MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017268	GAA	2	6	728714	728719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422166
13002	NC_017268	CCT	2	6	728725	728730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422166
13003	NC_017268	CGCT	2	8	728751	728758	0 %	25 %	25 %	50 %	384422166
13004	NC_017268	ACC	2	6	728808	728813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422166
13005	NC_017268	TGG	2	6	728820	728825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422166
13006	NC_017268	GAG	2	6	728831	728836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422166
13007	NC_017268	CTT	2	6	728837	728842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422166
13008	NC_017268	CGTCC	2	10	728891	728900	0 %	20 %	20 %	60 %	384422166
13009	NC_017268	GAC	2	6	728906	728911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422166
13010	NC_017268	AGT	2	6	728965	728970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422166
13011	NC_017268	AGC	2	6	729050	729055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422167
13012	NC_017268	GCT	2	6	729069	729074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422167
13013	NC_017268	C	6	6	729099	729104	0 %	0 %	0 %	100 %	384422167
13014	NC_017268	ACC	2	6	729106	729111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422167
13015	NC_017268	CAC	2	6	731294	731299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422168
13016	NC_017268	A	7	7	731309	731315	100 %	0 %	0 %	0 %	384422168
13017	NC_017268	CG	3	6	731328	731333	0 %	0 %	50 %	50 %	384422168
13018	NC_017268	AC	3	6	731349	731354	50 %	0 %	0 %	50 %	384422168
13019	NC_017268	CAT	2	6	731438	731443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422168
13020	NC_017268	A	6	6	731447	731452	100 %	0 %	0 %	0 %	384422168
13021	NC_017268	CAGCAA	2	12	731546	731557	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384422168
13022	NC_017268	CAGCAT	2	12	731558	731569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384422168
13023	NC_017268	GCA	2	6	731572	731577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422168
13024	NC_017268	ACCGA	2	10	731595	731604	40 %	0 %	20 %	40 %	384422168
13025	NC_017268	GCAC	2	8	731862	731869	25 %	0 %	25 %	50 %	384422169
13026	NC_017268	TGC	2	6	731909	731914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13027	NC_017268	ACGT	2	8	731960	731967	25 %	25 %	25 %	25 %	384422169
13028	NC_017268	CATG	2	8	731979	731986	25 %	25 %	25 %	25 %	384422169
13029	NC_017268	GAA	2	6	731988	731993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422169
13030	NC_017268	CCT	2	6	732008	732013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422169
13031	NC_017268	TC	3	6	732126	732131	0 %	50 %	0 %	50 %	384422169
13032	NC_017268	CCAG	2	8	732158	732165	25 %	0 %	25 %	50 %	384422169
13033	NC_017268	CCA	2	6	732258	732263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422169
13034	NC_017268	ATA	2	6	732269	732274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
13035	NC_017268	GC	3	6	732291	732296	0 %	0 %	50 %	50 %	384422169
13036	NC_017268	CTC	2	6	732301	732306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422169
13037	NC_017268	CACAG	2	10	732308	732317	40 %	0 %	20 %	40 %	384422169
13038	NC_017268	TATT	2	8	732431	732438	25 %	75 %	0 %	0 %	384422169
13039	NC_017268	TCA	2	6	732506	732511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
13040	NC_017268	ATA	2	6	732529	732534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
13041	NC_017268	TC	3	6	732562	732567	0 %	50 %	0 %	50 %	384422169
13042	NC_017268	TTC	2	6	732580	732585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
13043	NC_017268	GCTT	2	8	732640	732647	0 %	50 %	25 %	25 %	384422169
13044	NC_017268	T	6	6	732668	732673	0 %	100 %	0 %	0 %	384422169
13045	NC_017268	TCG	2	6	732695	732700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13046	NC_017268	ATT	2	6	732761	732766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422169
13047	NC_017268	T	8	8	732773	732780	0 %	100 %	0 %	0 %	384422169
13048	NC_017268	AGG	2	6	732822	732827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422169
13049	NC_017268	TCA	2	6	732851	732856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
13050	NC_017268	CAA	2	6	732898	732903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422169
13051	NC_017268	AATT	2	8	733026	733033	50 %	50 %	0 %	0 %	384422169
13052	NC_017268	CGG	2	6	733062	733067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422169
13053	NC_017268	TTA	2	6	733130	733135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422169
13054	NC_017268	TTTTC	2	10	733230	733239	0 %	80 %	0 %	20 %	384422169
13055	NC_017268	TTTC	2	8	733258	733265	0 %	75 %	0 %	25 %	384422169
13056	NC_017268	TATTT	2	10	733400	733409	20 %	80 %	0 %	0 %	384422169
13057	NC_017268	AT	3	6	733433	733438	50 %	50 %	0 %	0 %	384422169
13058	NC_017268	AATG	2	8	733444	733451	50 %	25 %	25 %	0 %	384422169
13059	NC_017268	TCC	2	6	733493	733498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422169
13060	NC_017268	GCA	2	6	733562	733567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13061	NC_017268	TTCC	2	8	733572	733579	0 %	50 %	0 %	50 %	384422169
