MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017268	CA	3	6	756854	756859	50 %	0 %	0 %	50 %	384422188
13503	NC_017268	TGC	2	6	756898	756903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422188
13504	NC_017268	TCC	2	6	756924	756929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422188
13505	NC_017268	ACTTT	2	10	756947	756956	20 %	60 %	0 %	20 %	384422188
13506	NC_017268	T	6	6	756954	756959	0 %	100 %	0 %	0 %	384422188
13507	NC_017268	GCA	2	6	756970	756975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422188
13508	NC_017268	A	6	6	757015	757020	100 %	0 %	0 %	0 %	384422188
13509	NC_017268	TCG	2	6	757024	757029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422188
13510	NC_017268	AATC	2	8	757103	757110	50 %	25 %	0 %	25 %	384422188
13511	NC_017268	TCA	2	6	757147	757152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422188
13512	NC_017268	GAA	2	6	757153	757158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422188
13513	NC_017268	T	6	6	757170	757175	0 %	100 %	0 %	0 %	384422188
13514	NC_017268	GGA	3	9	757399	757407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422189
13515	NC_017268	ACG	2	6	757409	757414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422189
13516	NC_017268	TACA	2	8	757484	757491	50 %	25 %	0 %	25 %	384422189
13517	NC_017268	AG	3	6	757603	757608	50 %	0 %	50 %	0 %	384422189
13518	NC_017268	CTTC	2	8	757612	757619	0 %	50 %	0 %	50 %	384422189
13519	NC_017268	CAA	2	6	757620	757625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422189
13520	NC_017268	TCT	2	6	757685	757690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422189
13521	NC_017268	CGA	2	6	757721	757726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422189
13522	NC_017268	TACAA	2	10	757729	757738	60 %	20 %	0 %	20 %	384422189
13523	NC_017268	AGT	2	6	757778	757783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422189
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13525	NC_017268	GTA	2	6	757888	757893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422189
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13527	NC_017268	TCA	2	6	757940	757945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422189
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13529	NC_017268	ATC	2	6	757995	758000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422189
13530	NC_017268	ACCGT	2	10	758112	758121	20 %	20 %	20 %	40 %	384422189
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13532	NC_017268	CTC	2	6	758144	758149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422189
13533	NC_017268	TTA	2	6	758158	758163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422189
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13535	NC_017268	TCT	2	6	758218	758223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422189
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13539	NC_017268	A	6	6	758339	758344	100 %	0 %	0 %	0 %	384422189
13540	NC_017268	CAA	2	6	758363	758368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422189
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13543	NC_017268	TCC	2	6	758582	758587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422189
13544	NC_017268	GC	3	6	758635	758640	0 %	0 %	50 %	50 %	384422190
13545	NC_017268	TAAA	2	8	758650	758657	75 %	25 %	0 %	0 %	384422190
13546	NC_017268	ATTTA	2	10	758732	758741	40 %	60 %	0 %	0 %	384422190
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13550	NC_017268	AC	3	6	758971	758976	50 %	0 %	0 %	50 %	384422190
13551	NC_017268	AT	3	6	759061	759066	50 %	50 %	0 %	0 %	384422190
13552	NC_017268	TAC	2	6	759074	759079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422190
13553	NC_017268	TC	3	6	759080	759085	0 %	50 %	0 %	50 %	384422190
13554	NC_017268	CGG	3	9	759118	759126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422190
13555	NC_017268	A	6	6	759255	759260	100 %	0 %	0 %	0 %	384422191
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13557	NC_017268	CA	4	8	759320	759327	50 %	0 %	0 %	50 %	384422191
13558	NC_017268	GCT	2	6	759344	759349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
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13561	NC_017268	CTT	2	6	759428	759433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422191
13562	NC_017268	CTG	2	6	759527	759532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
13563	NC_017268	TGC	2	6	759547	759552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422191
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13565	NC_017268	CAC	2	6	759571	759576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422191
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13570	NC_017268	TGA	2	6	759863	759868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422191
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13572	NC_017268	CATC	2	8	759938	759945	25 %	25 %	0 %	50 %	384422191
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13581	NC_017268	G	6	6	760398	760403	0 %	0 %	100 %	0 %	384422192
13582	NC_017268	CCTTA	2	10	760431	760440	20 %	40 %	0 %	40 %	384422192
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13588	NC_017268	TGA	2	6	760616	760621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422192
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13592	NC_017268	GTT	2	6	760942	760947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422192
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13601	NC_017268	CA	3	6	761627	761632	50 %	0 %	0 %	50 %	384422193
13602	NC_017268	C	6	6	761705	761710	0 %	0 %	0 %	100 %	384422193
13603	NC_017268	CG	6	12	761721	761732	0 %	0 %	50 %	50 %	384422193
13604	NC_017268	TACC	2	8	761755	761762	25 %	25 %	0 %	50 %	384422193
13605	NC_017268	C	6	6	761810	761815	0 %	0 %	0 %	100 %	384422193
13606	NC_017268	CCTG	2	8	761899	761906	0 %	25 %	25 %	50 %	384422193
13607	NC_017268	AC	3	6	761951	761956	50 %	0 %	0 %	50 %	384422193
13608	NC_017268	CGCTG	2	10	761981	761990	0 %	20 %	40 %	40 %	384422193
13609	NC_017268	TTC	2	6	761993	761998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422193
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13611	NC_017268	CGG	2	6	762308	762313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422193
13612	NC_017268	CG	3	6	762319	762324	0 %	0 %	50 %	50 %	384422193
13613	NC_017268	GCA	2	6	762343	762348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422193
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13617	NC_017268	GTG	2	6	762515	762520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422193
13618	NC_017268	AC	3	6	762598	762603	50 %	0 %	0 %	50 %	384422193
13619	NC_017268	CGCC	2	8	762616	762623	0 %	0 %	25 %	75 %	384422193
13620	NC_017268	GCA	2	6	762639	762644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422193
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13991	NC_017268	TGCG	2	8	782634	782641	0 %	25 %	50 %	25 %	384422212
13992	NC_017268	CTA	2	6	782713	782718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422212
13993	NC_017268	ACT	2	6	782762	782767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422213
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13995	NC_017268	TAC	2	6	782808	782813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422213
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