MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017268	ACC	2	6	809444	809449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422239
14502	NC_017268	AAC	2	6	809451	809456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422239
14503	NC_017268	CT	3	6	809512	809517	0 %	50 %	0 %	50 %	384422239
14504	NC_017268	TAC	2	6	809527	809532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422239
14505	NC_017268	CA	3	6	809563	809568	50 %	0 %	0 %	50 %	384422240
14506	NC_017268	CGCA	2	8	809580	809587	25 %	0 %	25 %	50 %	384422240
14507	NC_017268	ACGT	2	8	809620	809627	25 %	25 %	25 %	25 %	384422240
14508	NC_017268	AG	3	6	809662	809667	50 %	0 %	50 %	0 %	384422240
14509	NC_017268	C	7	7	809687	809693	0 %	0 %	0 %	100 %	384422240
14510	NC_017268	GA	3	6	809703	809708	50 %	0 %	50 %	0 %	384422240
14511	NC_017268	CCG	2	6	809719	809724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422240
14512	NC_017268	CA	4	8	809791	809798	50 %	0 %	0 %	50 %	384422240
14513	NC_017268	GCA	2	6	809823	809828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422240
14514	NC_017268	GGT	2	6	809959	809964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422241
14515	NC_017268	CTT	2	6	809969	809974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422241
14516	NC_017268	CAC	2	6	810023	810028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422241
14517	NC_017268	CG	3	6	810029	810034	0 %	0 %	50 %	50 %	384422241
14518	NC_017268	CCA	2	6	810084	810089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422241
14519	NC_017268	ATC	2	6	810090	810095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422241
14520	NC_017268	CCCG	2	8	810119	810126	0 %	0 %	25 %	75 %	384422241
14521	NC_017268	TAT	2	6	810142	810147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422241
14522	NC_017268	TAC	3	9	810157	810165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422241
14523	NC_017268	A	6	6	810224	810229	100 %	0 %	0 %	0 %	384422241
14524	NC_017268	GC	3	6	810328	810333	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
14525	NC_017268	CCTT	2	8	810382	810389	0 %	50 %	0 %	50 %	384422242
14526	NC_017268	CA	3	6	810521	810526	50 %	0 %	0 %	50 %	384422242
14527	NC_017268	CG	3	6	810593	810598	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
14528	NC_017268	GC	3	6	810738	810743	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
14529	NC_017268	GCAG	2	8	810769	810776	25 %	0 %	50 %	25 %	384422242
14530	NC_017268	CACC	2	8	810788	810795	25 %	0 %	0 %	75 %	384422242
14531	NC_017268	CCT	2	6	810806	810811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14532	NC_017268	TCT	2	6	810956	810961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422242
14533	NC_017268	GC	3	6	810994	810999	0 %	0 %	50 %	50 %	384422242
14534	NC_017268	CTC	2	6	811101	811106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14535	NC_017268	CTC	2	6	811302	811307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14536	NC_017268	CGG	2	6	811330	811335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422242
14537	NC_017268	TCT	2	6	811351	811356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422242
14538	NC_017268	GAA	2	6	811359	811364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422242
14539	NC_017268	GCGAGC	2	12	811408	811419	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384422242
14540	NC_017268	AACG	2	8	811459	811466	50 %	0 %	25 %	25 %	384422242
14541	NC_017268	GTA	2	6	811566	811571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422242
14542	NC_017268	GGAC	2	8	811654	811661	25 %	0 %	50 %	25 %	384422242
14543	NC_017268	CAA	2	6	811688	811693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422242
14544	NC_017268	C	7	7	811713	811719	0 %	0 %	0 %	100 %	384422242
14545	NC_017268	AGAA	2	8	811725	811732	75 %	0 %	25 %	0 %	384422242
14546	NC_017268	CACGC	2	10	811826	811835	20 %	0 %	20 %	60 %	384422242
14547	NC_017268	CCG	2	6	811874	811879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422242
14548	NC_017268	AAT	2	6	811893	811898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422242
14549	NC_017268	C	7	7	811899	811905	0 %	0 %	0 %	100 %	384422242
14550	NC_017268	CCA	2	6	812006	812011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422242
14551	NC_017268	AGC	2	6	812032	812037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422242
14552	NC_017268	CTTCG	2	10	812061	812070	0 %	40 %	20 %	40 %	384422242
14553	NC_017268	TC	3	6	812132	812137	0 %	50 %	0 %	50 %	384422242
14554	NC_017268	TCC	2	6	812146	812151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14555	NC_017268	TCG	2	6	812230	812235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422242
14556	NC_017268	CTC	2	6	812241	812246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14557	NC_017268	TCT	2	6	812267	812272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422242
14558	NC_017268	TCC	2	6	812377	812382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14559	NC_017268	CAG	2	6	812391	812396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422242
14560	NC_017268	CTT	2	6	812417	812422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422242
14561	NC_017268	CAT	2	6	812438	812443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422242
14562	NC_017268	TCC	2	6	812511	812516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422242
