MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 20636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017268	GCT	2	6	699396	699401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12502	NC_017268	CG	3	6	699424	699429	0 %	0 %	50 %	50 %	384422143
12503	NC_017268	CTG	2	6	699491	699496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12504	NC_017268	TCC	2	6	699516	699521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422143
12505	NC_017268	GC	3	6	699577	699582	0 %	0 %	50 %	50 %	384422143
12506	NC_017268	CTT	2	6	699599	699604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422143
12507	NC_017268	CTC	2	6	699638	699643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422143
12508	NC_017268	CAC	2	6	699651	699656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422143
12509	NC_017268	CG	3	6	699917	699922	0 %	0 %	50 %	50 %	384422143
12510	NC_017268	CTT	2	6	699934	699939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422143
12511	NC_017268	CA	3	6	699969	699974	50 %	0 %	0 %	50 %	384422143
12512	NC_017268	GAG	2	6	700001	700006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422143
12513	NC_017268	CAC	2	6	700015	700020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422143
12514	NC_017268	CCA	2	6	700068	700073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422143
12515	NC_017268	CTC	2	6	700078	700083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422143
12516	NC_017268	ACG	2	6	700230	700235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12517	NC_017268	CG	3	6	700234	700239	0 %	0 %	50 %	50 %	384422143
12518	NC_017268	GAG	2	6	700256	700261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422143
12519	NC_017268	TTGC	2	8	700382	700389	0 %	50 %	25 %	25 %	384422143
12520	NC_017268	GCT	2	6	700409	700414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12521	NC_017268	GGAC	2	8	700426	700433	25 %	0 %	50 %	25 %	384422143
12522	NC_017268	CGA	2	6	700453	700458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12523	NC_017268	TTC	2	6	700504	700509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422143
12524	NC_017268	GCA	2	6	700549	700554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422143
12525	NC_017268	AGCA	2	8	700568	700575	50 %	0 %	25 %	25 %	384422143
12526	NC_017268	AGA	2	6	700600	700605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422143
12527	NC_017268	CATG	2	8	700630	700637	25 %	25 %	25 %	25 %	384422143
12528	NC_017268	GGA	2	6	700642	700647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422143
12529	NC_017268	CGG	2	6	700717	700722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422143
12530	NC_017268	GAAC	2	8	700768	700775	50 %	0 %	25 %	25 %	384422143
12531	NC_017268	CA	3	6	700779	700784	50 %	0 %	0 %	50 %	384422143
12532	NC_017268	GCC	2	6	700820	700825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422143
12533	NC_017268	TGC	2	6	700991	700996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12534	NC_017268	GC	3	6	700998	701003	0 %	0 %	50 %	50 %	384422144
12535	NC_017268	CGT	2	6	701004	701009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12536	NC_017268	TC	3	6	701038	701043	0 %	50 %	0 %	50 %	384422144
12537	NC_017268	CTT	2	6	701106	701111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422144
12538	NC_017268	CTA	2	6	701151	701156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422144
12539	NC_017268	CCT	2	6	701245	701250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422144
12540	NC_017268	GGT	2	6	701262	701267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422144
12541	NC_017268	GT	3	6	701275	701280	0 %	50 %	50 %	0 %	384422144
12542	NC_017268	CTA	2	6	701328	701333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422144
12543	NC_017268	CAG	2	6	701337	701342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12544	NC_017268	CTT	2	6	701370	701375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422144
12545	NC_017268	CTTT	2	8	701384	701391	0 %	75 %	0 %	25 %	384422144
12546	NC_017268	AC	3	6	701393	701398	50 %	0 %	0 %	50 %	384422144
12547	NC_017268	TAC	2	6	701446	701451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422144
12548	NC_017268	CGT	2	6	701472	701477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12549	NC_017268	GTTT	2	8	701489	701496	0 %	75 %	25 %	0 %	384422144
12550	NC_017268	TTTC	2	8	701787	701794	0 %	75 %	0 %	25 %	384422144
12551	NC_017268	GC	3	6	701857	701862	0 %	0 %	50 %	50 %	384422144
12552	NC_017268	CA	3	6	701900	701905	50 %	0 %	0 %	50 %	384422144
12553	NC_017268	AGA	2	6	701910	701915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422144
12554	NC_017268	GCA	2	6	701964	701969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12555	NC_017268	ATCG	2	8	701983	701990	25 %	25 %	25 %	25 %	384422144
12556	NC_017268	GCC	2	6	702034	702039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422144
12557	NC_017268	TCC	2	6	702040	702045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422144
12558	NC_017268	CTG	2	6	702118	702123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12559	NC_017268	CTTG	2	8	702249	702256	0 %	50 %	25 %	25 %	384422144
12560	NC_017268	GTCAG	2	10	702294	702303	20 %	20 %	40 %	20 %	384422144
