MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017268	GAG	2	6	783079	783084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422213
14002	NC_017268	AAC	2	6	783265	783270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14003	NC_017268	CAT	2	6	783317	783322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422213
14004	NC_017268	ACC	2	6	783325	783330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422213
14005	NC_017268	GAT	2	6	783357	783362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422213
14006	NC_017268	GAT	2	6	783432	783437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422213
14007	NC_017268	TTC	2	6	783489	783494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422213
14008	NC_017268	CA	3	6	783502	783507	50 %	0 %	0 %	50 %	384422213
14009	NC_017268	CCT	2	6	783551	783556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422213
14010	NC_017268	AAT	2	6	783672	783677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422213
14011	NC_017268	TAA	2	6	783725	783730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422213
14012	NC_017268	CAA	2	6	783770	783775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14013	NC_017268	T	6	6	783884	783889	0 %	100 %	0 %	0 %	384422213
14014	NC_017268	AC	3	6	783954	783959	50 %	0 %	0 %	50 %	384422213
14015	NC_017268	A	6	6	783966	783971	100 %	0 %	0 %	0 %	384422213
14016	NC_017268	AATAA	2	10	784029	784038	80 %	20 %	0 %	0 %	384422213
14017	NC_017268	ACA	3	9	784130	784138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14018	NC_017268	AAG	2	6	784139	784144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422213
14019	NC_017268	GCAA	2	8	784153	784160	50 %	0 %	25 %	25 %	384422213
14020	NC_017268	TGC	2	6	784197	784202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422213
14021	NC_017268	CCCT	2	8	784210	784217	0 %	25 %	0 %	75 %	384422213
14022	NC_017268	TAA	2	6	784265	784270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422213
14023	NC_017268	TCCA	2	8	784311	784318	25 %	25 %	0 %	50 %	384422213
14024	NC_017268	A	7	7	784326	784332	100 %	0 %	0 %	0 %	384422213
14025	NC_017268	CTT	3	9	784370	784378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422213
14026	NC_017268	GCA	2	6	784453	784458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422213
14027	NC_017268	TAA	2	6	784487	784492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422213
14028	NC_017268	ATG	2	6	784516	784521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422213
14029	NC_017268	TCC	2	6	784560	784565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422213
14030	NC_017268	CAC	2	6	784566	784571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422213
14031	NC_017268	AGTCCA	2	12	784651	784662	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384422213
14032	NC_017268	CAA	2	6	784677	784682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14033	NC_017268	CAA	2	6	784718	784723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14034	NC_017268	AAGAT	2	10	784753	784762	60 %	20 %	20 %	0 %	384422213
14035	NC_017268	AAC	2	6	784803	784808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14036	NC_017268	ACC	2	6	784822	784827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422213
14037	NC_017268	CAA	2	6	784841	784846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422213
14038	NC_017268	AGT	2	6	784854	784859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422213
14039	NC_017268	GCT	2	6	786051	786056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422214
14040	NC_017268	AAAC	2	8	786087	786094	75 %	0 %	0 %	25 %	384422214
14041	NC_017268	GAA	2	6	786111	786116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422214
14042	NC_017268	AAAC	2	8	786129	786136	75 %	0 %	0 %	25 %	384422214
14043	NC_017268	AG	3	6	786166	786171	50 %	0 %	50 %	0 %	384422214
14044	NC_017268	TAA	2	6	786199	786204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422214
14045	NC_017268	A	7	7	786269	786275	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14046	NC_017268	A	6	6	786295	786300	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14047	NC_017268	CAG	2	6	786301	786306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422214
14048	NC_017268	GCA	2	6	786360	786365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422214
14049	NC_017268	CCT	2	6	786368	786373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422214
14050	NC_017268	A	7	7	786404	786410	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14051	NC_017268	A	7	7	786510	786516	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14052	NC_017268	TAA	2	6	786552	786557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422214
14053	NC_017268	A	7	7	786556	786562	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14054	NC_017268	CAA	2	6	786595	786600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422214
14055	NC_017268	AG	3	6	786726	786731	50 %	0 %	50 %	0 %	384422214
14056	NC_017268	CCG	2	6	786762	786767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422214
14057	NC_017268	A	8	8	786772	786779	100 %	0 %	0 %	0 %	384422214
14058	NC_017268	CTC	2	6	786845	786850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422215
14059	NC_017268	GCA	2	6	786894	786899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422215
14060	NC_017268	CCAC	2	8	786910	786917	25 %	0 %	0 %	75 %	384422215
14061	NC_017268	GAG	2	6	786919	786924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422215
14062	NC_017268	ACC	2	6	787061	787066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422215
14063	NC_017268	TCA	2	6	787110	787115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422215
14064	NC_017268	CA	3	6	787114	787119	50 %	0 %	0 %	50 %	384422215
14065	NC_017268	CTAT	2	8	787157	787164	25 %	50 %	0 %	25 %	384422216
14066	NC_017268	CAG	2	6	787165	787170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422216
14067	NC_017268	CCA	2	6	787182	787187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422216
14068	NC_017268	CGG	2	6	787228	787233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422216