13062	NC_017268	CGT	2	6	733655	733660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13063	NC_017268	CTG	2	6	733836	733841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13064	NC_017268	T	6	6	733951	733956	0 %	100 %	0 %	0 %	384422169
13065	NC_017268	ATC	2	6	733972	733977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
13066	NC_017268	ATC	2	6	733994	733999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
13067	NC_017268	CGC	2	6	734047	734052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422169
13068	NC_017268	TAA	2	6	734076	734081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
13069	NC_017268	CGCA	2	8	734110	734117	25 %	0 %	25 %	50 %	384422169
13070	NC_017268	CTT	2	6	734130	734135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
13071	NC_017268	CAAAA	2	10	734145	734154	80 %	0 %	0 %	20 %	384422169
13072	NC_017268	CAA	2	6	734259	734264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422169
13073	NC_017268	CCCCG	2	10	734282	734291	0 %	0 %	20 %	80 %	384422169
13074	NC_017268	TAA	2	6	734325	734330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
13075	NC_017268	CAA	2	6	734355	734360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422169
13076	NC_017268	ATCC	2	8	734362	734369	25 %	25 %	0 %	50 %	384422169
13077	NC_017268	TTC	2	6	734410	734415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
13078	NC_017268	ACT	2	6	734420	734425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
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13080	NC_017268	T	6	6	734610	734615	0 %	100 %	0 %	0 %	384422169
13081	NC_017268	AGA	2	6	734617	734622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422169
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13083	NC_017268	CAG	2	6	734695	734700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13084	NC_017268	CGT	2	6	734742	734747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13085	NC_017268	ACC	2	6	734753	734758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422169
13086	NC_017268	TCAA	2	8	734786	734793	50 %	25 %	0 %	25 %	384422169
13087	NC_017268	TCT	2	6	734808	734813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
13088	NC_017268	TCA	2	6	734816	734821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422169
13089	NC_017268	GC	3	6	734881	734886	0 %	0 %	50 %	50 %	384422169
13090	NC_017268	TTC	2	6	734890	734895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422169
13091	NC_017268	CAAGA	2	10	734943	734952	60 %	0 %	20 %	20 %	384422169
13092	NC_017268	GTA	2	6	735013	735018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422169
13093	NC_017268	GGA	2	6	735040	735045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422169
13094	NC_017268	AGCA	2	8	735082	735089	50 %	0 %	25 %	25 %	384422169
13095	NC_017268	CAG	2	6	735192	735197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13096	NC_017268	AAGCGC	2	12	735247	735258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422169
13097	NC_017268	GAA	2	6	735302	735307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422169
13098	NC_017268	TCCA	2	8	735310	735317	25 %	25 %	0 %	50 %	384422169
13099	NC_017268	AAT	2	6	735324	735329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422169
13100	NC_017268	GC	3	6	735361	735366	0 %	0 %	50 %	50 %	384422169
13101	NC_017268	AGGG	2	8	735532	735539	25 %	0 %	75 %	0 %	384422170
13102	NC_017268	GTC	2	6	735562	735567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422170
13103	NC_017268	GCA	2	6	735590	735595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422170
13104	NC_017268	CA	3	6	735609	735614	50 %	0 %	0 %	50 %	384422170
13105	NC_017268	GCG	2	6	735641	735646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422170
13106	NC_017268	CG	3	6	735645	735650	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
13107	NC_017268	A	7	7	735805	735811	100 %	0 %	0 %	0 %	384422170
13108	NC_017268	GC	3	6	735851	735856	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
13109	NC_017268	CG	3	6	735917	735922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
13110	NC_017268	CG	4	8	736037	736044	0 %	0 %	50 %	50 %	384422170
13111	NC_017268	CCA	2	6	736056	736061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422170
13112	NC_017268	CTGCA	2	10	736120	736129	20 %	20 %	20 %	40 %	384422170
13113	NC_017268	CTGC	2	8	736145	736152	0 %	25 %	25 %	50 %	384422170
13114	NC_017268	CAA	2	6	736203	736208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422170
13115	NC_017268	TGCATA	2	12	736214	736225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384422170
13116	NC_017268	CGC	2	6	736273	736278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422170
13117	NC_017268	CA	3	6	736326	736331	50 %	0 %	0 %	50 %	384422170
13118	NC_017268	GCA	2	6	736356	736361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422170
13119	NC_017268	AC	3	6	736433	736438	50 %	0 %	0 %	50 %	384422170
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13121	NC_017268	AC	3	6	736489	736494	50 %	0 %	0 %	50 %	384422170
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13240	NC_017268	AG	3	6	742661	742666	50 %	0 %	50 %	0 %	384422175
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