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422289
15523	NC_017268	GC	3	6	863937	863942	0 %	0 %	50 %	50 %	384422289
15524	NC_017268	CCT	2	6	863977	863982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422289
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15529	NC_017268	GCA	2	6	864165	864170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422289
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15538	NC_017268	CGG	2	6	865479	865484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422290
15539	NC_017268	CAATT	2	10	865536	865545	40 %	40 %	0 %	20 %	384422290
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15543	NC_017268	A	7	7	865811	865817	100 %	0 %	0 %	0 %	384422290
15544	NC_017268	GAGG	2	8	865840	865847	25 %	0 %	75 %	0 %	384422290
15545	NC_017268	CTC	2	6	865860	865865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422290
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15549	NC_017268	ATTC	2	8	865896	865903	25 %	50 %	0 %	25 %	384422290
15550	NC_017268	GCA	2	6	865981	865986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422290
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15552	NC_017268	CGG	2	6	866022	866027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422290
15553	NC_017268	TCTT	2	8	866113	866120	0 %	75 %	0 %	25 %	384422290
15554	NC_017268	GCA	2	6	866122	866127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422290
15555	NC_017268	CA	4	8	866126	866133	50 %	0 %	0 %	50 %	384422290
15556	NC_017268	CTC	2	6	866135	866140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422290
15557	NC_017268	C	6	6	866140	866145	0 %	0 %	0 %	100 %	384422290
15558	NC_017268	TGC	2	6	866191	866196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422290
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15563	NC_017268	CGTA	2	8	866507	866514	25 %	25 %	25 %	25 %	384422290
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15565	NC_017268	C	6	6	866727	866732	0 %	0 %	0 %	100 %	384422290
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15604	NC_017268	GC	3	6	868552	868557	0 %	0 %	50 %	50 %	384422292
15605	NC_017268	GCAG	2	8	868686	868693	25 %	0 %	50 %	25 %	384422292
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15611	NC_017268	CAAC	2	8	868939	868946	50 %	0 %	0 %	50 %	384422292
15612	NC_017268	GCA	2	6	868956	868961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422292
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15854	NC_017268	TTTGA	2	10	886966	886975	20 %	60 %	20 %	0 %	384422307
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15860	NC_017268	CTGTG	2	10	887332	887341	0 %	40 %	40 %	20 %	384422307
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