14069	NC_017268	CAA	2	6	787281	787286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422216
14070	NC_017268	AGA	2	6	787432	787437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422216
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14072	NC_017268	GGC	2	6	787622	787627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422216
14073	NC_017268	TGC	2	6	787631	787636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422216
14074	NC_017268	TCA	2	6	787692	787697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422216
14075	NC_017268	TGA	2	6	787800	787805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422216
14076	NC_017268	GCCG	2	8	787820	787827	0 %	0 %	50 %	50 %	384422216
14077	NC_017268	CGC	2	6	787848	787853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422216
14078	NC_017268	CG	3	6	787866	787871	0 %	0 %	50 %	50 %	384422216
14079	NC_017268	GAA	2	6	787891	787896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422216
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14081	NC_017268	ACGC	2	8	787928	787935	25 %	0 %	25 %	50 %	384422216
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14085	NC_017268	CG	4	8	788063	788070	0 %	0 %	50 %	50 %	384422217
14086	NC_017268	GC	3	6	788079	788084	0 %	0 %	50 %	50 %	384422217
14087	NC_017268	TCA	2	6	788125	788130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422217
14088	NC_017268	CGA	2	6	788132	788137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422217
14089	NC_017268	GC	3	6	788218	788223	0 %	0 %	50 %	50 %	384422217
14090	NC_017268	GC	3	6	788248	788253	0 %	0 %	50 %	50 %	384422217
14091	NC_017268	GC	3	6	788300	788305	0 %	0 %	50 %	50 %	384422217
14092	NC_017268	AGAA	2	8	788307	788314	75 %	0 %	25 %	0 %	384422217
14093	NC_017268	CA	3	6	788357	788362	50 %	0 %	0 %	50 %	384422217
14094	NC_017268	AGA	2	6	788392	788397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422217
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14098	NC_017268	GCT	2	6	788516	788521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422217
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14100	NC_017268	A	7	7	788611	788617	100 %	0 %	0 %	0 %	384422217
14101	NC_017268	GA	3	6	788699	788704	50 %	0 %	50 %	0 %	384422218
14102	NC_017268	TCA	2	6	788732	788737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422218
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14105	NC_017268	CTG	2	6	788940	788945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422218
14106	NC_017268	GACT	2	8	788968	788975	25 %	25 %	25 %	25 %	384422218
14107	NC_017268	C	6	6	789020	789025	0 %	0 %	0 %	100 %	384422218
14108	NC_017268	CCTGCG	2	12	789042	789053	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384422218
14109	NC_017268	C	8	8	789066	789073	0 %	0 %	0 %	100 %	384422218
14110	NC_017268	GCT	2	6	789099	789104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422218
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14112	NC_017268	ATC	2	6	789322	789327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422218
14113	NC_017268	TGAC	2	8	789347	789354	25 %	25 %	25 %	25 %	384422218
14114	NC_017268	CGG	2	6	789499	789504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422218
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14117	NC_017268	TCC	2	6	789723	789728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422219
14118	NC_017268	T	6	6	789801	789806	0 %	100 %	0 %	0 %	384422219
14119	NC_017268	CAC	2	6	789809	789814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422219
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14122	NC_017268	CCA	2	6	789958	789963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422219
14123	NC_017268	GAA	2	6	790035	790040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422219
14124	NC_017268	TCA	2	6	790105	790110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422219
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14126	NC_017268	ACC	2	6	790152	790157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422219
14127	NC_017268	GAGG	2	8	790164	790171	25 %	0 %	75 %	0 %	384422219
14128	NC_017268	CCTGT	2	10	790333	790342	0 %	40 %	20 %	40 %	384422219
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14152	NC_017268	GT	3	6	791510	791515	0 %	50 %	50 %	0 %	384422222
14153	NC_017268	GT	3	6	791650	791655	0 %	50 %	50 %	0 %	384422222
14154	NC_017268	CAA	2	6	791715	791720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422222
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14227	NC_017268	CTGCGC	2	12	795795	795806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384422227
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14229	NC_017268	CG	3	6	795854	795859	0 %	0 %	50 %	50 %	384422227
14230	NC_017268	CG	3	6	795868	795873	0 %	0 %	50 %	50 %	384422227
14231	NC_017268	GC	3	6	795888	795893	0 %	0 %	50 %	50 %	384422227
14232	NC_017268	GAG	2	6	795917	795922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422227
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14236	NC_017268	CTGC	2	8	796033	796040	0 %	25 %	25 %	50 %	384422227
14237	NC_017268	CAC	2	6	796064	796069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422227
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14480	NC_017268	GTAT	2	8	808373	808380	25 %	50 %	25 %	0 %	384422238
14481	NC_017268	GCA	2	6	808537	808542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422238
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14483	NC_017268	CG	3	6	808593	808598	0 %	0 %	50 %	50 %	384422238
14484	NC_017268	A	7	7	808604	808610	100 %	0 %	0 %	0 %	384422238
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14487	NC_017268	GC	3	6	808717	808722	0 %	0 %	50 %	50 %	384422238
14488	NC_017268	CTG	2	6	808733	808738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422238
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14491	NC_017268	CGC	2	6	809017	809022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422238
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