12561	NC_017268	AGT	2	6	702312	702317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422144
12562	NC_017268	TGC	2	6	702380	702385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12563	NC_017268	GC	3	6	702422	702427	0 %	0 %	50 %	50 %	384422144
12564	NC_017268	CAC	2	6	702465	702470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422144
12565	NC_017268	AAG	3	9	702485	702493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422144
12566	NC_017268	ACA	2	6	702608	702613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422144
12567	NC_017268	AGG	2	6	702626	702631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422144
12568	NC_017268	CAG	2	6	702669	702674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12569	NC_017268	GTC	2	6	702678	702683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422144
12570	NC_017268	AGA	2	6	702743	702748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422144
12571	NC_017268	GT	3	6	702866	702871	0 %	50 %	50 %	0 %	384422145
12572	NC_017268	GCAG	2	8	702902	702909	25 %	0 %	50 %	25 %	384422145
12573	NC_017268	TCC	2	6	702910	702915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422145
12574	NC_017268	CAA	2	6	702935	702940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422145
12575	NC_017268	CTT	2	6	702960	702965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422145
12576	NC_017268	CTGCA	2	10	703026	703035	20 %	20 %	20 %	40 %	384422145
12577	NC_017268	AGA	2	6	703085	703090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422145
12578	NC_017268	AAAC	2	8	703105	703112	75 %	0 %	0 %	25 %	384422145
12579	NC_017268	CTG	2	6	703134	703139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12580	NC_017268	CACC	2	8	703175	703182	25 %	0 %	0 %	75 %	384422145
12581	NC_017268	CACT	2	8	703184	703191	25 %	25 %	0 %	50 %	384422145
12582	NC_017268	ACCGA	2	10	703243	703252	40 %	0 %	20 %	40 %	384422145
12583	NC_017268	CA	3	6	703280	703285	50 %	0 %	0 %	50 %	384422145
12584	NC_017268	GTA	2	6	703296	703301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422145
12585	NC_017268	AT	3	6	703371	703376	50 %	50 %	0 %	0 %	384422145
12586	NC_017268	CT	3	6	703393	703398	0 %	50 %	0 %	50 %	384422145
12587	NC_017268	ATGT	2	8	703436	703443	25 %	50 %	25 %	0 %	384422145
12588	NC_017268	ACG	2	6	703448	703453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12589	NC_017268	GCG	2	6	703550	703555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422145
12590	NC_017268	AAAG	2	8	703609	703616	75 %	0 %	25 %	0 %	384422145
12591	NC_017268	A	6	6	703624	703629	100 %	0 %	0 %	0 %	384422145
12592	NC_017268	ACA	2	6	703688	703693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422145
12593	NC_017268	CA	3	6	703727	703732	50 %	0 %	0 %	50 %	384422145
12594	NC_017268	CGA	2	6	703745	703750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12595	NC_017268	CAA	2	6	703931	703936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422145
12596	NC_017268	GCA	2	6	703976	703981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12597	NC_017268	CAG	2	6	704129	704134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12598	NC_017268	AGC	2	6	704207	704212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422145
12599	NC_017268	GAA	3	9	704330	704338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422146
12600	NC_017268	CTTT	2	8	704346	704353	0 %	75 %	0 %	25 %	384422146
12601	NC_017268	CAG	2	6	704357	704362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422146
12602	NC_017268	TTG	2	6	704373	704378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422146
12603	NC_017268	AAT	2	6	704384	704389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422146
12604	NC_017268	CCG	2	6	704436	704441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422146
12605	NC_017268	CGG	2	6	704458	704463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422146
12606	NC_017268	AACA	2	8	704467	704474	75 %	0 %	0 %	25 %	384422146
12607	NC_017268	CACG	2	8	704503	704510	25 %	0 %	25 %	50 %	384422146
12608	NC_017268	GC	3	6	704552	704557	0 %	0 %	50 %	50 %	384422146
12609	NC_017268	GC	3	6	704559	704564	0 %	0 %	50 %	50 %	384422146
12610	NC_017268	CA	3	6	704613	704618	50 %	0 %	0 %	50 %	384422146
12611	NC_017268	CTG	2	6	704619	704624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422146
12612	NC_017268	CAGTA	2	10	704700	704709	40 %	20 %	20 %	20 %	384422146
12613	NC_017268	ACG	2	6	704787	704792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422146
12614	NC_017268	A	7	7	704817	704823	100 %	0 %	0 %	0 %	384422146
12615	NC_017268	GAA	2	6	704831	704836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422146
12616	NC_017268	TGA	2	6	704920	704925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422146
12617	NC_017268	GTC	2	6	705121	705126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422146
12618	NC_017268	AGA	2	6	705136	705141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422146
12619	NC_017268	GT	3	6	705255	705260	0 %	50 %	50 %	0 %	384422146
12620	NC_017268	AACAA	2	10	705327	705336	80 %	0 %	0 %	20 %	384422146
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12622	NC_017268	GTT	2	6	705368	705373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422146
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