MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017268	TG	3	6	837306	837311	0 %	50 %	50 %	0 %	384422265
15003	NC_017268	TGAA	2	8	837387	837394	50 %	25 %	25 %	0 %	384422265
15004	NC_017268	GCT	2	6	837449	837454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15005	NC_017268	ATC	2	6	837488	837493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422265
15006	NC_017268	GCC	2	6	837524	837529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422265
15007	NC_017268	A	6	6	837651	837656	100 %	0 %	0 %	0 %	384422265
15008	NC_017268	AGC	2	6	837699	837704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15009	NC_017268	GA	3	6	837726	837731	50 %	0 %	50 %	0 %	384422265
15010	NC_017268	TAG	2	6	837735	837740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422265
15011	NC_017268	TC	3	6	837779	837784	0 %	50 %	0 %	50 %	384422265
15012	NC_017268	TCT	2	6	837867	837872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422265
15013	NC_017268	ACGC	2	8	837888	837895	25 %	0 %	25 %	50 %	384422265
15014	NC_017268	GTT	2	6	837968	837973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422265
15015	NC_017268	GAA	2	6	837974	837979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422265
15016	NC_017268	AGA	2	6	837988	837993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422265
15017	NC_017268	GC	3	6	837995	838000	0 %	0 %	50 %	50 %	384422265
15018	NC_017268	TGC	2	6	838165	838170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15019	NC_017268	A	6	6	838203	838208	100 %	0 %	0 %	0 %	384422265
15020	NC_017268	TCG	2	6	838245	838250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15021	NC_017268	GTG	2	6	838298	838303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422265
15022	NC_017268	ACT	2	6	838305	838310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422265
15023	NC_017268	ACG	2	6	838411	838416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15024	NC_017268	TGG	2	6	838473	838478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422265
15025	NC_017268	AGG	2	6	838497	838502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422265
15026	NC_017268	CT	3	6	838544	838549	0 %	50 %	0 %	50 %	384422265
15027	NC_017268	GCT	2	6	838588	838593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422265
15028	NC_017268	AAG	2	6	838596	838601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422265
15029	NC_017268	CCG	2	6	838638	838643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422265
15030	NC_017268	CGC	2	6	838675	838680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422265
15031	NC_017268	A	8	8	838810	838817	100 %	0 %	0 %	0 %	384422265
15032	NC_017268	GC	3	6	838919	838924	0 %	0 %	50 %	50 %	384422265
15033	NC_017268	GGA	2	6	838942	838947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422265
15034	NC_017268	AAG	2	6	838964	838969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422265
15035	NC_017268	CG	3	6	838983	838988	0 %	0 %	50 %	50 %	384422265
15036	NC_017268	AAG	2	6	839117	839122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422265
15037	NC_017268	GGA	2	6	839137	839142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422265
15038	NC_017268	TTGA	2	8	839172	839179	25 %	50 %	25 %	0 %	384422265
15039	NC_017268	CACG	2	8	839262	839269	25 %	0 %	25 %	50 %	384422266
15040	NC_017268	CCA	2	6	839448	839453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422266
15041	NC_017268	CTC	2	6	839473	839478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422266
15042	NC_017268	ATC	2	6	839482	839487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422266
15043	NC_017268	CA	3	6	839541	839546	50 %	0 %	0 %	50 %	384422266
15044	NC_017268	AAAG	2	8	839621	839628	75 %	0 %	25 %	0 %	384422266
15045	NC_017268	TCA	2	6	839714	839719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422266
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15047	NC_017268	CT	3	6	839834	839839	0 %	50 %	0 %	50 %	384422266
15048	NC_017268	CGT	2	6	839883	839888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422266
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15050	NC_017268	AC	3	6	840038	840043	50 %	0 %	0 %	50 %	384422266
15051	NC_017268	A	6	6	840064	840069	100 %	0 %	0 %	0 %	384422266
15052	NC_017268	A	7	7	840074	840080	100 %	0 %	0 %	0 %	384422266
15053	NC_017268	GCA	2	6	840161	840166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422266
15054	NC_017268	TGC	2	6	840202	840207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422266
15055	NC_017268	ACTCC	2	10	840213	840222	20 %	20 %	0 %	60 %	384422266
15056	NC_017268	ACC	2	6	840229	840234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422266
15057	NC_017268	GAG	2	6	840272	840277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422266
15058	NC_017268	AAGG	2	8	840355	840362	50 %	0 %	50 %	0 %	384422266
15059	NC_017268	GGA	2	6	840383	840388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422266
15060	NC_017268	AG	3	6	840397	840402	50 %	0 %	50 %	0 %	384422266
15061	NC_017268	AGA	2	6	840422	840427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422266
15062	NC_017268	ATG	2	6	840437	840442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422266
15063	NC_017268	A	7	7	840475	840481	100 %	0 %	0 %	0 %	384422266
15064	NC_017268	CAA	2	6	840552	840557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422266
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15072	NC_017268	CTG	2	6	841105	841110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422267
15073	NC_017268	CCT	2	6	841171	841176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422267