14563	NC_017268	A	7	7	812521	812527	100 %	0 %	0 %	0 %	384422242
14564	NC_017268	GAA	2	6	812628	812633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422242
14565	NC_017268	ACC	2	6	812752	812757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422242
14566	NC_017268	GAG	2	6	812760	812765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422242
14567	NC_017268	GA	3	6	812867	812872	50 %	0 %	50 %	0 %	384422242
14568	NC_017268	GAC	2	6	812936	812941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422242
14569	NC_017268	AATG	2	8	813002	813009	50 %	25 %	25 %	0 %	384422242
14570	NC_017268	CCT	2	6	813101	813106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422243
14571	NC_017268	AG	3	6	813117	813122	50 %	0 %	50 %	0 %	384422243
14572	NC_017268	AG	3	6	813200	813205	50 %	0 %	50 %	0 %	384422243
14573	NC_017268	GAA	2	6	813253	813258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422243
14574	NC_017268	CG	3	6	813265	813270	0 %	0 %	50 %	50 %	384422243
14575	NC_017268	ATA	2	6	813283	813288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422243
14576	NC_017268	AAC	2	6	813319	813324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422243
14577	NC_017268	AGG	2	6	813387	813392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422243
14578	NC_017268	CG	3	6	813394	813399	0 %	0 %	50 %	50 %	384422243
14579	NC_017268	CTT	2	6	813474	813479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422243
14580	NC_017268	TCA	2	6	813625	813630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422243
14581	NC_017268	CAA	2	6	813663	813668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422243
14582	NC_017268	TTC	2	6	813715	813720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422243
14583	NC_017268	TGA	2	6	813751	813756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422243
14584	NC_017268	CCTT	2	8	813827	813834	0 %	50 %	0 %	50 %	384422243
14585	NC_017268	AGC	2	6	813928	813933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422243
14586	NC_017268	TTC	2	6	813958	813963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422243
14587	NC_017268	TTC	3	9	814024	814032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422243
14588	NC_017268	CAC	2	6	814065	814070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422243
14589	NC_017268	GCAC	2	8	814385	814392	25 %	0 %	25 %	50 %	384422244
14590	NC_017268	ACG	3	9	814399	814407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14591	NC_017268	CTT	2	6	814498	814503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422244
14592	NC_017268	CTC	2	6	814612	814617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422244
14593	NC_017268	CATA	2	8	814650	814657	50 %	25 %	0 %	25 %	384422244
14594	NC_017268	CTTC	2	8	814687	814694	0 %	50 %	0 %	50 %	384422244
14595	NC_017268	CAG	2	6	814749	814754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14596	NC_017268	CTT	2	6	814831	814836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422244
14597	NC_017268	CTT	2	6	814843	814848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422244
14598	NC_017268	TCA	2	6	814865	814870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422244
14599	NC_017268	GCA	2	6	814926	814931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14600	NC_017268	GAT	2	6	814941	814946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422244
14601	NC_017268	CTC	2	6	814993	814998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422244
14602	NC_017268	TCA	2	6	815045	815050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422244
14603	NC_017268	TCA	2	6	815072	815077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422244
14604	NC_017268	CG	3	6	815097	815102	0 %	0 %	50 %	50 %	384422244
14605	NC_017268	T	7	7	815217	815223	0 %	100 %	0 %	0 %	384422244
14606	NC_017268	CG	3	6	815272	815277	0 %	0 %	50 %	50 %	384422244
14607	NC_017268	TCG	2	6	815351	815356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14608	NC_017268	CATCTT	2	12	815371	815382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384422244
14609	NC_017268	GAT	2	6	815389	815394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422244
14610	NC_017268	GAGAT	2	10	815486	815495	40 %	20 %	40 %	0 %	384422244
14611	NC_017268	TAA	2	6	815499	815504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422244
14612	NC_017268	CGT	2	6	815515	815520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14613	NC_017268	CTAA	2	8	815540	815547	50 %	25 %	0 %	25 %	384422244
14614	NC_017268	TC	3	6	815646	815651	0 %	50 %	0 %	50 %	384422244
14615	NC_017268	GCA	2	6	815685	815690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422244
14616	NC_017268	TC	3	6	815778	815783	0 %	50 %	0 %	50 %	384422244
14617	NC_017268	CTT	2	6	815893	815898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422244
14618	NC_017268	AGT	2	6	815961	815966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422244
14619	NC_017268	ACCC	2	8	815985	815992	25 %	0 %	0 %	75 %	384422244
14620	NC_017268	CCT	2	6	816015	816020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422244
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14622	NC_017268	TTGT	2	8	816053	816060	0 %	75 %	25 %	0 %	384422244
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