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15079	NC_017268	GCT	2	6	841659	841664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422267
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15088	NC_017268	TCC	2	6	841943	841948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422268
15089	NC_017268	TAA	2	6	841958	841963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422268
15090	NC_017268	C	6	6	842012	842017	0 %	0 %	0 %	100 %	384422268
15091	NC_017268	GCT	2	6	842030	842035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422268
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15094	NC_017268	AGA	2	6	842281	842286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422268
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15099	NC_017268	AAC	2	6	842446	842451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422268
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15102	NC_017268	AAAC	2	8	842571	842578	75 %	0 %	0 %	25 %	384422268
15103	NC_017268	CGT	2	6	842640	842645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422268
15104	NC_017268	GA	3	6	842651	842656	50 %	0 %	50 %	0 %	384422268
15105	NC_017268	TCG	2	6	842846	842851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422268
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15111	NC_017268	CGCA	2	8	842991	842998	25 %	0 %	25 %	50 %	384422268
15112	NC_017268	ACC	2	6	843014	843019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422268
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15116	NC_017268	CA	3	6	843498	843503	50 %	0 %	0 %	50 %	384422269
15117	NC_017268	GGT	2	6	843602	843607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422269
15118	NC_017268	CGG	3	9	843626	843634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422269
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15228	NC_017268	TACG	2	8	848981	848988	25 %	25 %	25 %	25 %	384422275
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15239	NC_017268	CGTG	2	8	849385	849392	0 %	25 %	50 %	25 %	384422275
15240	NC_017268	AGC	2	6	849405	849410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422275
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15242	NC_017268	GCAAGC	2	12	849564	849575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422275
15243	NC_017268	CCACA	2	10	849598	849607	40 %	0 %	0 %	60 %	384422275
15244	NC_017268	CGTT	2	8	849680	849687	0 %	50 %	25 %	25 %	384422276
15245	NC_017268	CG	3	6	849705	849710	0 %	0 %	50 %	50 %	384422276
15246	NC_017268	GACA	2	8	849810	849817	50 %	0 %	25 %	25 %	384422276
15247	NC_017268	CAC	2	6	849878	849883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422276
15248	NC_017268	CG	3	6	850024	850029	0 %	0 %	50 %	50 %	384422276
15249	NC_017268	GCT	2	6	850032	850037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422276
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15253	NC_017268	ATCA	2	8	850160	850167	50 %	25 %	0 %	25 %	384422276
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15255	NC_017268	GTAC	2	8	850410	850417	25 %	25 %	25 %	25 %	384422276
15256	NC_017268	CTG	2	6	850466	850471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422276
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15259	NC_017268	AAG	2	6	850662	850667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422277
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15261	NC_017268	T	8	8	850689	850696	0 %	100 %	0 %	0 %	384422277
15262	NC_017268	CG	3	6	850755	850760	0 %	0 %	50 %	50 %	384422277
15263	NC_017268	GCT	2	6	850784	850789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422277
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15270	NC_017268	CGCA	2	8	851063	851070	25 %	0 %	25 %	50 %	384422277
15271	NC_017268	AG	4	8	851088	851095	50 %	0 %	50 %	0 %	384422277
15272	NC_017268	CCCG	2	8	851124	851131	0 %	0 %	25 %	75 %	384422277
15273	NC_017268	GCA	2	6	851209	851214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422277
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15275	NC_017268	CG	4	8	851270	851277	0 %	0 %	50 %	50 %	384422277
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15300	NC_017268	CGA	2	6	852772	852777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422279
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15347	NC_017268	CGAAG	2	10	855259	855268	40 %	0 %	40 %	20 %	384422282
15348	NC_017268	GCA	2	6	855295	855300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422282
15349	NC_017268	AGCGC	2	10	855309	855318	20 %	0 %	40 %	40 %	384422282
15350	NC_017268	T	6	6	855362	855367	0 %	100 %	0 %	0 %	384422282
15351	NC_017268	AAG	2	6	855440	855445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422282
15352	NC_017268	GCCA	2	8	855455	855462	25 %	0 %	25 %	50 %	384422282
15353	NC_017268	GAA	2	6	855479	855484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422282
15354	NC_017268	ACA	2	6	855485	855490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422282
15355	NC_017268	GTA	2	6	855597	855602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422283
15356	NC_017268	T	6	6	855701	855706	0 %	100 %	0 %	0 %	384422283
15357	NC_017268	TG	3	6	855787	855792	0 %	50 %	50 %	0 %	384422283
15358	NC_017268	GCAC	2	8	855808	855815	25 %	0 %	25 %	50 %	384422283
15359	NC_017268	TCA	2	6	855855	855860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422283
15360	NC_017268	CAA	2	6	855877	855882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422283
15361	NC_017268	C	7	7	855934	855940	0 %	0 %	0 %	100 %	384422283
15362	NC_017268	AAG	2	6	856017	856022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422283
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